基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G016630
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 4681952-4682914
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA522 bp · TkA05G016630|TK1151|cDNA
ACAGGTGAAGGTAGTGAAGTCAACGCTCCGTATTCAGATCTGAAAAGAATTCATGGGATTTTAAATGCGGTTGGATGGGGTATATTACTCCCCATAGGTGCTATGGTTGCTCGTTACTTGAAGCATGTAGGTCGATTATGGTTTTATGGACATTCAAGCATCCAACTATCAGGATTTATTCTTGGATTATCAGGTGTAATTTCAGGTCTTATTTTAAATGATCGTCTGGATATCAATGTTGGCAAACACAAAGCCATTGG...
CDS
下载 CDS FASTA522 bp · TkA05G016630|TK1151|CDS
ACAGGTGAAGGTAGTGAAGTCAACGCTCCGTATTCAGATCTGAAAAGAATTCATGGGATTTTAAATGCGGTTGGATGGGGTATATTACTCCCCATAGGTGCTATGGTTGCTCGTTACTTGAAGCATGTAGGTCGATTATGGTTTTATGGACATTCAAGCATCCAACTATCAGGATTTATTCTTGGATTATCAGGTGTAATTTCAGGTCTTATTTTAAATGATCGTCTGGATATCAATGTTGGCAAACACAAAGCCATTGG...
173 aa · TkA05G016630|TK1151|PROTEIN
TGEGSEVNAPYSDLKRIHGILNAVGWGILLPIGAMVARYLKHVGRLWFYGHSSIQLSGFILGLSGVISGLILNDRLDINVGKHKAIGLIIITLGCLQIIAVLIRPSKDSKMRKYWKWYHQNVGRILILFAIFNVFYGIYLAHAGTEWNVTYGVFLGIIVTVALSLELRLLTED
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G016630 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G016630 |
| OH-1004 ID | LXL04_019075 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 99.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 14.088覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G016630 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:4681952-4682914 (+) |
| 描述 | Similar to UBP5: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程 GO:0007032 endosome organization 生物过程 GO:0007265 Ras protein signal transduction 生物过程 GO:0016579 protein deubiquitination 生物过程 GO:0141137 positive regulation of gene expression, epigenetic 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0004843 cysteine-type deubiquitinase activity 分子功能 GO:0140950 histone H2A deubiquitinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G32850 ath:AT2G40930 ath:AT4G10570 ath:AT4G10590 ath:AT5G22030 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.670
细胞质0.176
溶酶体／液泡0.117
内质网0.084
高尔基体0.065
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF10348DUF242710-102 aaPF03188Cytochrom_B56118-138 aaPF14007YtpI37-100 aaPF10348DUF2427118-141 aaPF14007YtpI120-138 aaPF14007YtpI155-159 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G016630 | PF10348 | DUF2427 | 10 | 102 | 0.053 | 14.0 |
| TkA05G016630 | PF03188 | Cytochrom_B561 | 18 | 138 | 0.00023 | 22.1 |
| TkA05G016630 | PF14007 | YtpI | 37 | 100 | 1.5 | 10.0 |
| TkA05G016630 | PF10348 | DUF2427 | 118 | 141 | 0.053 | 14.0 |
| TkA05G016630 | PF14007 | YtpI | 120 | 138 | 1.5 | 10.0 |
| TkA05G016630 | PF14007 | YtpI | 155 | 159 | 1.5 | 10.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q0WRW8 | 拟南芥 | sp|Q0WRW8|B561K_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g07570 | 52.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9M363 | 拟南芥 | sp|Q9M363|B561I_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g61750 | 39.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LSE7 | 拟南芥 | sp|Q9LSE7|B561C_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290 | 40.700% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LYS9 | 拟南芥 | sp|Q9LYS9|B561H_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g59070 | 39.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9FKH6 | 拟南芥 | sp|Q9FKH6|B561P_ARATH Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g35735 | 37.900% | Swiss-Prot | 中等置信 |