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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G339320
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 85709751-85712980 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1776 bp · TkA04G339320|TK1151|cDNA

TTATGTTTCTTCCATTGATTCATTCTCAGGCATGTTATTTCGTTTCCTTTTTGCTGTGTTCAAATTCATACGGAGATTAGTTTTTCCGATTGTTTTCATATCAGTTATCACCTAACTCTTATTATGCATACCTACCGTTTCACGGAACGACGAGATGTTTTGATCCGTTTGCAGGTTTTGGACTGTACGAAGCTTGTAGATTATTGATTTACCGTCGTTTTGAGTTTGATTACATCCAGGATCCTGAAATTTTGATATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1197 bp · TkA04G339320|TK1151|CDS

ATGGCTAAATTCAGTTGCTGTTTTGGGGGCGTAGTTTCCCCACGTGGTGGTGGTGTTCATAGAGTAAACAATAGGGGAAGCAACACTGATATTAGTGTAGAACTTTTGGATATTAACAATATGCGATTGTACACATACAAAGATTTGCAAACTGCTACACAAGATTTTAATCCCGATACCAAGATAGGACAGGGAGGTTTCGGTTCCGTTTATAAGGGACTACTTAAAGATGGCAAATTAGTTGCTATAAAGGTGCTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

398 aa · TkA04G339320|TK1151|PROTEIN

MAKFSCCFGGVVSPRGGGVHRVNNRGSNTDISVELLDINNMRLYTYKDLQTATQDFNPDTKIGQGGFGSVYKGLLKDGKLVAIKVLSTESRQGLREFLTEITVISDIQHENLVKLHGYCVEKDHRILVYGYLKNGSLDRTLLDGDDCSIKFTWEIRRKICIGVAKGLAYLHEEVQPHVIHRDIKASNILLDEDFTPKISDFGLAKLFPSHLTHVSTRIAGTQGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLLLEIVSGRPNQSK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G339320
TK1151 IDTkA04G339320
OH-1004 IDLXL04_037719
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.447 / OH-1004 66.855
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G339320
位置Chr04:85709751-85712980 (-)
描述Similar to CRPK1: Cold-responsive protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16670 冷冻耐受的负调控因子，通过磷酸化14-3-3蛋白（例如GRF6）触发其从细胞质转移到细胞核以应对冷胁迫。 暂无已核实直接文献
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At3g14840 可能的富含亮氨酸重复（LRR）受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g14840。 暂无已核实直接文献
At1g53430 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53430。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037719 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009625 response to insect 生物过程
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050826 response to freezing 生物过程
GO:0052542 defense response by callose deposition 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16670
ath:AT1G53430
ath:AT1G56130
ath:AT1G56140
ath:AT3G14840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.722
排名 1 · TkA04G339320 · TK1151
细胞质0.226
排名 2 · TkA04G339320 · TK1151
细胞核0.167
排名 3 · TkA04G339320 · TK1151
内质网0.043
排名 4 · TkA04G339320 · TK1151
高尔基体0.031
排名 5 · TkA04G339320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase58-324 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr59-325 aa
PF03109ABC160-97 aa
PF24476DUF7580144-264 aa
PF01636APH167-203 aa
PF03109ABC1168-206 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G339320PF00069Pkinase583241.3e-47163.1
TkA04G339320PF07714PK_Tyr_Ser-Thr593256.9e-46157.4
TkA04G339320PF03109ABC160973.5e-0523.8
TkA04G339320PF24476DUF75801442640.2511.7
TkA04G339320PF01636APH1672030.3511.3
TkA04G339320PF03109ABC11682063.5e-0523.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YN1拟南芥sp|Q93YN1|CRPK1_ARATH Cold-responsive protein kinase 164.200%Swiss-Prot高置信
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613051.800%Swiss-Prot高置信
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614052.200%Swiss-Prot高置信
C0LGN2拟南芥sp|C0LGN2|Y3148_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g1484050.000%Swiss-Prot高置信
C0LGG8拟南芥sp|C0LGG8|Y5343_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5343053.600%Swiss-Prot高置信

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