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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G405800
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 102029560-102035302 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3237 bp · TkA04G405800|TK1151|cDNA

TCTCTTTCTCTCTCTATCTCTCTATGGTCTCTACCCCCGCCCAGTCCCCTCCCTTTCTCACCAGCATCGCTTTCTTGATAGTTTAATAATTTTCCTTATAAAGTTCTCCAAAATCGCTAAACACACCTGCTGGCTCAATTTATATTAATTTTTCAGGTATTTTAGATCCCTCATTTTCATATGACTGCATCATCACCGAAAAGAATTTGCATCATTTAGCTAAGCAGCTCCTTCAGGTCAAGATGTGAGTTGACCAACTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2796 bp · TkA04G405800|TK1151|CDS

ATGGAGATTGACAAGCCTATCCTGACAACAAGTATGTTTTTCTTGATGTTTATGGTGGTGGCCATGGCAGACGATGGTATAACTGTAAATACATCATCATCAAGAAGGCCTAGTGTTATAAATATTGGAGCTTTATTAACAGTAAATTCAGTTATCGGTAGGTCTGTGAAGCCTGCTATTATAGCTGCCGTTGATGATATAAACTCTAATCCATTAATTCTTGGAGAAACCCGTTTGAATCTCATCTTACATGATACAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

931 aa · TkA04G405800|TK1151|PROTEIN

MEIDKPILTTSMFFLMFMVVAMADDGITVNTSSSRRPSVINIGALLTVNSVIGRSVKPAIIAAVDDINSNPLILGETRLNLILHDTNCSGFLGTIEALELMEKDVVAAIGPQSSTIAHVISHVVNELHVPLISFGATDPTLAALQYPYFLRMTQSDYYQMSAIADLVEYFEYKEVIAIYVDDDYGRNGISSLGDSLAKKRAKISYKAAFTPGASESDINELLTEVNLMESRVYVVHVNPDSGLQIFSIARKLNMMTSDYV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G405800
TK1151 IDTkA04G405800
OH-1004 IDLXL04_038202
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G405800
位置Chr04:102029560-102035302 (+)
描述Similar to GLR3.4: Glutamate receptor 3.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g32390 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g05200 谷氨酸门控受体，可能至少在下胚轴中作为非选择性阳离子通道（可能）。
AtGLR3.4, a glutamate receptor channel-like gene is sensitive to touch and cold.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1551-3
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Dual localization of plant glutamate receptor AtGLR3.4 to plastids and plasmamembrane.2011 · DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.11.008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
Glutamate Receptor Homolog3.4 is Involved in Regulation of Seed Germination Under Salt Stress in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1093/pcp/pcy034
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038202 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05200
ath:AT1G42540
ath:AT2G32390
ath:AT3G51480
osa:124544569
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.832
排名 1 · TkA04G405800 · TK1151
细胞质0.072
排名 2 · TkA04G405800 · TK1151
内质网0.071
排名 3 · TkA04G405800 · TK1151
溶酶体／液泡0.045
排名 4 · TkA04G405800 · TK1151
细胞核0.029
排名 5 · TkA04G405800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13458Peripla_BP_640-406 aa
PF01094ANF_receptor56-411 aa
PF27867Membra_charge357-380 aa
PF13855LRR_8364-381 aa
PF10613Lig_chan-Glu_bd490-580 aa
PF00497SBP_bac_3531-817 aa
PF00060Lig_chan596-850 aa
PF27867Membra_charge655-675 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G405800PF13458Peripla_BP_6404066.8e-2072.7
TkA04G405800PF01094ANF_receptor564113.1e-96323.2
TkA04G405800PF27867Membra_charge3573800.00517.5
TkA04G405800PF13855LRR_83643810.3511.4
TkA04G405800PF10613Lig_chan-Glu_bd4905802.1e-0938.2
TkA04G405800PF00497SBP_bac_35318172.5e-1247.4
TkA04G405800PF00060Lig_chan5968502.4e-38131.9
TkA04G405800PF27867Membra_charge6556750.00517.5
TkA04G405800PF13855LRR_86987410.3511.4
TkA04G405800PF13855LRR_88008180.3511.4
TkA04G405800PF27867Membra_charge8388760.00517.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SW97拟南芥sp|Q9SW97|GLR35_ARATH Glutamate receptor 3.562.900%Swiss-Prot高置信
Q8GXJ4拟南芥sp|Q8GXJ4|GLR34_ARATH Glutamate receptor 3.463.300%Swiss-Prot高置信
Q9C8E7拟南芥sp|Q9C8E7|GLR33_ARATH Glutamate receptor 3.353.900%Swiss-Prot高置信
Q84W41拟南芥sp|Q84W41|GLR36_ARATH Glutamate receptor 3.650.600%Swiss-Prot高置信
Q7XP59水稻sp|Q7XP59|GLR31_ORYSJ Glutamate receptor 3.155.800%Swiss-Prot高置信

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