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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G336990
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 83296883-83300279 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2890 bp · TkA05G336990|TK1151|cDNA

TCCCCATAACAATTCCGTGATCGATCGCCTAATCTTGTCCATCATAAGAGTGCATCGTCTTGGCTAATCATAGATCATTAGGAAATGGATTAATTAACAAGGTTCTCCAACCTGTAAATTTTCATCTTGATCATCATTCTATCAATATTAAATTGTATGGAATTGATTGAGAAATCGTTTAATGTGCCCAATAACTCTCAACATCCACAACCATCTCCGGCACAGATCCACCGTGAGTCACCTTCACCGTTCCTCTCCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2277 bp · TkA05G336990|TK1151|CDS

ATGTCGATACCTGATGGAGAATTCTCGTCGTCGAATGCCGGCGACCTAGATTTCGGTCAGGAGGTAACGCTTGGTGATAAGCTTAAAGCCTTCAAATCTTCTGGTTTCGATCAGGAAAGTTATGTATCTGCCAAATGCCGCACAACAAGCGAAAAGGAAATAAAGCACTTGGTGACTTGTCTTCTAGATCTCAAGAAGGCGTCGGCAGAAGAAATGCGAAAAAGTGTGTACGCTAATTACCCTTCCTTTATCCGCGTATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

758 aa · TkA05G336990|TK1151|PROTEIN

MSIPDGEFSSSNAGDLDFGQEVTLGDKLKAFKSSGFDQESYVSAKCRTTSEKEIKHLVTCLLDLKKASAEEMRKSVYANYPSFIRVSREISDLEGQLVALRNLLSNRAAIIHTLAEGTRSESTSSGPGSRKQGSFDLEDREPTKMEVWLSQYIDKLNILLAERRVDEALTALTEGERVAKEEKSNDSMTPEILSSLQDTITEQRQKLADQLAESACQPSSSGTELRSSVEIIKKIGDGPRAHTLLLNSHHQKLQSKIQGL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G336990
TK1151 IDTkA05G336990
OH-1004 IDLXL04_020984
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G336990
位置Chr05:83296883-83300279 (+)
描述Similar to EXO84A: Exocyst complex component EXO84A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10385 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献
At5g49830 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。
The Arabidopsis exocyst complex is involved in cytokinesis and cell plate maturation.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.074351
A Framework for Lateral Membrane Trafficking and Polar Tethering of the PEN3 ATP-Binding Cassette Transporter.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.01252
At1g10180 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020984 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程
GO:0008104 intracellular protein localization 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0060321 acceptance of pollen 生物过程
GO:0000145 exocyst 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005776 autophagosome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10180
ath:AT1G10385
ath:AT5G49830
cnb:CNBH1990
ddi:DDB_G0279991
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.583
排名 1 · TkA05G336990 · TK1151
高尔基体0.250
排名 2 · TkA05G336990 · TK1151
细胞膜0.196
排名 3 · TkA05G336990 · TK1151
细胞核0.189
排名 4 · TkA05G336990 · TK1151
溶酶体／液泡0.174
排名 5 · TkA05G336990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17175MOLO121-69 aa
PF06148COG2_N30-100 aa
PF08700VPS51_Exo84_N31-106 aa
PF16528Exo84_C90-114 aa
PF16528Exo84_C148-356 aa
PF16752TBCC_N178-261 aa
PF08700VPS51_Exo84_N192-209 aa
PF17175MOLO1193-258 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G336990PF17175MOLO121690.7210.8
TkA05G336990PF06148COG2_N301000.000222.1
TkA05G336990PF08700VPS51_Exo84_N311064.7e-1143.3
TkA05G336990PF16528Exo84_C901143e-2073.6
TkA05G336990PF16528Exo84_C1483563e-2073.6
TkA05G336990PF16752TBCC_N1782610.1413.2
TkA05G336990PF08700VPS51_Exo84_N1922094.7e-1143.3
TkA05G336990PF17175MOLO11932580.7210.8
TkA05G336990PF08700VPS51_Exo84_N2482624.7e-1143.3
TkA05G336990PF27696EXO84_helical3905597e-53179.6
TkA05G336990PF17175MOLO15335620.7210.8
TkA05G336990PF06148COG2_N5435570.000222.1
TkA05G336990PF029497tm_65586190.1811.5
TkA05G336990PF07759DUF16156777420.1811.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I4B6拟南芥sp|F4I4B6|EX84A_ARATH Exocyst complex component EXO84A57.300%Swiss-Prot高置信
Q9LTB0拟南芥sp|Q9LTB0|EX84B_ARATH Exocyst complex component EXO84B56.300%Swiss-Prot高置信
Q9SY60拟南芥sp|Q9SY60|EX84C_ARATH Exocyst complex component EXO84C32.400%Swiss-Prot中等置信

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