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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G346200
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 85830285-85830896 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

582 bp · TkA05G346200|TK1151|cDNA

ATGGACCTAAAACATACAACGTCCGCCGCCACGGATAGCCCAGATTCTGATAGTGAAACCCCTCTTCATTCCCAACTGATCAAGCCATTTTCGTCATTTCCTAGTGCAAAGAGCTACAACCACCACCGCGAGTCACCGCCTACGGTGGTTGCTTACAAAGAATGTCTTAAGAACCATGCTGTCACCATCGGCAGCCACGCCTTGGACGGCTGCGGTGAGTTTATGCCGGCACCAAGTCGCACTCCACCAGAACCCACCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

582 bp · TkA05G346200|TK1151|CDS

ATGGACCTAAAACATACAACGTCCGCCGCCACGGATAGCCCAGATTCTGATAGTGAAACCCCTCTTCATTCCCAACTGATCAAGCCATTTTCGTCATTTCCTAGTGCAAAGAGCTACAACCACCACCGCGAGTCACCGCCTACGGTGGTTGCTTACAAAGAATGTCTTAAGAACCATGCTGTCACCATCGGCAGCCACGCCTTGGACGGCTGCGGTGAGTTTATGCCGGCACCAAGTCGCACTCCACCAGAACCCACCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

193 aa · TkA05G346200|TK1151|PROTEIN

MDLKHTTSAATDSPDSDSETPLHSQLIKPFSSFPSAKSYNHHRESPPTVVAYKECLKNHAVTIGSHALDGCGEFMPAPSRTPPEPTSLKCAACGCHRNFHRRERNKTHFSDFHHPSSPPQPTNYAYAPHVLLSLGTADQNHAVATPGHRQRSGLKTQMGGRGSGQNSAKNRRKRCRFSQRKWGGRCSDVMTKW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G346200
TK1151 IDTkA05G346200
OH-1004 IDLXL04_025163
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)51.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 70.984 / OH-1004 58.491
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G346200
位置Chr05:85830285-85830896 (-)
描述Similar to ZHD9: Zinc-finger homeodomain protein 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28920 推测的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g15210 推测的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g69600 参与上调多种应激诱导基因的转录因子。
Co-expression of the stress-inducible zinc finger homeodomain ZFHD1 and NAC transcription factors enhances expression of the ERD1 gene in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02932.x
At5g39760 推测的转录因子。
ATHB23, an Arabidopsis class I homeodomain-leucine zipper gene, is expressed in the adaxial region of young leaves.2007 · DOI: 10.1007/s00299-007-0340-9
At5g60480 推测的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025163 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69600
ath:AT2G02540
ath:AT3G28920
ath:AT4G24660
ath:AT5G15210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.618
排名 1 · TkA05G346200 · TK1151
细胞质0.321
排名 2 · TkA05G346200 · TK1151
线粒体0.086
排名 3 · TkA05G346200 · TK1151
细胞膜0.045
排名 4 · TkA05G346200 · TK1151
内质网0.031
排名 5 · TkA05G346200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04770ZF-HD_dimer50-104 aa
PF04770ZF-HD_dimer139-148 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G346200PF04770ZF-HD_dimer501044.5e-2898.0
TkA05G346200PF04770ZF-HD_dimer1391484.5e-2898.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHF0拟南芥sp|Q9LHF0|ZHD9_ARATH Zinc-finger homeodomain protein 961.500%Swiss-Prot低置信
Q9LXG0拟南芥sp|Q9LXG0|ZHD8_ARATH Zinc-finger homeodomain protein 857.000%Swiss-Prot低置信
Q9SEZ1拟南芥sp|Q9SEZ1|ZHD11_ARATH Zinc-finger homeodomain protein 1145.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FIW9拟南芥sp|Q9FIW9|ZHD10_ARATH Zinc-finger homeodomain protein 1059.500%Swiss-Prot低置信
Q9FKJ9拟南芥sp|Q9FKJ9|ZHD12_ARATH Zinc-finger homeodomain protein 1255.700%Swiss-Prot低置信

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