TkA05G130670 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G130670

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 34218343-34220133 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1791 bp · TkA05G130670|TK1151|cDNA

ATGGCTTTGGCGGAATCACCGGATGTTGGTCACCGGAAAACCCGATACACAATAAAAGCAAAGGGTGTTTCATATGCTGTATCTGGGACATCTAGTAAATTTGGCGGGCTTTTTCATAAAAAGGTGAATCCCGCCTTAAAGAAGCAGATTCTTACAGACGTCAATTGCGAAGTCAGACCAGGAGAAATCACGGCAATTGCTGGTCCAAGTGGCGCCGGAAAGACGACACTGCTCGAGGTTCTCGCCGGAGTTATCCCTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1791 bp · TkA05G130670|TK1151|CDS

ATGGCTTTGGCGGAATCACCGGATGTTGGTCACCGGAAAACCCGATACACAATAAAAGCAAAGGGTGTTTCATATGCTGTATCTGGGACATCTAGTAAATTTGGCGGGCTTTTTCATAAAAAGGTGAATCCCGCCTTAAAGAAGCAGATTCTTACAGACGTCAATTGCGAAGTCAGACCAGGAGAAATCACGGCAATTGCTGGTCCAAGTGGCGCCGGAAAGACGACACTGCTCGAGGTTCTCGCCGGAGTTATCCCTCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

596 aa · TkA05G130670|TK1151|PROTEIN

MALAESPDVGHRKTRYTIKAKGVSYAVSGTSSKFGGLFHKKVNPALKKQILTDVNCEVRPGEITAIAGPSGAGKTTLLEVLAGVIPPCRVSGHVLVNDRPMIPTVFRRVSGYVTQEDLLFPLLTVEETLLYSARLRLHGGLGNSRARVQELLEELGLRHVAGERIGGGSNRGISGGEKRRVSIGVDLVHDPSVLLMDEPTSGLDSGAAFQVISMLKSMAQNHQKTIVLTIHQPGFRILELFDQIMLLAEGSVVHHGSLDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G130670`
TK1151 ID	TkA05G130670
OH-1004 ID	LXL04_016595
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	58.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G130670

位置 Chr05:34218343-34220133 (-)

描述 Similar to ABCG10: ABC transporter G family member 10

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g53270`	ABC 转运蛋白 G 家族成员 10。	暂无已核实直接文献
`At2g13610`	ABC 转运蛋白 G 家族成员 5。	暂无已核实直接文献
`At4g25750`	ABC 转运蛋白 G 家族成员 4。	暂无已核实直接文献
`At5g52860`	ABC 转运蛋白 G 家族成员 8。	暂无已核实直接文献
`At5g19410`	ABC 转运蛋白 G 家族成员 23。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016595 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G53270

ath:AT2G13610

ath:AT4G25750

ath:AT5G19410

ath:AT5G52860

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.354

排名 1 · TkA05G130670 · TK1151

溶酶体／液泡0.248

排名 2 · TkA05G130670 · TK1151

内质网0.191

排名 3 · TkA05G130670 · TK1151

细胞质0.159

排名 4 · TkA05G130670 · TK1151

高尔基体0.131

排名 5 · TkA05G130670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03215Rad1739-83 aa

PF00005ABC_tran51-201 aa

PF13191AAA_1655-82 aa

PF13555AAA_2956-85 aa

PF03193RsgA_GTPase56-83 aa

PF20703nSTAND157-89 aa

PF25199nSTAND_NTPase557-82 aa

PF13481AAA_2560-82 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G130670	`PF03215`	Rad17	39	83	0.015	16.0
TkA05G130670	`PF00005`	ABC_tran	51	201	4.6e-30	105.7
TkA05G130670	`PF13191`	AAA_16	55	82	0.075	14.3
TkA05G130670	`PF13555`	AAA_29	56	85	0.0024	18.3
TkA05G130670	`PF03193`	RsgA_GTPase	56	83	0.019	15.5
TkA05G130670	`PF20703`	nSTAND1	57	89	0.029	14.7
TkA05G130670	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	57	82	0.32	11.5
TkA05G130670	`PF13481`	AAA_25	60	82	0.024	15.0
TkA05G130670	`PF02463`	SMC_N	62	81	0.0014	18.9
TkA05G130670	`PF13476`	AAA_23	62	82	0.0029	19.0
TkA05G130670	`PF13166`	AAA_13	62	83	0.013	15.0
TkA05G130670	`PF13401`	AAA_22	62	82	0.077	14.0
TkA05G130670	`PF13604`	AAA_30	62	84	0.14	12.6
TkA05G130670	`PF13304`	AAA_21	63	84	3.9e-07	31.0
TkA05G130670	`PF02492`	cobW	63	82	0.14	12.5
TkA05G130670	`PF00004`	AAA	66	153	0.13	13.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9MAH4`	拟南芥	sp\|Q9MAH4\|AB10G_ARATH ABC transporter G family member 10	54.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SIT6`	拟南芥	sp\|Q9SIT6\|AB5G_ARATH ABC transporter G family member 5	49.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SW08`	拟南芥	sp\|Q9SW08\|AB4G_ARATH ABC transporter G family member 4	43.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FLX5`	拟南芥	sp\|Q9FLX5\|AB8G_ARATH ABC transporter G family member 8	43.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3E9B8`	拟南芥	sp\|Q3E9B8\|AB23G_ARATH ABC transporter G family member 23	40.500%	Swiss-Prot	中等置信

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