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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G478400
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 120871152-120873167 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1323 bp · TkA04G478400|TK1151|cDNA

CTCAAATACACACACATAAACACAGAGTTACTTTCCCGCTCCTTTCTCTTGTCTGCACAAAATCAACAGTGTCTTCATATTGTACTAACTAGGGCTTTGCTAAAGGTCTGATTATAACCGGAGATCCGCCATGGAAATCGGTGGCAAAACGAACCTTCTTCTTCTATTTGGATGTTCTCTTCTACTGTGTTTGATTGCTTCATCTGATTCATCGCTTCAGTACGACTATTATCGACAATCCTGCCCTGAAGCGCAACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1077 bp · TkA04G478400|TK1151|CDS

ATGGAAATCGGTGGCAAAACGAACCTTCTTCTTCTATTTGGATGTTCTCTTCTACTGTGTTTGATTGCTTCATCTGATTCATCGCTTCAGTACGACTATTATCGACAATCCTGCCCTGAAGCGCAACAGATTATTAAATCAACTCTACGCCGGATCTACAATCGAAATTCGAGTGCTGCTCCAGCTATTCTTCGCCTGGTTTTTCACGATTGTTTTGTACAGGGATGTGATGCATCAGTGCTTTTGGATCCCACAGAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

358 aa · TkA04G478400|TK1151|PROTEIN

MEIGGKTNLLLLFGCSLLLCLIASSDSSLQYDYYRQSCPEAQQIIKSTLRRIYNRNSSAAPAILRLVFHDCFVQGCDASVLLDPTEIMGSEKDTPPNQSLKGFDHLDIIKAELEHACPGVVSCADLLVVAARESVILAGGPFYPVHTGRKDSKRSFPQLSYELPSPLDDLPTNIARFSTRGFTDKETVTLLGAHSTGMIHCKFFEKRLYNFGGTDHPDPSMDSEFADLLRSICNNNRSHSHSHSHSQSPSASESASPSPS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G478400
TK1151 IDTkA04G478400
OH-1004 IDLXL04_038933
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.721 / OH-1004 84.198
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G478400
位置Chr04:120871152-120873167 (+)
描述Similar to PER48: Putative Peroxidase 48
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33870 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At3g03670 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At5g17820 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At4g33420 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038933 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0080001 mucilage extrusion from seed coat 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004601 peroxidase activity 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ahf:112743807
ath:AT3G03670
ath:AT4G33870
ath:AT4G36430
ath:AT5G17820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.378
排名 1 · TkA04G478400 · TK1151
细胞外0.229
排名 2 · TkA04G478400 · TK1151
细胞膜0.137
排名 3 · TkA04G478400 · TK1151
细胞质0.133
排名 4 · TkA04G478400 · TK1151
内质网0.113
排名 5 · TkA04G478400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00141peroxidase46-318 aa
PF08015Pheromone221-280 aa
PF00937CoV_nucleocap232-269 aa
PF01254TP2233-271 aa
PF12278SDP_N237-269 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G478400PF00141peroxidase463184.6e-72243.4
TkA04G478400PF08015Pheromone2212800.03915.7
TkA04G478400PF00937CoV_nucleocap2322692.18.1
TkA04G478400PF01254TP22332710.2312.8
TkA04G478400PF12278SDP_N2372692.48.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81755拟南芥sp|O81755|PER48_ARATH Putative Peroxidase 4848.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SS67拟南芥sp|Q9SS67|PER28_ARATH Peroxidase 2837.200%Swiss-Prot中等置信
Q43729拟南芥sp|Q43729|PER57_ARATH Peroxidase 5736.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SZB9拟南芥sp|Q9SZB9|PER47_ARATH Peroxidase 4736.800%Swiss-Prot中等置信

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