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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G456580
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 115092013-115095227 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2482 bp · TkA04G456580|TK1151|cDNA

ATTAATTTAAACGGAATAAACTTTTGTAAAAACTTAAAACTGTGTCAACAAAACCCGAATACGCGTAGATTCATCCGATTTCACTCAGACACCAAATCTTCTTCTTCGCTGGGCTGCCCATCGTTCAAAGCGAAGCCATATACGTACACCGATGCATATCGAGAAAGAAACCCATGTTGGCATCAAGATCTAGAGACAAAATCAAAAGGAACATGAACTTGTACTCGAAGCAGAAGAGGGCTGGGCCGAGGCTTGAACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA04G456580|TK1151|CDS

ATGTTGGCATCAAGATCTAGAGACAAAATCAAAAGGAACATGAACTTGTACTCGAAGCAGAAGAGGGCTGGGCCGAGGCTTGAACGAAGAAACGCAGTTAAGAACATCGACTACGACGCATCTACATCATCGTCTTCATTTGACAGTCAATCGGCTCCCCGAACTCGATCACTTGAGATTACATCGTCTTCAGATAGGAGGAGCTTTCGGATTGGAGGAACCGAGGGCGAATTGGATTTGATCTTCAAAAGTCTAGGGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

609 aa · TkA04G456580|TK1151|PROTEIN

MLASRSRDKIKRNMNLYSKQKRAGPRLERRNAVKNIDYDASTSSSSFDSQSAPRTRSLEITSSSDRRSFRIGGTEGELDLIFKSLGLSPEDFAIPTAAWEAHKSFSPTDGSIPYSSRLLHSPLVSTTESPESDFSVSFESKNSFSDDDVKSDGECSRLGEIGEARVLMTNGIAIRDDVNVGGISENRLGNDCSETPNGVNLSTVESARVLESGGDEDSDKTRERRHVAGESGIRGPRPPLLAPPPPMSRSIVGSMDSTWD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G456580
TK1151 IDTkA04G456580
OH-1004 IDLXL04_016850
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.044 / OH-1004 95.300
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G456580
位置Chr04:115092013-115095227 (+)
描述Similar to MEKK1: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08500 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
Phosphorylation of Arabidopsis thaliana MEKK1 via Ca(2+) signaling as a part of the cold stress response.2013 · DOI: 10.1007/s10265-013-0576-0
At4g08480 触发 SUMM2 介导的免疫反应，包括细胞死亡和防御反应。
The MEKK1-MKK1/MKK2-MPK4 kinase cascade negatively regulates immunity mediated by a mitogen-activated protein kinase kinase kinase in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.097253
Glutamate signalling via a MEKK1 kinase-dependent pathway induces changes in Arabidopsis root architecture.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12201
Deletion of a tandem gene family in Arabidopsis: increased MEKK2 abundance triggers autoimmunity when the MEKK1-MKK1/2-MPK4 signaling cascade is disrupted.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.112102
At4g08470 丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶 3。 暂无已核实直接文献
At4g12020 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016850 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0010449 root meristem growth 生物过程
GO:0022622 root system development 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G08470
ath:AT4G08480
ath:AT4G08500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.465
排名 1 · TkA04G456580 · TK1151
细胞膜0.316
排名 2 · TkA04G456580 · TK1151
细胞核0.313
排名 3 · TkA04G456580 · TK1151
高尔基体0.060
排名 4 · TkA04G456580 · TK1151
内质网0.051
排名 5 · TkA04G456580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase336-589 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr339-585 aa
PF03109ABC1340-363 aa
PF10707YrbL-PhoP_reg379-469 aa
PF06293Kdo419-475 aa
PF14531Kinase-like438-536 aa
PF17667Pkinase_fungal442-505 aa
PF07387Seadorna_VP7442-477 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G456580PF00069Pkinase3365898.4e-70235.9
TkA04G456580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3395859.5e-50170.0
TkA04G456580PF03109ABC13403630.002717.6
TkA04G456580PF10707YrbL-PhoP_reg3794690.002118.5
TkA04G456580PF06293Kdo4194750.2611.4
TkA04G456580PF14531Kinase-like4385361e-0525.7
TkA04G456580PF17667Pkinase_fungal4425050.01914.5
TkA04G456580PF07387Seadorna_VP74424770.2111.3
TkA04G456580PF03109ABC14434850.002717.6
TkA04G456580PF12330Haspin_kinase4554830.04413.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39008拟南芥sp|Q39008|M3K1_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 147.400%Swiss-Prot中等置信
O81472拟南芥sp|O81472|MP3K2_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 954.400%Swiss-Prot中等置信
Q9M0T3拟南芥sp|Q9M0T3|MP3K3_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 365.200%Swiss-Prot低置信
Q9SZ67拟南芥sp|Q9SZ67|WRK19_ARATH Probable WRKY transcription factor 1952.200%Swiss-Prot中等置信

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