TkA05G012460 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G012460

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 3558771-3564338 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2697 bp · TkA05G012460|TK1151|cDNA

AATTCTTAGAAGAGCGAATTAGTGTATCAAATACCACGGGTAAAATAGTATAATGAAACACATCGGAGCTAGAAGCAAGTCTTCTCTTTGTCATGTATAGTTGACTCAATCGCTATAAACTCAAAAACACACACACACGCACATTAAAGCAATTGCGCCCGTTAATGGCGGCCTCTACAGATACAACGGCAGCGCCGTCGACGACTCTACGTCACGCCTCAGGAAATATTCTCGCATTCTTCATCCTCCTGTTAATCGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2355 bp · TkA05G012460|TK1151|CDS

ATGGCGGCCTCTACAGATACAACGGCAGCGCCGTCGACGACTCTACGTCACGCCTCAGGAAATATTCTCGCATTCTTCATCCTCCTGTTAATCGGCGTACTCGCATTCTCGATCCGTCTTTTTTCGGTTATTAAATATGAAAGTGTTATTCACGAGTTCGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTCACAAAGAACGGGATATATGACTTCTGGAATTGGTTTGACGACAGAACCTGGTATCCACTTGGACG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

784 aa · TkA05G012460|TK1151|PROTEIN

MAASTDTTAAPSTTLRHASGNILAFFILLLIGVLAFSIRLFSVIKYESVIHEFDPYFNYRVTQFLTKNGIYDFWNWFDDRTWYPLGRVIGGTVYPGLTLTAGTIWKVLHFLNIPLSVETVCVFTAPVFSAFAAWATYLLTKEVKGAGAGLTAAVLLAMVPSYISRSVAGSYDNEAVAIFALIFTFYLYIKTLNTGSLFYATLNSIAYFYMVCSWGGYTFIINLIPMHVLLCIVTGRYSSRLYIAYAPLVVLGTLLAALVP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G012460`
TK1151 ID	TkA05G012460
OH-1004 ID	LXL04_019028
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	94.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G012460

位置 Chr05:3558771-3564338 (-)

描述 Similar to STT3A: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g19690`	寡糖转移酶（OST）复合物的催化亚基，该复合物催化将特定糖链（在真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多烯二磷酸转移到新生多肽链中Asn-X-Ser/Thr共识序列的天冬酰胺残基上，这是蛋白质N-糖基化的第一步。	The STT3a subunit isoform of the Arabidopsis oligosaccharyltransferase controls adaptive responses to salt/osmotic stress.2003 · DOI: 10.1105/tpc.013862 Control of the pattern-recognition receptor EFR by an ER protein complex in plant immunity.2009 · DOI: 10.1038/emboj.2009.262 Receptor quality control in the endoplasmic reticulum for plant innate immunity.2009 · DOI: 10.1038/emboj.2009.263

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0519900`	寡糖转移酶（OST）复合物的催化亚基，该复合物催化将特定糖链（在真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多烯二磷酸转移到新生多肽链中Asn-X-Ser/Thr共识序列的天冬酰胺残基上，这是蛋白质N-糖基化的第一步。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019028 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006487 protein N-linked glycosylation 生物过程

GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0043687 post-translational protein modification 生物过程

GO:0047484 regulation of response to osmotic stress 生物过程

GO:0180058 protein co-translational transfer of dolichol-linked oligosaccharide 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0008250 oligosaccharyltransferase complex 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G19690

bta:507815

cfa:489300

dosa:Os05g0519900

mmu:16430

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.842

排名 1 · TkA05G012460 · TK1151

高尔基体0.093

排名 2 · TkA05G012460 · TK1151

细胞质0.077

排名 3 · TkA05G012460 · TK1151

细胞核0.076

排名 4 · TkA05G012460 · TK1151

细胞膜0.050

排名 5 · TkA05G012460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02060ISK_Channel7-59 aa

PF02516STT323-425 aa

PF22627AglB_core-like57-82 aa

PF02060ISK_Channel438-476 aa

PF08496Peptidase_S49_N462-499 aa

PF21436STT3-PglB_core479-499 aa

PF22627AglB_core-like567-642 aa

PF21436STT3-PglB_core581-640 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G012460	`PF02060`	ISK_Channel	7	59	0.034	14.6
TkA05G012460	`PF02516`	STT3	23	425	1.9e-103	347.9
TkA05G012460	`PF22627`	AglB_core-like	57	82	0.0065	17.5
TkA05G012460	`PF02060`	ISK_Channel	438	476	0.034	14.6
TkA05G012460	`PF08496`	Peptidase_S49_N	462	499	5.2	7.9
TkA05G012460	`PF21436`	STT3-PglB_core	479	499	0.00012	23.3
TkA05G012460	`PF22627`	AglB_core-like	567	642	0.0065	17.5
TkA05G012460	`PF21436`	STT3-PglB_core	581	640	0.00012	23.3
TkA05G012460	`PF02060`	ISK_Channel	611	645	0.034	14.6
TkA05G012460	`PF08496`	Peptidase_S49_N	720	772	5.2	7.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93ZY3`	拟南芥	sp\|Q93ZY3\|STT3A_ARATH Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A	81.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q6F2Z1`	水稻	sp\|Q6F2Z1\|STT3A_ORYSJ Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A	78.400%	Swiss-Prot	高置信

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