TkA05G251510 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G251510

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 62512918-62516184 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2375 bp · TkA05G251510|TK1151|cDNA

TAACCATGGTTAGGTTAGCCGTTATTTAAATTTGAAGTTGGGTTAGGGTTAAATAAAAATTGTAGTCGACCTTCAAAAACTTAATAGGATAGAAGTATTATATGATAATTTTGGGGATTTCTTTAGGTTCGAGTGAGAACATAGGGGCTAAAAGCACAAAATATTTCATCGGAGGCTCGTATATTGTGCCCTGCTGGTAAATCAAAATCAACCGAGTTTTTCGCTTTTTGGTGAAAATCTTTGAAAGCAGAATGGAGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

969 bp · TkA05G251510|TK1151|CDS

ATGGCGCATTTAAATATATTTTCAGAAGCATGGAGTCTTTTATCCGATAAATCAAGAAGAAAAGCATATGACCAAAAGAGAAACACCAACACTACTACAAATAATGCTTCTAAAAATGGTTTCTACAATTTCACAAGAAAGGAAACAAGCCCTAAAACCACACCACAACCGAATTTAAAAACATTTTGGACCGTATGCCATGGATGCAAGATGCAATACGAGTATTTACGAATGTACCTTCACCAAAATCTTTTATGCCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

322 aa · TkA05G251510|TK1151|PROTEIN

MAHLNIFSEAWSLLSDKSRRKAYDQKRNTNTTTNNASKNGFYNFTRKETSPKTTPQPNLKTFWTVCHGCKMQYEYLRMYLHQNLLCPNCHEPFLAMETPAPNTKVSTKGLKTSKLAAKNQGGRYNKKGELVGESSNNYTWGPFSKTTTPASSAQAATMVQRAYEKVKREREEAQAAIKREEALKRKRKRSGGLVDVGIVRKGDIRSILVHKARTEIKKRLTRLKSETVVNYKVDQEQEQEQDQEQEQEQEPPLMINVPDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G251510`
TK1151 ID	TkA05G251510
OH-1004 ID	LXL04_020599
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 95.652 / OH-1004 50.993 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA05G251510`
位置	Chr05:62512918-62516184 (-)
描述	Similar to dnajb14: DnaJ homolog subfamily B member 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_020599` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0065003 protein-containing complex assembly 生物过程 GO:0071218 cellular response to misfolded protein 生物过程 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分 GO:0030544 Hsp70 protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	bta:538849 hsa:79982 mmu:70604 xla:380336 xtr:549342 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.923

排名 1 · TkA05G251510 · TK1151

细胞质0.122

排名 2 · TkA05G251510 · TK1151

细胞膜0.033

排名 3 · TkA05G251510 · TK1151

内质网0.020

排名 4 · TkA05G251510 · TK1151

线粒体0.011

排名 5 · TkA05G251510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12358DUF364420-61 aa

PF23551Zn_ribbon_2062-95 aa

PF30548DciA_cyano_C63-72 aa

PF24445DUF756464-104 aa

PF14369Zn_ribbon_1966-94 aa

PF08274Zn_Ribbon_YjdM66-91 aa

PF30548DciA_cyano_C79-94 aa

PF24014DUF7328160-188 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G251510	`PF12358`	DUF3644	20	61	0.017	15.5
TkA05G251510	`PF23551`	Zn_ribbon_20	62	95	1.4e-18	67.3
TkA05G251510	`PF30548`	DciA_cyano_C	63	72	0.24	11.7
TkA05G251510	`PF24445`	DUF7564	64	104	0.2	12.8
TkA05G251510	`PF14369`	Zn_ribbon_19	66	94	0.12	13.2
TkA05G251510	`PF08274`	Zn_Ribbon_YjdM	66	91	0.15	12.8
TkA05G251510	`PF30548`	DciA_cyano_C	79	94	0.24	11.7
TkA05G251510	`PF24014`	DUF7328	160	188	1.4	10.1
TkA05G251510	`PF12358`	DUF3644	163	265	0.017	15.5
TkA05G251510	`PF04625`	DEC-1_N	218	269	0.13	12.0
TkA05G251510	`PF24445`	DUF7564	240	240	0.2	12.8
TkA05G251510	`PF11926`	DUF3444	254	315	3.2e-21	76.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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