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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G506410
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 127932289-127935651 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

633 bp · TkA04G506410|TK1151|cDNA

CCGCTAGCCCAGCCACTTTCCAGAGCGCCAAGGCCCTTGCCGTTCGTCTCACGGACGAAGGCATTCGCCAAGGAACCATGGTACAAAAGGCAGAGGCTCCCAAGGAAGATAACAACAAAAGGAAGTCCTGGATGAAAAACAAACCCAACCCCTCACCAGCTCCCCAAAAGAAACAAGAAATAACCGCCTTCGCCGCCACGGCACCAACCAATACAGTTCCACCGAAGCCCTATAATGGGACTCTCCCAAAATGCAACCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

450 bp · TkA04G506410|TK1151|CDS

ATGGTACAAAAGGCAGAGGCTCCCAAGGAAGATAACAACAAAAGGAAGTCCTGGATGAAAAACAAACCCAACCCCTCACCAGCTCCCCAAAAGAAACAAGAAATAACCGCCTTCGCCGCCACGGCACCAACCAATACAGTTCCACCGAAGCCCTATAATGGGACTCTCCCAAAATGCAACCGATGCAATTACCACCATGTTGGGGCATGTAAAGAAATGTACTGCACCAACTGCAAGAAGAAGGGTCACACGGCCCGGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

149 aa · TkA04G506410|TK1151|PROTEIN

MVQKAEAPKEDNNKRKSWMKNKPNPSPAPQKKQEITAFAATAPTNTVPPKPYNGTLPKCNRCNYHHVGACKEMYCTNCKKKGHTARFCKSPAVGPAQEGNASASKACYGCGDVGHFKRDCPKAAGTANGRVFAMGTEEAQVDPYYVTGN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G506410
TK1151 IDTkA04G506410
OH-1004 IDLXL04_008128
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.658 / OH-1004 9.787
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G506410
位置Chr04:127932289-127935651 (+)
描述Similar to TY3B-I: Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008128 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0075523 viral translational frameshifting 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003887 DNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0004519 endonuclease activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
sce:YGR109W-B
sce:YIL082W-A
spo:2538755
spo:2541833
spo:2541991
spo:3361422
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.581
排名 1 · TkA04G506410 · TK1151
细胞核0.494
排名 2 · TkA04G506410 · TK1151
细胞外0.069
排名 3 · TkA04G506410 · TK1151
内质网0.060
排名 4 · TkA04G506410 · TK1151
细胞膜0.043
排名 5 · TkA04G506410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27939DUF836348-73 aa
PF00098zf-CCHC58-63 aa
PF14392zf-CCHC_465-70 aa
PF22586ANCHR-like_BBOX70-84 aa
PF27939DUF836372-127 aa
PF00098zf-CCHC74-89 aa
PF30379SLU7_N74-88 aa
PF14392zf-CCHC_474-89 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G506410PF27939DUF836348730.03114.8
TkA04G506410PF00098zf-CCHC58631.6e-0628.7
TkA04G506410PF14392zf-CCHC_465700.212.0
TkA04G506410PF22586ANCHR-like_BBOX70841.49.8
TkA04G506410PF27939DUF8363721270.03114.8
TkA04G506410PF00098zf-CCHC74891.6e-0628.7
TkA04G506410PF30379SLU7_N74880.01116.0
TkA04G506410PF14392zf-CCHC_474890.212.0
TkA04G506410PF22586ANCHR-like_BBOX1001121.49.8
TkA04G506410PF30379SLU7_N1041200.01116.0
TkA04G506410PF14392zf-CCHC_41051220.212.0
TkA04G506410PF00098zf-CCHC1061221.6e-0628.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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