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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G347020
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 85976890-85981932 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3635 bp · TkA05G347020|TK1151|cDNA

CCGAGTCAAAGTCAAGATAGAGCAAAAAAAAACCCTCCCCAGCTAAAAATGAACACGCTTCTTCTTGTTGACAATAGAGACGACAACTACAGTACTACGACGACTTCATTCAAACACAAGTAACGACCTTCGTCCTTCTTCTACGCCATTCTCAACAAATTCCTCTCCGCCGGACGCCGCTCTTCCAACAACAGGCCGGCGTTGTTTTTATCAATTGAACCTTGAAGTTATCTCCACAAGCTCTCTGTAAATCGAGTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1860 bp · TkA05G347020|TK1151|CDS

ATGAAGAAATGGTATATCTATGTCCTATCTGCATCTCTATTAACACTAACAATCCTCGGGTACTTAGTCATTCAAAATCCAATCAGAGAATCCTACATTTCACCCCCTCCATACTTCAACACAACAAACATAAACCCACTCCAATGGATAAACTCCAACACCCCCCCTGTCCAAAACCAAACCCCCAACCCCCAAATCATCTCCAATGATGAAATAGTCTCCAGTTCCACCCTCTTCGTCCAAAGAAACCTCTCACTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

619 aa · TkA05G347020|TK1151|PROTEIN

MKKWYIYVLSASLLTLTILGYLVIQNPIRESYISPPPYFNTTNINPLQWINSNTPPVQNQTPNPQIISNDEIVSSSTLFVQRNLSLTEQQPLHTWNHLQHLISHDRVLPNTIEAIKDGGIAWNNLMATVEDEKHNNNNINSTSKKKQKQCPHFLSKMNATELNDTGYKLKVPCGLTQGSSVTFIGIPNGLLGNFRVDLTGEPLPGEPDPPVILHYNVRLHGDKVTEDPVIVQNTWTIGHDWGDEERCPAPEPDKIKKVDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G347020
TK1151 IDTkA05G347020
OH-1004 IDLXL04_021054
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G347020
位置Chr05:85976890-85981932 (+)
描述Similar to GALT1: Beta-1,3-galactosyltransferase GALT1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g26810 Beta-1,3-半乳糖基转移酶，可将半乳糖从 UDP-半乳糖转移至带有末端 β-N-乙酰葡糖胺 残基的底物。
A unique beta1,3-galactosyltransferase is indispensable for the biosynthesis of N-glycans containing Lewis a structures in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.052985
At3g06440 具有羟脯氨酸 O-半乳糖基转移酶活性。
A small multigene hydroxyproline-O-galactosyltransferase family functions in arabinogalactan-protein glycosylation, growth and development in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1186/s12870-015-0670-7
At1g74800 具有羟脯氨酸 O-半乳糖基转移酶活性。
Two Hydroxyproline Galactosyltransferases, GALT5 and GALT2, Function in Arabinogalactan-Protein Glycosylation, Growth and Development in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1371/journal.pone.0125624
A small multigene hydroxyproline-O-galactosyltransferase family functions in arabinogalactan-protein glycosylation, growth and development in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1186/s12870-015-0670-7
At5g62620 具有羟脯氨酸 O-半乳糖基转移酶活性。
A small multigene hydroxyproline-O-galactosyltransferase family functions in arabinogalactan-protein glycosylation, growth and development in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1186/s12870-015-0670-7
At1g27120 具有羟脯氨酸 O-半乳糖基转移酶活性。
A small multigene hydroxyproline-O-galactosyltransferase family functions in arabinogalactan-protein glycosylation, growth and development in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1186/s12870-015-0670-7

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021054 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010405 arabinogalactan protein metabolic process 生物过程
GO:0010493 Lewis a epitope biosynthetic process 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0180062 protein O-linked glycosylation via galactose 生物过程
GO:1900056 negative regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26810
ath:AT1G27120
ath:AT1G74800
ath:AT3G06440
ath:AT5G62620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.594
排名 1 · TkA05G347020 · TK1151
细胞膜0.111
排名 2 · TkA05G347020 · TK1151
细胞外0.077
排名 3 · TkA05G347020 · TK1151
内质网0.076
排名 4 · TkA05G347020 · TK1151
细胞质0.071
排名 5 · TkA05G347020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00337Gal-bind_lectin167-338 aa
PF01762Galactosyl_T383-567 aa
PF08109Antimicrobial14541-549 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G347020PF00337Gal-bind_lectin1673381.1e-2693.6
TkA05G347020PF01762Galactosyl_T3835671.4e-40139.9
TkA05G347020PF08109Antimicrobial145415490.2911.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7F9拟南芥sp|Q8L7F9|B3GTF_ARATH Beta-1,3-galactosyltransferase GALT160.700%Swiss-Prot高置信
Q9ASW1拟南芥sp|Q9ASW1|B3GTG_ARATH Hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT346.100%Swiss-Prot中等置信
Q8RX55拟南芥sp|Q8RX55|B3GTI_ARATH Hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT538.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LV16拟南芥sp|Q9LV16|B3GTJ_ARATH Hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT637.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GXG6拟南芥sp|Q8GXG6|B3GTH_ARATH Hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT436.300%Swiss-Prot中等置信

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