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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G412260
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 103828378-103832992 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3746 bp · TkA04G412260|TK1151|cDNA

GTAATATTAGGTATATTGATAAATGATGTAATATATAGCCATATATACATAAAATATAATATGATTTAGACAATAATAGGTTAAATTCACCAAATCAAATATATTTTTGGACGGATGCTGATCGCCATACACACGGCCATCTGTATGCATATGTAGAGAGAGAAAAATTGTTGGAGTGATTGATGAGTGAGAGAGAGTAGCAGCAGAGATTTTGAGCTTAGCTACAGTCAACGTGCCCCACCGTACCGGATCTTTGACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2607 bp · TkA04G412260|TK1151|CDS

ATGGGGAGTAATTTTGTTGTATTATTGGTGTTGTCGTTGTTGTTACACAGTACATTTGAACAACAACAACTACCACCACCACAAGTTCCGTCCAGATTTAGGGCAGAACGGGCAGCTCTGCTTCAACTTAGATCATCATTAGGGTTAAGATCAAAACAATGGCCGCTAAAGTCCATTCCGTGCTCCAATTGGACCGGAATCTCATGTCAGAACGGCAGTGTCACCGGAATCAACATTTCAGGGTTTAAGCGAACTCGAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

868 aa · TkA04G412260|TK1151|PROTEIN

MGSNFVVLLVLSLLLHSTFEQQQLPPPQVPSRFRAERAALLQLRSSLGLRSKQWPLKSIPCSNWTGISCQNGSVTGINISGFKRTRAGRRNPRFAVESLANLTNLASFNASRFTLPGSIPNELGFQLQALQVLDLRFCQISGAIPSTLGNLSNLHELYLSDNSLTGTIPSTLGQLPNLSVLDLSRNSLTGLIPSSFGSLLNLSSLDMSLNYLSGIIPESFGNLPNLSFLNLSGNSLSSSLPTQLFNTTTLTVLDLSSNTL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G412260
TK1151 IDTkA04G412260
OH-1004 IDLXL04_038268
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.885 / OH-1004 99.770
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G412260
位置Chr04:103828378-103832992 (+)
描述Similar to At2g16250: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g16250 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g16250。 暂无已核实直接文献
At3g24550 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK1。 暂无已核实直接文献
At4g32710 富脯氨酸受体样蛋白激酶PERK14。 暂无已核实直接文献
At1g20650 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g24030 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038268 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0033612 receptor serine/threonine kinase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16250
dosa:Os02g0777400
dosa:Os06g0203800
osa:4340427
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.855
排名 1 · TkA04G412260 · TK1151
内质网0.076
排名 2 · TkA04G412260 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA04G412260 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA04G412260 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkA04G412260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_236-69 aa
PF12799LRR_497-113 aa
PF29594LRR_SKP2114-303 aa
PF23598LRR_14117-209 aa
PF24758LRR_At5g56370117-178 aa
PF25013LRR_Zer-1126-189 aa
PF29252LRR_NLRC4126-260 aa
PF13855LRR_8129-188 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G412260PF08263LRRNT_236693.2e-0524.8
TkA04G412260PF12799LRR_4971132.3e-1557.0
TkA04G412260PF29594LRR_SKP21143030.410.6
TkA04G412260PF23598LRR_141172091.2e-1351.3
TkA04G412260PF24758LRR_At5g563701171780.002718.1
TkA04G412260PF25013LRR_Zer-11261890.0116.7
TkA04G412260PF29252LRR_NLRC41262601.19.2
TkA04G412260PF13855LRR_81291881.9e-2073.1
TkA04G412260PF12799LRR_41291642.3e-1557.0
TkA04G412260PF00560LRR_11301511.8e-2275.3
TkA04G412260PF23211LRR_LRWD11441898.16.8
TkA04G412260PF23952LRR_EndoS1482104.48.3
TkA04G412260PF24048LRR_NXF1-51501881.39.4
TkA04G412260PF00560LRR_11531751.8e-2275.3
TkA04G412260PF12799LRR_41531912.3e-1557.0
TkA04G412260PF13855LRR_81762361.9e-2073.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGK4拟南芥sp|C0LGK4|Y2165_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1625059.400%Swiss-Prot高置信
Q9LV48拟南芥sp|Q9LV48|PERK1_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK133.100%Swiss-Prot低置信
O65530拟南芥sp|O65530|PEK14_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1433.300%Swiss-Prot低置信
Q9LDZ5拟南芥sp|Q9LDZ5|PBL21_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2133.100%Swiss-Prot低置信
Q84M95拟南芥sp|Q84M95|PBL28_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2831.500%Swiss-Prot低置信

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