RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G341640
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 86267397-86269706 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1743 bp · TkA04G341640|TK1151|cDNA

GGGGTTTATATGAAAAATTAATTCACTCTTTTTATATATTCCAATTAAAGAAATTACAGAAAGTTGAAATATATATTCGAGATCCTTGGTGACCAATGTTTTATACTAGCAAATATCATCGAACATGGGGGCAAATTCTGTAAGAAGATCTTCGTTGCAGAAAGCAGCAATCGGATTTAAGAATGGCGGAAAGGAAAGTCAGTCACATCGGCACGTGGTGGGCTGATTCCGCCGGTTATTAATCTACCCAGTGAAACCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

981 bp · TkA04G341640|TK1151|CDS

ATGGCACAATTGCCGCCAAAAGTGCCATCAATGGCGCAGAATTGGCCGTCGTTTGCGTACCAGATGATGACGATGCCGTCTGCAGCAGCTCAGCCACCGAATTGGGTGGACGAGTTCCTTGATTTCTCGTCAGTTAGGAGGAACTCGCATCGGAGATCCGTGAGCGATCCAATTGCTTTCATCGAATCGCCGTTCATTGAGGATTGTCGGAACTCGAATGGAAATAATTCGTTGATGCCTTGCTCTAACAACACTGGATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

326 aa · TkA04G341640|TK1151|PROTEIN

MAQLPPKVPSMAQNWPSFAYQMMTMPSAAAQPPNWVDEFLDFSSVRRNSHRRSVSDPIAFIESPFIEDCRNSNGNNSLMPCSNNTGFERLDDEQFSSMFPDEGAANLPSTRSSSNPSTPSDQNSDNDEAKLKPAPPPEQQQQNHHHQLPKSEPGEVEDGGCQPETESSKPFNFSSDGTTIVDPKRVKRILANRQSAQRSRVRKLQYISELERSVTTLQTEVSTLSPRVAFLDHQRLVLNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G341640
TK1151 IDTkA04G341640
OH-1004 IDLXL04_039563
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G341640
位置Chr04:86267397-86269706 (+)
描述Similar to BZIP61: Basic leucine zipper 61
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42380 转录激活剂，参与细胞壁图案的孢子体控制和花粉发育的配子体控制。
A conserved proline residue in the leucine zipper region of AtbZIP34 and AtbZIP61 in Arabidopsis thaliana interferes with the formation of homodimer.2007 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2007.08.026
AtbZIP34 is required for Arabidopsis pollen wall patterning and the control of several metabolic pathways in developing pollen.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9493-y
At3g58120 转录激活剂。
A conserved proline residue in the leucine zipper region of AtbZIP34 and AtbZIP61 in Arabidopsis thaliana interferes with the formation of homodimer.2007 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2007.08.026

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0211800 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0756200 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0247100 转录调节因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039563 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42380
ath:AT3G58120
dosa:Os01g0211800
dosa:Os01g0756200
dosa:Os02g0247100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.976
排名 1 · TkA04G341640 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA04G341640 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA04G341640 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA04G341640 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA04G341640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18502Mrpl_C171-217 aa
PF07716bZIP_2182-229 aa
PF00170bZIP_1184-229 aa
PF03131bZIP_Maf184-235 aa
PF01496V_ATPase_I193-297 aa
PF06156YabA206-279 aa
PF28175T4SS_LegC2C7209-295 aa
PF03131bZIP_Maf234-273 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G341640PF18502Mrpl_C1712171.110.3
TkA04G341640PF07716bZIP_21822292.5e-0834.5
TkA04G341640PF00170bZIP_11842298.5e-1039.3
TkA04G341640PF03131bZIP_Maf1842350.0001123.4
TkA04G341640PF01496V_ATPase_I1932977.35.1
TkA04G341640PF06156YabA2062790.01516.6
TkA04G341640PF28175T4SS_LegC2C72092950.2410.9
TkA04G341640PF03131bZIP_Maf2342730.0001123.4
TkA04G341640PF00170bZIP_12372538.5e-1039.3
TkA04G341640PF07716bZIP_22382542.5e-0834.5
TkA04G341640PF06810Phage_scaffold2393037.47.2
TkA04G341640PF18502Mrpl_C2553001.110.3
TkA04G341640PF00170bZIP_12622758.5e-1039.3
TkA04G341640PF06156YabA2632940.01516.6
TkA04G341640PF03131bZIP_Maf2642920.0001123.4
TkA04G341640PF07716bZIP_22652742.5e-0834.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IN23拟南芥sp|F4IN23|BZP34_ARATH Basic leucine zipper 3455.400%Swiss-Prot高置信
Q9M2K4拟南芥sp|Q9M2K4|BZP61_ARATH Basic leucine zipper 6152.300%Swiss-Prot高置信
Q5QNI5水稻sp|Q5QNI5|BZP02_ORYSJ Basic leucine zipper 242.200%Swiss-Prot中等置信
Q5JMK6水稻sp|Q5JMK6|BZP06_ORYSJ Basic leucine zipper 642.200%Swiss-Prot中等置信
Q6K3R9水稻sp|Q6K3R9|BZP19_ORYSJ Basic leucine zipper 1939.300%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看