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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G005250
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 1550385-1556607 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2096 bp · TkA05G005250|TK1151|cDNA

ATTTCATCACTTTTTCATATAGTTGTCATTTGTCAACTAGTAATAGTAGTCACAAGCATCAATCTTGAGTTTTTGACCCTCGTCCTCACGCTGCAATAAACCCCTCTTTTAATTCGTCGCCGTGATTGCTGCAAGAGAAAGGAAAACAAGGAAATAAAGCAAAACCAGTCCACGCCAAGCTAAAAACATTGGAGTCTGATTAGTGATTAATCGTTAGGTTTTTACTCCCACTGCCAGTTCCAGCACCATGGATCAACACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1032 bp · TkA05G005250|TK1151|CDS

ATGGATCAACACAGAGACTACCGTTCTTCTTTGTCCTACGACAACTCTATCCCTCCTCCCAACTACCACGACGGTAGCAACTTTAACCATGGTGGTGACGGCCACTACGATCATCACCGTAGATACCAAAACCACCATCAAGATTTTGGTAACGAACCAACCGATTCATTTGGACACGCCAATGGAACTGCATTTGCTGGACGAAAGCGACAATTCTCTCACTCTGCTCTTGGAGCTCCTGGATACAACAATGATAGCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

343 aa · TkA05G005250|TK1151|PROTEIN

MDQHRDYRSSLSYDNSIPPPNYHDGSNFNHGGDGHYDHHRRYQNHHQDFGNEPTDSFGHANGTAFAGRKRQFSHSALGAPGYNNDSNYAKLYVKGVPREASEQDIQSLFGKHGNIIEVVLFKQLKNVQEQDCCFVKYAKTEDAAQAIRSLHNQHIFPGGIRPIEVKYASTSKKQERIGLGGFRGNECKLFVASLNKHASEGEIAQIFSPYGCVEEVFLLRDEQKQNRGTGFITFTQKDMAVAAINALSGTFIMKGCEQPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G005250
TK1151 IDTkA05G005250
OH-1004 IDLXL04_018953
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G005250
位置Chr05:1550385-1556607 (-)
描述Similar to FCA: Flowering time control protein FCA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16280 在促进营养分生长顶端分生组织向生殖发育转变中起主要作用。 暂无已核实直接文献
At1g03457 RNA结合蛋白参与开花时间的调节。 暂无已核实直接文献
At4g03110 RNA结合蛋白参与开花时间的调节。
A putative RNA-binding protein positively regulates salicylic acid-mediated immunity in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1094/mpmi-05-10-0106

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BCZ8 在促进营养分生组织向生殖发育转变中起主要作用（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os09g0123200 在促进营养分生长顶端分生组织向生殖发育转变中起主要作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018953 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0031048 regulatory ncRNA-mediated heterochromatin formation 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0080113 regulation of seed growth 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G16280
dosa:Os09g0123200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.609
排名 1 · TkA05G005250 · TK1151
细胞质0.477
排名 2 · TkA05G005250 · TK1151
细胞膜0.062
排名 3 · TkA05G005250 · TK1151
内质网0.035
排名 4 · TkA05G005250 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA05G005250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07576BRAP286-149 aa
PF29326RRM_MUD2_C88-112 aa
PF16367RRM_790-116 aa
PF00076RRM_191-154 aa
PF28976RRM_ACIN191-165 aa
PF08777RRM_391-152 aa
PF28441RRM_1193-178 aa
PF05172RRM_Nup3593-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G005250PF07576BRAP2861490.1413.1
TkA05G005250PF29326RRM_MUD2_C881120.1812.6
TkA05G005250PF16367RRM_7901160.005617.3
TkA05G005250PF00076RRM_1911542.2e-31108.2
TkA05G005250PF28976RRM_ACIN1911653.3e-0524.6
TkA05G005250PF08777RRM_3911520.003518.1
TkA05G005250PF28441RRM_11931780.0001322.9
TkA05G005250PF05172RRM_Nup35931600.06713.9
TkA05G005250PF16842RRM_occluded961550.0215.5
TkA05G005250PF29326RRM_MUD2_C1261540.1812.6
TkA05G005250PF16367RRM_71872270.005617.3
TkA05G005250PF00076RRM_11892532.2e-31108.2
TkA05G005250PF08777RRM_31912540.003518.1
TkA05G005250PF28441RRM_111982450.0001322.9
TkA05G005250PF16842RRM_occluded1992230.0215.5
TkA05G005250PF05172RRM_Nup352032330.06713.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04425拟南芥sp|O04425|FCA_ARATH Flowering time control protein FCA47.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GZ26拟南芥sp|Q8GZ26|BRN2L_ARATH RNA-binding protein BRN234.800%Swiss-Prot中等置信
Q8LFS6拟南芥sp|Q8LFS6|BRN1L_ARATH RNA-binding protein BRN130.700%Swiss-Prot中等置信
B8BCZ8水稻sp|B8BCZ8|FCA_ORYSI Flowering time control protein FCA49.700%Swiss-Prot中等置信
Q6K271水稻sp|Q6K271|FCA_ORYSJ Flowering time control protein FCA49.700%Swiss-Prot中等置信

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