TkA05G154780 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G154780

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 40085523-40087229 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1521 bp · TkA05G154780|TK1151|cDNA

ATGATGACGAACCAACGGAGCAAACCACCACCACCGTTATCACTACCTGAGACTGAAGTGAACAATGGAGGTAGAATGAACTCGAATTCAAACCAGGATGGAACACAAACGGAAGTCCAACGTCGTCTAAAAGGACTGACGGCTGAGATGCATCTAGGTCAACTCAGAAATGGGCCTAACACAAAAACTTGGGCCAAAATTAGTATGTTGGGCTCACTTCAAACAGATCGTCCAATGGATTCTGTAAAAGCATTAACCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1521 bp · TkA05G154780|TK1151|CDS

ATGATGACGAACCAACGGAGCAAACCACCACCACCGTTATCACTACCTGAGACTGAAGTGAACAATGGAGGTAGAATGAACTCGAATTCAAACCAGGATGGAACACAAACGGAAGTCCAACGTCGTCTAAAAGGACTGACGGCTGAGATGCATCTAGGTCAACTCAGAAATGGGCCTAACACAAAAACTTGGGCCAAAATTAGTATGTTGGGCTCACTTCAAACAGATCGTCCAATGGATTCTGTAAAAGCATTAACCCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

506 aa · TkA05G154780|TK1151|PROTEIN

MMTNQRSKPPPPLSLPETEVNNGGRMNSNSNQDGTQTEVQRRLKGLTAEMHLGQLRNGPNTKTWAKISMLGSLQTDRPMDSVKALTRVQLNQRLLAHAFHPYRSPLMTYFSRVATIIFLPATALVPRASASNLLIRASPRTLAILHRLGVAVGYVVALIAPSAKDQLAHSIPQKTTMARSLKFAPTPSLLHINSHLVTRMEFSLNQKQIMHNYFLRLSQNPTQHTGDSSSSLPEFDFTSFIQDKDTKIKFTEAITKRITK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G154780`
TK1151 ID	TkA05G154780
OH-1004 ID	LXL04_016882
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	67.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 92.885 / OH-1004 46.621 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G154780

位置 Chr05:40085523-40087229 (-)

描述 Similar to HSP81-3: Heat shock protein 81-3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g56030`	分子伴侣。	暂无已核实直接文献
`At5g56010`	作为一种保持分子伴侣（holdase），稳定折叠中的蛋白质中间体，并在应激消退后迅速释放它们以活性形式存在。	暂无已核实直接文献
`At5g56000`	分子伴侣，稳定展开的蛋白中间体，并作为折叠分子伴侣辅助蛋白在 ATP 依赖方式下的非共价折叠。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: A2YWQ1`	分子伴侣，促进特定靶蛋白的成熟、结构维护和适当调控，例如涉及细胞周期控制和信号转导。	暂无已核实直接文献
`Os08g0500700`	分子伴侣，促进特定靶蛋白的成熟、结构维护和适当调控，例如涉及细胞周期控制和信号转导。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016882 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0034605 cellular response to heat 生物过程

GO:0050821 protein stabilization 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分

GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0051082 unfolded protein binding 分子功能

GO:0140662 ATP-dependent protein folding chaperone 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os08g0500700

dosa:Os09g0482100

ini:109146489

osa:9267802

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.324

排名 1 · TkA05G154780 · TK1151

细胞质0.304

排名 2 · TkA05G154780 · TK1151

线粒体0.281

排名 3 · TkA05G154780 · TK1151

细胞膜0.079

排名 4 · TkA05G154780 · TK1151

内质网0.055

排名 5 · TkA05G154780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13257DUF4048332-387 aa

PF00183HSP90358-504 aa

PF11258DUF3048402-452 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G154780	`PF13257`	DUF4048	332	387	0.13	12.8
TkA05G154780	`PF00183`	HSP90	358	504	3.4e-25	89.7
TkA05G154780	`PF11258`	DUF3048	402	452	0.28	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P55737`	拟南芥	sp\|P55737\|HS902_ARATH Heat shock protein 90-2	53.300%	Swiss-Prot	低置信
`P51818`	拟南芥	sp\|P51818\|HS903_ARATH Heat shock protein 90-3	53.300%	Swiss-Prot	低置信
`O03986`	拟南芥	sp\|O03986\|HS904_ARATH Heat shock protein 90-4	52.000%	Swiss-Prot	低置信
`A2YWQ1`	水稻	sp\|A2YWQ1\|HSP81_ORYSI Heat shock protein 81-1	50.000%	Swiss-Prot	低置信
`Q0J4P2`	水稻	sp\|Q0J4P2\|HSP81_ORYSJ Heat shock protein 81-1	50.000%	Swiss-Prot	低置信

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