TkA05G011720 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G011720

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 3353875-3359764 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

4188 bp · TkA05G011720|TK1151|cDNA

CCCAAGTGTCTACTTGCTTACACTCCATCAGCTAAAAAGCTGAGAACCTTGTCGCTCCACACATGCATCGATCCTTCACAAAAACATCTCCATTCTCTCTTGTCTACTCTCTACTCTTCTCCCCTTTTCCTGATCAAAACCCAGCTGTAATAACAAGGTGCGATAATTGTCAGCTTTTGCTTATTCTTTTTTTTTTATCTTCAATTTTAAGGTACAAGTGTGTTACACCCATCCATATCCATTCCCCAAACTCTTTGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

3210 bp · TkA05G011720|TK1151|CDS

ATGGGTTGTGCTTTTTCAGTCGACTGTAGCTGTATCGGGGATATATGTTTACCTAGAGATCCTAAAGTAAAAGAAACCGACAATGTCGGTACATCTGAACTCGCCGTGTTCTCACCTAAATCTTCATTCAAGGAAGACGACGGAGACTCAAATCAGAATCCAGAAGCAGGAATAACAAGACTACGAAGAGTTTCATCACAGTTTTTACCACCAGATGGCTCTAGAATCGTCGTCATTCCAGCAGGAAACTACAGATTACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1069 aa · TkA05G011720|TK1151|PROTEIN

MGCAFSVDCSCIGDICLPRDPKVKETDNVGTSELAVFSPKSSFKEDDGDSNQNPEAGITRLRRVSSQFLPPDGSRIVVIPAGNYRLQYSYLSQRGYYPDALDKANQDSFCIHTPFGSNPNDHFFGVFDGHGEYGAQCSQFVKQKLCENLLRNSRFHVDPVDACHAAFLTTNSQLHADNNVDDSMSGTTAITVLVRGKTIYVANSGDSRAVIAEKRGTEIVAVDLSIDQTPYREDELERVKLCGARVLTLDQIEGLKNPDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G011720`
TK1151 ID	TkA05G011720
OH-1004 ID	LXL04_019019
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G011720

位置 Chr05:3353875-3359764 (+)

描述 Similar to At2g20050/At2g20040: Protein phosphatase 2C and cyclic nucleotide-binding/kinase domain-containing protein

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q9SL76`	蛋白磷酸酶2C以及含环状核苷酸结合/激酶结构域的蛋白。	暂无已核实直接文献
`At3g06270`	可能的蛋白磷酸酶2C 35。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os07g0646100`	可能的蛋白磷酸酶 2C 65。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019019 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0007189 adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0036289 peptidyl-serine autophosphorylation 生物过程

GO:0046146 tetrahydrobiopterin metabolic process 生物过程

GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程

GO:1903829 positive regulation of protein localization 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G20050

ath:AT3G06270

dosa:Os07g0646100

hsa:5593

rno:25523

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.506

排名 1 · TkA05G011720 · TK1151

细胞膜0.266

排名 2 · TkA05G011720 · TK1151

细胞核0.261

排名 3 · TkA05G011720 · TK1151

高尔基体0.101

排名 4 · TkA05G011720 · TK1151

溶酶体／液泡0.072

排名 5 · TkA05G011720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13672PP2C_2105-216 aa

PF00481PP2C110-356 aa

PF07228SpoIIE171-217 aa

PF07228SpoIIE311-378 aa

PF13672PP2C_2315-345 aa

PF00027cNMP_binding324-356 aa

PF00027cNMP_binding492-582 aa

PF00027cNMP_binding618-715 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G011720	`PF13672`	PP2C_2	105	216	0.038	14.3
TkA05G011720	`PF00481`	PP2C	110	356	2.2e-37	129.8
TkA05G011720	`PF07228`	SpoIIE	171	217	0.043	14.5
TkA05G011720	`PF07228`	SpoIIE	311	378	0.043	14.5
TkA05G011720	`PF13672`	PP2C_2	315	345	0.038	14.3
TkA05G011720	`PF00027`	cNMP_binding	324	356	6.4e-27	94.1
TkA05G011720	`PF00027`	cNMP_binding	492	582	6.4e-27	94.1
TkA05G011720	`PF00027`	cNMP_binding	618	715	6.4e-27	94.1
TkA05G011720	`PF00069`	Pkinase	774	1011	2e-35	123.2
TkA05G011720	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	781	996	3.9e-10	40.2
TkA05G011720	`PF14531`	Kinase-like	831	996	0.00015	21.8
TkA05G011720	`PF07228`	SpoIIE	1025	1041	0.043	14.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SL76`	拟南芥	sp\|Q9SL76\|P2C19_ARATH Protein phosphatase 2C and cyclic nucleotide-binding/kinase domain-containing protein	66.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XJ53`	拟南芥	sp\|Q7XJ53\|P2C35_ARATH Probable protein phosphatase 2C 35	59.200%	Swiss-Prot	低置信
`Q8H2T0`	水稻	sp\|Q8H2T0\|P2C65_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 65	50.200%	Swiss-Prot	低置信

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