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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G046210
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 12186263-12192390 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2742 bp · TkA05G046210|TK1151|cDNA

TTGGAACATAGTTTCTCCGCCGGATAAGAGCAAACTTCCCTTATAAATAGCCATCTACAAAATACATCAGATCATTTAACCTTCCCTCAAACGCAAGACATCTGGAAAATGGCGAAGAAGTACGAGCAGTTCAGATGCCAACCGAGACTACCGAAATTCGCTATCCCCAAACGGTACGATCTTAAGCTCATACCAGACCTCATCTTCTGCAAGTTTTCAGGAACCGTCGAGATCTCTATCGACATCGTCTCCGATACCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2610 bp · TkA05G046210|TK1151|CDS

ATGGCGAAGAAGTACGAGCAGTTCAGATGCCAACCGAGACTACCGAAATTCGCTATCCCCAAACGGTACGATCTTAAGCTCATACCAGACCTCATCTTCTGCAAGTTTTCAGGAACCGTCGAGATCTCTATCGACATCGTCTCCGATACCAAGTTCATTGTCCTCAATGCCGCAGACCTCTCCATAGATTCCAAATCTGTTCGATTTCAATCGAAAAGTGATTCAAAGGAACTTGCGGCTTTGCAAGTAGAATTTTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

869 aa · TkA05G046210|TK1151|PROTEIN

MAKKYEQFRCQPRLPKFAIPKRYDLKLIPDLIFCKFSGTVEISIDIVSDTKFIVLNAADLSIDSKSVRFQSKSDSKELAALQVEFFEDDEILVLEFAEILPLGLAVVHIGFEGTLNDQMKGFYRSSYEHNGEKKNMAVTQFEPADARRCFPCWDEPACKATFKITLEVPSELVALSNMPVLDEKIDGKTKIVQYQESPIMSTYLVAAVVGLFDYVEDHTPDGIKVRVYCQVGKANQGKFALDVAVKTLSLYKDYFETPYS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G046210
TK1151 IDTkA05G046210
OH-1004 IDLXL04_026510
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 49.137 / OH-1004 71.846
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G046210
位置Chr05:12186263-12192390 (+)
描述Similar to APM1: Aminopeptidase M1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33090 与生长素转运抑制剂 N-1-萘基邻苯二甲酸 结合的金属肽酶。
Identification, purification, and molecular cloning of N-1-naphthylphthalmic acid-binding plasma membrane-associated aminopeptidases from Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010519
Mutation of the membrane-associated M1 protease APM1 results in distinct embryonic and seedling developmental defects in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.059634
The catalytic and protein-protein interaction domains are required for APM1 function.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.148742
Cytoplasm localization of aminopeptidase M1 and its functional activity in root hair cells and BY-2 cells.2012 · DOI: 10.1007/s11033-012-1896-1

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0218200 氨基肽酶M1-A。 暂无已核实直接文献
Os08g0398700 氨肽酶 M1-B。 暂无已核实直接文献
Os09g0362500 氨肽酶 M1-C。 暂无已核实直接文献
Os09g0362800 氨肽酶M1-D。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026510 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009926 auxin polar transport 生物过程
GO:0043171 peptide catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004177 aminopeptidase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0010013 N-1-naphthylphthalamic acid binding 分子功能
GO:0016285 alanyl aminopeptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33090
dosa:Os02g0218200
dosa:Os08g0398700
dosa:Os09g0362500
dosa:Os09g0362800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.657
排名 1 · TkA05G046210 · TK1151
细胞核0.215
排名 2 · TkA05G046210 · TK1151
线粒体0.090
排名 3 · TkA05G046210 · TK1151
过氧化物酶体0.074
排名 4 · TkA05G046210 · TK1151
内质网0.071
排名 5 · TkA05G046210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17900Peptidase_M1_N20-204 aa
PF27010DUF833072-122 aa
PF11838ERAP1_C115-129 aa
PF01433Peptidase_M1239-455 aa
PF04450BSP296-352 aa
PF27010DUF8330386-437 aa
PF25599Ephrin_CRD484-498 aa
PF17900Peptidase_M1_N512-542 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G046210PF17900Peptidase_M1_N202042.1e-50172.1
TkA05G046210PF27010DUF8330721220.09813.6
TkA05G046210PF11838ERAP1_C1151291.5e-87294.7
TkA05G046210PF01433Peptidase_M12394552.1e-89299.6
TkA05G046210PF04450BSP2963520.03814.5
TkA05G046210PF27010DUF83303864370.09813.6
TkA05G046210PF25599Ephrin_CRD4844980.1413.0
TkA05G046210PF17900Peptidase_M1_N5125422.1e-50172.1
TkA05G046210PF11838ERAP1_C5258421.5e-87294.7
TkA05G046210PF27010DUF83307177330.09813.6
TkA05G046210PF17900Peptidase_M1_N8288492.1e-50172.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZH2拟南芥sp|Q8VZH2|APM1_ARATH Aminopeptidase M172.500%Swiss-Prot高置信
Q6Z6L4水稻sp|Q6Z6L4|APM1A_ORYSJ Aminopeptidase M1-A61.900%Swiss-Prot高置信
Q0J5V5水稻sp|Q0J5V5|APM1B_ORYSJ Aminopeptidase M1-B61.400%Swiss-Prot高置信
Q0J2B5水稻sp|Q0J2B5|APM1C_ORYSJ Aminopeptidase M1-C59.400%Swiss-Prot高置信
Q6K4E7水稻sp|Q6K4E7|APM1D_ORYSJ Aminopeptidase M1-D58.800%Swiss-Prot高置信

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