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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G008660
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 2563261-2568576 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1888 bp · TkA05G008660|TK1151|cDNA

CAATACCCCATCATTCAAAACCACACTCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTACTTAATCAAGTATTGGAAGACCTCTCAAAGTTTCTACAAAGACGGGAGTGTTAGCTTGGGGGAGATTCAAGAAAAAAAAACCCATTTGAGAGCGATCGATCGAGTGAGAGAAAAAAATAAAGTTAAGAAAAGGAAAAGCTAATCTTTTGTATGTTTCTTCGTTTTTCTATTAAGAGGGGAAATGAATAGAGGAAATATGTTGCAGAGTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1149 bp · TkA05G008660|TK1151|CDS

ATGAATAGAGGAAATATGTTGCAGAGTTCACCGGTGCAACAAATGCTGGCCGGCGGTCCAAACAACTGGTGGAGTATGATGGCTACCACCAGACCTTCTCCCTCTCCGCCTCCACCTCAATCTCCGTTCTTCTCCGCCTCCGCACAACCACACTTCTTTCCTCACCAATATGCACCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCACTTTCCCTATCTCCATGGCATGATAATCATCATCAAGACTTCCCTGATTCCTTAAGCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

382 aa · TkA05G008660|TK1151|PROTEIN

MNRGNMLQSSPVQQMLAGGPNNWWSMMATTRPSPSPPPPQSPFFSASAQPHFFPHQYAPPPPPPPPPLSLSPWHDNHHQDFPDSLSQLLMSGLVGEDDKSTLSHMQQAVKKLENWEQQLLHDHHHQQQHHHHHHQNTNSMVESGVKQENPLSYGSSYGHGNVDFHGVKTNNWSNNPMIPVSSPNSCISSLSNSMLDFSTTISNKTDGRHPPPDRSSECNSTATGGVSKKAKIQPSSNQSTCKVRKEKLGDRITALHQLVS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G008660
TK1151 IDTkA05G008660
OH-1004 IDLXL04_018995
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 82.461 / OH-1004 65.353
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G008660
位置Chr05:2563261-2568576 (-)
描述Similar to BHLH68: Transcription factor bHLH68
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29100 转录因子bHLH68。 暂无已核实直接文献
At2g20100 转录因子 bHLH133。 暂无已核实直接文献
At1g27660 转录因子 bHLH110。 暂无已核实直接文献
At3g19500 转录因子 bHLH113。 暂无已核实直接文献
At3g20640 转录因子 bHLH123。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018995 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27660
ath:AT2G20100
ath:AT3G19500
ath:AT3G20640
ath:AT4G29100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.984
排名 1 · TkA05G008660 · TK1151
细胞质0.071
排名 2 · TkA05G008660 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA05G008660 · TK1151
内质网0.019
排名 4 · TkA05G008660 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA05G008660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18623TnsE_C80-141 aa
PF16172DOCK_N91-141 aa
PF22016DUF693397-134 aa
PF23177bHLH_IRO3101-120 aa
PF04281Tom22122-138 aa
PF00010HLH184-194 aa
PF22016DUF6933185-234 aa
PF04281Tom22227-270 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G008660PF18623TnsE_C801410.2212.2
TkA05G008660PF16172DOCK_N911410.1212.1
TkA05G008660PF22016DUF6933971340.05913.9
TkA05G008660PF23177bHLH_IRO31011200.00917.1
TkA05G008660PF04281Tom221221380.0215.4
TkA05G008660PF00010HLH1841940.01615.7
TkA05G008660PF22016DUF69331852340.05913.9
TkA05G008660PF04281Tom222272700.0215.4
TkA05G008660PF23177bHLH_IRO32412880.00917.1
TkA05G008660PF00010HLH2442820.01615.7
TkA05G008660PF27761VUP_C3473602.5e-0627.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S3D1拟南芥sp|Q8S3D1|BH068_ARATH Transcription factor bHLH6871.000%Swiss-Prot低置信
Q7XHI5拟南芥sp|Q7XHI5|BH133_ARATH Transcription factor bHLH13367.100%Swiss-Prot低置信
Q9SFZ3拟南芥sp|Q9SFZ3|BH110_ARATH Transcription factor bHLH11051.400%Swiss-Prot低置信
Q9LT67拟南芥sp|Q9LT67|BH113_ARATH Transcription factor bHLH11348.300%Swiss-Prot低置信
Q8GXT3拟南芥sp|Q8GXT3|BH123_ARATH Transcription factor bHLH12344.800%Swiss-Prot低置信

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