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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G392510
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 98693912-98701287 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

970 bp · TkA04G392510|TK1151|cDNA

TTATTAAACGATGTTTTACCATTGCAGGTGTTGGAAAATCATGCCTTCTTTTGCAGTTCACAGACAAACGTTTTCAACCTGTTCATGATTTAATGATTGGTGTAGAATTTGGTGCCAGAATGATCACCATTGACAACAAACCAATAAAGCTCCAGATCTGGGACACGGCGGGTCAGGAATCGTTCAGATCCATAACAAGATCTTACTACAGAGGTGCAGCTGGTGCACTTTTGGTTTATGACATCACCAGGAGGGAGACA...

CDS

下载 CDS FASTA

813 bp · TkA04G392510|TK1151|CDS

ATGATTGGTGTAGAATTTGGTGCCAGAATGATCACCATTGACAACAAACCAATAAAGCTCCAGATCTGGGACACGGCGGGTCAGGAATCGTTCAGATCCATAACAAGATCTTACTACAGAGGTGCAGCTGGTGCACTTTTGGTTTATGACATCACCAGGAGGGAGACATTTAATCACCTTGCGAGCTGGTTGGAGGATGCCAGACAGCATGCAAATGCAAACATGACGGTTATGCTTATTGGTAACAAATGTGATCTTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

270 aa · TkA04G392510|TK1151|PROTEIN

MIGVEFGARMITIDNKPIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLASWLEDARQHANANMTVMLIGNKCDLAHRRAVSTEEGEQFAKENGLIFMEEELGQPLESVFSKISSESIAAASLGQVYRATLRDSGEDVAIKVQRPEIEPIIYRDLFLFRTLASFLNGTSLQKLGCNAELIVDEFGEKLLEELDYTLVPKQPGNTECGYYVCKFMKEIIDNGLDVLVNANIGDRKQVYKDVDLDGIREDW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G392510
TK1151 IDTkA04G392510
OH-1004 IDLXL04_020995
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.741 / OH-1004 80.380
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G392510
位置Chr04:98693912-98701287 (-)
描述Similar to RABB1C: Ras-related protein RABB1c
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g17170 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献
At4g31390 激酶可以磷酸化生育酚环化酶 VTE1，这是生育酚代谢的关键酶，参与氧化 α-生育酚醌的再循环，可能将其稳定在质体球中。
AtACDO1, an ABC1-like kinase gene, is involved in chlorophyll degradation and the response to photooxidative stress in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1093/jxb/ers072
Loss of plastoglobule kinases ABC1K1 and ABC1K3 causes conditional degreening, modified prenyl-lipids, and recruitment of the jasmonic acid pathway.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111120
ABC1K1/PGR6 kinase: a regulatory link between photosynthetic activity and chloroplast metabolism.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12385
At1g71810 未表征的含 aarF 结构域的蛋白激酶 At1g71810，叶绿体的。 暂无已核实直接文献
At1g79600 激酶可以磷酸化生育酚环化酶 VTE1，这是生育酚代谢的关键酶，参与氧化 α-生育酚醌的再循环，可能将其稳定在质体球中。
A chloroplast ABC1-like kinase regulates vitamin E metabolism in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.218644
Loss of plastoglobule kinases ABC1K1 and ABC1K3 causes conditional degreening, modified prenyl-lipids, and recruitment of the jasmonic acid pathway.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111120

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020995 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009767 photosynthetic electron transport chain 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G17170
ath:AT4G31390
zma:100127017
zma:100127494
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.572
排名 1 · TkA04G392510 · TK1151
细胞核0.270
排名 2 · TkA04G392510 · TK1151
高尔基体0.149
排名 3 · TkA04G392510 · TK1151
细胞膜0.147
排名 4 · TkA04G392510 · TK1151
溶酶体／液泡0.115
排名 5 · TkA04G392510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00071Ras2-111 aa
PF08477Roc2-85 aa
PF00025Arf8-96 aa
PF00009GTP_EFTU10-93 aa
PF17920TetR_C_1621-76 aa
PF03109ABC1100-206 aa
PF17920TetR_C_16115-132 aa
PF02902Peptidase_C48207-235 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G392510PF00071Ras21113.7e-41141.1
TkA04G392510PF08477Roc2851.7e-2074.1
TkA04G392510PF00025Arf8964e-0936.9
TkA04G392510PF00009GTP_EFTU10930.001518.9
TkA04G392510PF17920TetR_C_1621760.09613.6
TkA04G392510PF03109ABC11002063.9e-2692.4
TkA04G392510PF17920TetR_C_161151320.09613.6
TkA04G392510PF02902Peptidase_C482072350.0116.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P92963拟南芥sp|P92963|RAB1C_ARATH Ras-related protein RABB1c76.600%Swiss-Prot高置信
Q8RWG1拟南芥sp|Q8RWG1|AB1K1_ARATH Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 1, chloroplastic85.200%Swiss-Prot中等置信
Q94BU1拟南芥sp|Q94BU1|Y1181_ARATH Uncharacterized aarF domain-containing protein kinase At1g71810, chloroplastic42.500%Swiss-Prot中等置信
Q9MA15拟南芥sp|Q9MA15|AB1K3_ARATH Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic42.500%Swiss-Prot中等置信

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