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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G359570
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 90594501-90595871 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1215 bp · TkA04G359570|TK1151|cDNA

ATGATACTGGTGTGGATCTGGAACAACAGCAAAGAAACATTACAGGTAATTGACCTCTCCCACAACTCCATCACCGGATTTGATGACAATCCCCAGTTTCTCCCATGGGGACGTTTACAAGAATTTGACATCTACAGTAACCAAGCACAAGGACAGCTGCCAATCCCACCACAAACCACTGTTATATATGATGTCTCCCATAATCATTTCATGGGTGAAATACCACCACTCATATGTGAAGTGAAATCTCTCCGAGTGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1215 bp · TkA04G359570|TK1151|CDS

ATGATACTGGTGTGGATCTGGAACAACAGCAAAGAAACATTACAGGTAATTGACCTCTCCCACAACTCCATCACCGGATTTGATGACAATCCCCAGTTTCTCCCATGGGGACGTTTACAAGAATTTGACATCTACAGTAACCAAGCACAAGGACAGCTGCCAATCCCACCACAAACCACTGTTATATATGATGTCTCCCATAATCATTTCATGGGTGAAATACCACCACTCATATGTGAAGTGAAATCTCTCCGAGTGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

404 aa · TkA04G359570|TK1151|PROTEIN

MILVWIWNNSKETLQVIDLSHNSITGFDDNPQFLPWGRLQEFDIYSNQAQGQLPIPPQTTVIYDVSHNHFMGEIPPLICEVKSLRVLDLSSNSMSGTLPLCFSNLISLLVTLDLIRNKLHGRMMDVFMHGSQLKSIDLSENQFSGKMPRSLTNCTNLEILSLGDNSFKEVFPYWLGTLPNLQVLVLRANNFYGPIQGSASICSQFPKLRIIDLSNNRFSGLLHHNYFQACNAIKIVYDSESFVMVTTNIFGSITTFSPYH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G359570
TK1151 IDTkA04G359570
OH-1004 IDLXL04_037947
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 43.985
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G359570
位置Chr04:90594501-90595871 (+)
描述Similar to RLP7: Receptor-like protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47890 受体样蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At4g13810 受体样蛋白 47。 暂无已核实直接文献
At2g33060 类受体蛋白27。 暂无已核实直接文献
At4g13900 受体样蛋白 49。 暂无已核实直接文献
At3g05360 微生物相关分子模式（MAMP）受体，在flg22及核盘菌（S. sclerotiorum）培养滤液激发子1（SCLEROTINIA CULTURE FILTRATE ELICITOR1，SCFE1）等MAMP存在时，诱导BAK1依赖的针对核盘菌等坏死营养型真菌的基础免疫应答。
Arabidopsis receptor-like protein30 and receptor-like kinase suppressor of BIR1-1/EVERSHED mediate innate immunity to necrotrophic fungi.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.117010

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037947 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G45616
ath:AT1G47890
ath:AT3G11010
ath:AT4G13920
ath:AT5G27060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.873
排名 1 · TkA04G359570 · TK1151
内质网0.090
排名 2 · TkA04G359570 · TK1151
细胞质0.057
排名 3 · TkA04G359570 · TK1151
细胞核0.040
排名 4 · TkA04G359570 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA04G359570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13516LRR_612-25 aa
PF14580LRR_912-95 aa
PF13855LRR_813-29 aa
PF12799LRR_413-47 aa
PF24048LRR_NXF1-513-24 aa
PF00560LRR_114-28 aa
PF22748PexRD54_WY14-36 aa
PF24141LRR_ComC28-81 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G359570PF13516LRR_612253e-0524.5
TkA04G359570PF14580LRR_912950.006316.8
TkA04G359570PF13855LRR_813291.5e-2279.8
TkA04G359570PF12799LRR_413471.3e-2073.7
TkA04G359570PF24048LRR_NXF1-513242.6e-0627.8
TkA04G359570PF00560LRR_114282.4e-2686.8
TkA04G359570PF22748PexRD54_WY14360.1312.9
TkA04G359570PF24141LRR_ComC28810.1512.4
TkA04G359570PF00560LRR_138542.4e-2686.8
TkA04G359570PF25013LRR_Zer-159940.000123.1
TkA04G359570PF00560LRR_164792.4e-2686.8
TkA04G359570PF13516LRR_664693e-0524.5
TkA04G359570PF19181DUF5863681030.1512.6
TkA04G359570PF24758LRR_At5g56370732210.2111.9
TkA04G359570PF24048LRR_NXF1-576952.6e-0627.8
TkA04G359570PF23598LRR_14792162.7e-0523.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C699拟南芥sp|Q9C699|RLP7_ARATH Receptor-like protein 746.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SVN2拟南芥sp|Q9SVN2|RLP47_ARATH Receptor-like protein 4730.700%Swiss-Prot中等置信
F4IUU1拟南芥sp|F4IUU1|RLP27_ARATH Receptor like protein 2725.300%Swiss-Prot低置信
Q9SVM3拟南芥sp|Q9SVM3|RLP49_ARATH Receptor-like protein 4930.100%Swiss-Prot中等置信
Q9MA83拟南芥sp|Q9MA83|RLP30_ARATH Receptor-like protein 3039.900%Swiss-Prot中等置信

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