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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G100670
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 27078858-27081480 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2021 bp · TkA05G100670|TK1151|cDNA

CTCTTGTATATGTAATATACAATTAACAATTACATTGTTCATTCTTGACTAAAAATAGTCAACAATATATTTGAATTTTTTTTTGGCGGAGAACGTAAAAAAGATGGACCATCATCTGCATGATCCTTGGAATCTATTAATAGCAAAAGCTATGAATTTCTTTTCAAATAGACACTAGACATATTACCGTTAACATACTCTTCCAATCACTAAACCCTCATCTTCTTGATCCTTCAAGAACACGTAAACAAGGCAATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1461 bp · TkA05G100670|TK1151|CDS

ATGTGGACGAACAAAGACTCGGCCAATTCAACTCCAAGAGGATTTCCGTTCTCCACACCTCAGCCGGAGAAGAAGCGAACCTATTCTTCTCCGCCATACCCGATTCGCCAACCACCACTTCCGTCGTCAGAGAAGAAATGGACGCCACCGCAATCTAGTAACACTAATAGTCTCTTCCATGTCATCCACAAAGTCCCCGCCGGTGATTCTCCATACGTCAGAGCCAAACATGTTCAGTTAGTGGACAACAATCCAAGCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

486 aa · TkA05G100670|TK1151|PROTEIN

MWTNKDSANSTPRGFPFSTPQPEKKRTYSSPPYPIRQPPLPSSEKKWTPPQSSNTNSLFHVIHKVPAGDSPYVRAKHVQLVDNNPSKAVSMFWAAINSGDRVDSALKDMAVVMKQLNRSDEAIEAIKSFRHLCPLDAQESLDNILLELYKRSGRIDEQIELLELKLKHIEEATCVNGNRTKLARSQGKKIQITMGQEYSRLLGNLAWAHLQQDNYKLAEEIYRKALSLEPDKNKRCNLAICLMYMDKMTEAKFLLSTVKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G100670
TK1151 IDTkA05G100670
OH-1004 IDLXL04_019885
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.794 / OH-1004 88.991
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G100670
位置Chr05:27078858-27081480 (-)
描述Similar to MS5: Protein POLLENLESS 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g20900 对男性生育力至关重要，尤其是对于微孢子和花粉颗粒的产生。
Meiotic progression in Arabidopsis is governed by complex regulatory interactions between SMG7, TDM1, and the meiosis I-specific cyclin TAM.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.078378
At3g51280 可能参与细胞分裂的调控。 暂无已核实直接文献
At5g48850 参与缺硫条件下储存硫酸盐的利用。
A sulphur deficiency-induced gene, sdi1, involved in the utilization of stored sulphate pools under sulphur-limiting conditions has potential as a diagnostic indicator of sulphur nutritional status.2009 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2008.00391.x
At5g44330 可能参与细胞分裂的调控。 暂无已核实直接文献
At1g04770 参与在硫缺乏条件下利用储存的硫酸盐。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019885 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006792 regulation of sulfur utilization 生物过程
GO:0007140 male meiotic nuclear division 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0010438 cellular response to sulfur starvation 生物过程
GO:0010439 regulation of glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051321 meiotic cell cycle 生物过程
GO:0000932 P-body 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0017053 transcription repressor complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04770
ath:AT3G51280
ath:AT4G20900
ath:AT5G44330
ath:AT5G48850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.410
排名 1 · TkA05G100670 · TK1151
细胞核0.337
排名 2 · TkA05G100670 · TK1151
细胞膜0.172
排名 3 · TkA05G100670 · TK1151
质体0.133
排名 4 · TkA05G100670 · TK1151
内质网0.071
排名 5 · TkA05G100670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25068ARM_TT21_4th86-226 aa
PF30153TPR_YpiA_C87-136 aa
PF13424TPR_1299-125 aa
PF14559TPR_19104-127 aa
PF07719TPR_2105-127 aa
PF13428TPR_14105-137 aa
PF13431TPR_17105-124 aa
PF00515TPR_1106-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G100670PF25068ARM_TT21_4th862260.08513.8
TkA05G100670PF30153TPR_YpiA_C871360.1813.2
TkA05G100670PF13424TPR_12991251.6e-0628.9
TkA05G100670PF14559TPR_191041272.1e-0628.7
TkA05G100670PF07719TPR_21051271.1e-0835.3
TkA05G100670PF13428TPR_141051373.8e-0730.9
TkA05G100670PF13431TPR_171051241.510.0
TkA05G100670PF00515TPR_11061258.8e-1038.7
TkA05G100670PF13176TPR_71071250.0004920.7
TkA05G100670PF13174TPR_61091310.001220.0
TkA05G100670PF12895ANAPC31091270.00318.6
TkA05G100670PF29407CFAP70_TPR_C1091640.006616.7
TkA05G100670PF07721TPR_41091220.2312.9
TkA05G100670PF13181TPR_81141271.9e-0731.4
TkA05G100670PF13432TPR_161161300.01216.7
TkA05G100670PF29386CFAP70_mid_TPR1181320.1912.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUC3拟南芥sp|Q9SUC3|MS5_ARATH Protein POLLENLESS 345.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SD20拟南芥sp|Q9SD20|MS5L2_ARATH Protein POLLENLESS 3-LIKE 258.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GXU5拟南芥sp|Q8GXU5|SDI1_ARATH Protein SULFUR DEFICIENCY-INDUCED 161.100%Swiss-Prot低置信
Q9FKV5拟南芥sp|Q9FKV5|MS5L1_ARATH Protein POLLENLESS 3-LIKE 156.200%Swiss-Prot中等置信
Q8L730拟南芥sp|Q8L730|SDI2_ARATH Protein SULFUR DEFICIENCY-INDUCED 255.600%Swiss-Prot低置信

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