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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G407650
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 102471186-102474222 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1307 bp · TkA04G407650|TK1151|cDNA

TTTATATTCCTAGTGGGCACTACCTTTTATCACCTGTGCACAATTTAATTCGTGTATCTATCACATTAATCCTTTACATACTCGATTGGCAGTAGGTTTACATCTAGAAAGATTCAGTCATCATGGTGAAAGCAATTAGAGTTCATGAGCATGGCGGTCTTAAGGTTATGAAATGGGAGGATGTGGATGTAGGCGAACCAAAAAGCGGAGAAATTAAAATTAAAATCAAGGCGATTGGAGTAAACTATATAGATGTTTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

987 bp · TkA04G407650|TK1151|CDS

ATGGTGAAAGCAATTAGAGTTCATGAGCATGGCGGTCTTAAGGTTATGAAATGGGAGGATGTGGATGTAGGCGAACCAAAAAGCGGAGAAATTAAAATTAAAATCAAGGCGATTGGAGTAAACTATATAGATGTTTATATGCGTAAAGGTGTACTCCCTAGTTTATGCCCCCCATTGCCGTTCACACCAGGTGTTGAAGCAGCCGGAGTTGTAATAGCCGTTGCGCCTGGAGTTACAACCTGCAAGCTTGGAGATACGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

328 aa · TkA04G407650|TK1151|PROTEIN

MVKAIRVHEHGGLKVMKWEDVDVGEPKSGEIKIKIKAIGVNYIDVYMRKGVLPSLCPPLPFTPGVEAAGVVIAVAPGVTTCKLGDTVAFAGFPVCSYAEQLILPAERVVPVPPSVDPIVAAAVLFKGLTAQILLRSCLKVGPEHTILVTAAAGGVGSLLCQWANALGATVIGTVSNKDKALQAKEDGCHHVLIYNEENIVDRVMDITSRKGVDIVYDAIGKDTFEDSVACLKFRGHMVAFGFASGSAEPVKFKVFSDKCL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G407650
TK1151 IDTkA04G407650
OH-1004 IDLXL04_012063
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)64.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.696
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G407650
位置Chr04:102471186-102474222 (+)
描述Similar to qor: Quinone oxidoreductase (Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012063 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042206 halogenated hydrocarbon catabolic process 生物过程
GO:1990748 cellular detoxification 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003960 quinone reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016628 oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能
GO:0035925 mRNA 3'-UTR AU-rich region binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0070402 NADPH binding 分子功能
GO:0102523 2-chloroacrylate reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:BAD91551
ecj:JW4011
eco:b4051
ecoc:C3026_21890
pae:PA0023
spo:2538826
stm:STM4245
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.501
排名 1 · TkA04G407650 · TK1151
线粒体0.186
排名 2 · TkA04G407650 · TK1151
过氧化物酶体0.169
排名 3 · TkA04G407650 · TK1151
细胞核0.138
排名 4 · TkA04G407650 · TK1151
细胞膜0.081
排名 5 · TkA04G407650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08240ADH_N28-112 aa
PF22427SMMA_C28-50 aa
PF00107ADH_zinc_N66-92 aa
PF00106adh_short145-222 aa
PF01370Epimerase146-218 aa
PF00107ADH_zinc_N154-255 aa
PF22427SMMA_C160-204 aa
PF08240ADH_N166-180 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G407650PF08240ADH_N281122.1e-1557.5
TkA04G407650PF22427SMMA_C28500.03514.7
TkA04G407650PF00107ADH_zinc_N66923e-2486.1
TkA04G407650PF00106adh_short1452220.006316.7
TkA04G407650PF01370Epimerase1462180.1312.4
TkA04G407650PF00107ADH_zinc_N1542553e-2486.1
TkA04G407650PF22427SMMA_C1602040.03514.7
TkA04G407650PF08240ADH_N1661802.1e-1557.5
TkA04G407650PF13602ADH_zinc_N_21873243.9e-1867.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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