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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA04G314940
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 79388987-79394962 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1594 bp · TkA04G314940|TK1151|cDNA

CCCAATTAGTCCCAACTTTTTCCAAAGCCATGTTTTCCCTTCCATTTTTCATCAAGTGGTTATCGGATTTATCGTCAGTGGAGACAAGAATCGGATACGAAGAACAAAAAAAAGTTAATTCCGAGTTACAAATCCGTCTAGTGGAAGCGGAATCAAAAGTTATTGAAGGAGAAGCCTTACGCAAAAAGTTACATAACACGATACTTGAATTAAAAGGAAACATTCGAGTTTTTTGTAGAGTCCGACCGCTATTGTCGGAT...

2304 bp · TkA04G314940|TK1151|CDS

ATGGTGGGAACCGCTAATGGTAGTAGAACACCAGTTACTCCACGACAAGCTTTTTCGGTCGTCAATGGCGGTCAAGATCCGAGTATCCGTTCTGGACCCGGAAGCATTGCTGGGTCGGATTGTGGTGGGATTGAGTTTACGAGGGAAGAAGTTGAAGCATTGTTGAATATGAAGATCAGAACTAAAGATAAGTTCAATCTCAAGGAAAAATGCGAGATAATGATGGAGTACATAAAGAAGCTCAGGATGTGTGTAAGATG...

767 aa · TkA04G314940|TK1151|PROTEIN

MVGTANGSRTPVTPRQAFSVVNGGQDPSIRSGPGSIAGSDCGGIEFTREEVEALLNMKIRTKDKFNLKEKCEIMMEYIKKLRMCVRWFQEFEGELSIEHEKLKRMFESAEKRSNDMETLMNAKEEELNSIITELRTNYSILQDKFMKEETDKLAAIQTLMTEKDARLSAERLQASLTEDLEKSLRESSSANQKIISLNDMYKRLQEYNTSLQQYNSKLQTELNQTSETLKNVEREKAALTENLSNLRGYHDAQQDQLTNT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G314940
TK1151 IDTkA04G314940
OH-1004 IDLXL04_037513
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G314940
位置Chr04:79388987-79394962 (-)
描述Similar to KIN14N: Kinesin-like protein KIN-14N
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21270 驱动蛋白,以 ATP 依赖性方式支持微管运动,并具有负端定向极性。
At5g54670 类驱动蛋白KIN-14N。 暂无已核实直接文献
At4g05190 驱动蛋白,以 ATP 依赖性方式支持微管运动,并充当负端定向马达和正端跟踪蛋白。
At4g27180 类动力蛋白 KIN-14M。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0105700 类驱动蛋白KIN-14N。 暂无已核实直接文献
Os04g0629700 类动力蛋白KIN-14H。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_037513 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0009971 anastral spindle assembly involved in male meiosis 生物过程
GO:0051225 spindle assembly 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0000776 kinetochore 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005872 minus-end kinesin complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05190
ath:AT4G21270
ath:AT4G27180
ath:AT5G54670
dosa:Os07g0105700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.758
排名 1 · TkA04G314940 · TK1151
细胞核0.214
排名 2 · TkA04G314940 · TK1151
高尔基体0.115
排名 3 · TkA04G314940 · TK1151
细胞膜0.082
排名 4 · TkA04G314940 · TK1151
溶酶体/液泡0.063
排名 5 · TkA04G314940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28175T4SS_LegC2C764-163 aa
PF06156YabA66-131 aa
PF16796Microtub_bd78-143 aa
PF30677CCDC18_1st90-145 aa
PF27583BEGAIN_coil98-146 aa
PF21109Stonustoxin_helical106-158 aa
PF07889DUF1664113-117 aa
PF30677CCDC18_1st141-311 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G314940PF28175T4SS_LegC2C7641630.01814.6
TkA04G314940PF06156YabA661310.0415.2
TkA04G314940PF16796Microtub_bd781437.6e-55185.8
TkA04G314940PF30677CCDC18_1st901453.17.7
TkA04G314940PF27583BEGAIN_coil981460.0007620.6
TkA04G314940PF21109Stonustoxin_helical1061580.2112.4
TkA04G314940PF07889DUF16641131179.37.0
TkA04G314940PF30677CCDC18_1st1413113.17.7
TkA04G314940PF06156YabA1462010.0415.2
TkA04G314940PF20186DUF65491592220.001819.1
TkA04G314940PF00225Kinesin1702182.4e-112375.9
TkA04G314940PF08759GT-D1732770.1712.4
TkA04G314940PF06156YabA1762460.0415.2
TkA04G314940PF27583BEGAIN_coil1772460.0007620.6
TkA04G314940PF28175T4SS_LegC2C71773740.01814.6
TkA04G314940PF21109Stonustoxin_helical1932450.2112.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q07970拟南芥sp|Q07970|KN14C_ARATH Kinesin-like protein KIN-14C64.000%Swiss-Prot高置信
P46875拟南芥sp|P46875|KN14N_ARATH Kinesin-like protein KIN-14N57.300%Swiss-Prot高置信
F4JGP4拟南芥sp|F4JGP4|KN14D_ARATH Kinesin-like protein KIN-14D60.900%Swiss-Prot高置信
P46864拟南芥sp|P46864|KN14M_ARATH Kinesin-like protein KIN-14M51.600%Swiss-Prot高置信
A3BFT0水稻sp|A3BFT0|KN14N_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14N56.300%Swiss-Prot高置信
Q0J9V3水稻sp|Q0J9V3|KN14H_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14H69.200%Swiss-Prot高置信

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