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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G358380
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 88951714-88956107 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2897 bp · TkA05G358380|TK1151|cDNA

GACCACCTCATCACATTTCTCCAGTTCCAATTTCCAAAGCATCTTTCTTATTTTATTTCTTAAAGTCGTCTTCCCAACAGAAGCCAAGTTGGAATCTTTAAGGATCTGAATCAACAGCATAAATAAATCTCCATTAATGGTCGCTTCATATTTGAAATATCACATAACTTGTTGCTCATCTCCCAAAACTCTTGATATCTTGTTACGTAGGTTCAGATTCTTTAGAGATTGGCGATTTCTTTTAAACTCTGTTCCTGATA...

CDS

下载 CDS FASTA

1263 bp · TkA05G358380|TK1151|CDS

ATGGATTCTCGCGAGTTTGGCTTCGTGACCACATTTACAACAGAGGGAGTCGTCGGCTCGTATTTGAAGATGTATGTAGTGGACAGCAGAGGAGGAGCCATAGCATGCATGCTTCTCGCACTCTTCTTCTTAGGAACATGGCCCGCCATTCTTACTCTCTTAGAAAGACGCGGCCGACTTCCTCAACACACTTACCTCGATTACACAATCACCAATCTTTTAGCCGCTGTCATAATCGCTTTCACATTCGGAGAATTCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

420 aa · TkA05G358380|TK1151|PROTEIN

MDSREFGFVTTFTTEGVVGSYLKMYVVDSRGGAIACMLLALFFLGTWPAILTLLERRGRLPQHTYLDYTITNLLAAVIIAFTFGEFGHTNDDKPNFLIQLSENNWPSVLFAMAGGVVLSLGNLSTQYAWAFVGLSVTEVMTASITVVIGTTLNYFLDDKINRAEILFPGVACFLIAVCLGSLVHTSNAKDNQAKLDGLKGPHGSTTTSTNFSRKDVEYGSGKSEKAKAGTANFLIELESQRAIKVFGKSTLIGLAICLFA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G358380
TK1151 IDTkA05G358380
OH-1004 IDLXL04_021156
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G358380
位置Chr05:88951714-88956107 (-)
描述Similar to UPS2: Ureide permease 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g03530 质子偶联转运蛋白，运输广谱的杂环氮化合物的氧衍生物，包括尿囊素、尿酸和黄嘌呤，但不运输腺嘌呤。
UPS1 and UPS2 from Arabidopsis mediate high affinity transport of uracil and 5-fluorouracil.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m405433200
At2g03590 质子耦合转运蛋白，可转运多种杂环氮化合物的氧代衍生物，包括尿囊素、尿酸和黄嘌呤，但不包括腺嘌呤。
A novel superfamily of transporters for allantoin and other oxo derivatives of nitrogen heterocyclic compounds in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.010458
UPS1 and UPS2 from Arabidopsis mediate high affinity transport of uracil and 5-fluorouracil.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m405433200
Heterologous expression of a plant uracil transporter in yeast: improvement of plasma membrane targeting in mutants of the Rsp5p ubiquitin protein ligase.2006 · DOI: 10.1002/biot.200500034
At2g03520 质子偶联转运蛋白，可转运多种杂环氮化合物的氧代衍生物。 暂无已核实直接文献
At1g26440 质子偶联转运蛋白，运输广谱的杂环氮化合物的氧衍生物，包括尿囊素、尿酸和黄嘌呤，但不运输腺嘌呤。
Comparative studies on Ureide Permeases in Arabidopsis thaliana and analysis of two alternative splice variants of AtUPS5.2006 · DOI: 10.1007/s00425-006-0315-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021156 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0015720 allantoin transport 生物过程
GO:0015857 uracil transport 生物过程
GO:0043100 pyrimidine nucleobase salvage 生物过程
GO:0071705 nitrogen compound transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009504 cell plate 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0099503 secretory vesicle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26440
ath:AT2G03520
ath:AT2G03530
ath:AT2G03590
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.314
排名 1 · TkA05G358380 · TK1151
溶酶体／液泡0.251
排名 2 · TkA05G358380 · TK1151
内质网0.209
排名 3 · TkA05G358380 · TK1151
高尔基体0.172
排名 4 · TkA05G358380 · TK1151
细胞质0.143
排名 5 · TkA05G358380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10754DUF256936-86 aa
PF06800Sugar_transport41-190 aa
PF07168Ureide_permease64-414 aa
PF04087DUF38968-135 aa
PF07857TMEM144110-413 aa
PF10754DUF2569130-174 aa
PF04087DUF389134-197 aa
PF07784DUF1622135-159 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G358380PF10754DUF256936860.0415.1
TkA05G358380PF06800Sugar_transport411901.3e-0525.5
TkA05G358380PF07168Ureide_permease644142.1e-189629.5
TkA05G358380PF04087DUF389681350.00916.8
TkA05G358380PF07857TMEM1441104130.0003720.3
TkA05G358380PF10754DUF25691301740.0415.1
TkA05G358380PF04087DUF3891341970.00916.8
TkA05G358380PF07784DUF16221351590.2911.9
TkA05G358380PF04087DUF3892372720.00916.8
TkA05G358380PF07784DUF16222442710.2911.9
TkA05G358380PF10754DUF25692593290.0415.1
TkA05G358380PF06800Sugar_transport2953141.3e-0525.5
TkA05G358380PF04087DUF3893053990.00916.8
TkA05G358380PF06800Sugar_transport3394171.3e-0525.5
TkA05G358380PF10754DUF25693704080.0415.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQ89拟南芥sp|Q9ZQ89|UPS2_ARATH Ureide permease 276.400%Swiss-Prot高置信
Q9ZPR7拟南芥sp|Q9ZPR7|UPS1_ARATH Ureide permease 176.300%Swiss-Prot高置信
Q9ZQ88拟南芥sp|Q9ZQ88|UPS4_ARATH Ureide permease 469.300%Swiss-Prot高置信
Q93Z75拟南芥sp|Q93Z75|UPS5_ARATH Ureide permease 565.400%Swiss-Prot高置信

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