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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G306370
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 77333665-77344037 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2329 bp · TkA04G306370|TK1151|cDNA

CTGTAATTTACTCTGGAATAAATAAAGTAGAAACGAACACCTTATGCAAAACTCCTAATATTTGGCAGACTCTCAATGGACACAAAACAAAGCACATTTCTTTTTTCACAAGATGAAGGTGGACAACATAAAGACTCTCAAAAAGTCAAAATCGCTGACTTCCTACTTCCTTCTTCCTCTTGACCACATTCGACCCAATCAAACCGCGTACAGTTTCTTGGAAGATTCCATTCTTTTAAATCTTGACGATTTCAAGTATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1569 bp · TkA04G306370|TK1151|CDS

ATGGGGCTATGCAGTAGCAAAAGCAAGAGTGGAGGGACATACCCAGATGCTCACAGACCAAGATCCGTCGAACCCAAAATAGTTTACAGCAAATCGCCAGCTCCGGCAGCCCAAATTCCGGCGAGAAAGCAACACCAGCCGCCGCCGCCCAGCCCCAAAAGGATATTCAAAGCCGACCCAAACTCAATTATCGGCAAACCATTTGAAGATGTTAAACAACACTACACAATGGGGAAAGAATTGGGTAGAGGTCAATTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

522 aa · TkA04G306370|TK1151|PROTEIN

MGLCSSKSKSGGTYPDAHRPRSVEPKIVYSKSPAPAAQIPARKQHQPPPPSPKRIFKADPNSIIGKPFEDVKQHYTMGKELGRGQFGVTYLCIEKSTGHKYACKSISKKKLVTKSDKDDMRKEIQIMQHLSGQANIVEFKGAYEDKQSVHLVMEVCEGGELFDRIIAEGHYSERAAASICRSIVNVVHVCHFMGVMHRDLKPENFLLSDKSEKALLKATDFGLSVFIQEGKAYRQVVGSAYYVAPEVLTRKYGKEIDIWS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G306370
TK1151 IDTkA04G306370
OH-1004 IDLXL04_037425
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.808 / OH-1004 40.015
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G306370
位置Chr04:77333665-77344037 (-)
描述Similar to CPK9: Calcium-dependent protein kinase 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g20410 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g50700 Ca²⁺-依赖性蛋白激酶。
THI1, a Thiamine Thiazole Synthase, Interacts with Ca2+-Dependent Protein Kinase CPK33 and Modulates the S-Type Anion Channels and Stomatal Closure in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01649
At4g04720 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0515100 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037425 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50700
ath:AT3G20410
dosa:Os07g0515100
osa:4343373
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.486
排名 1 · TkA04G306370 · TK1151
细胞质0.441
排名 2 · TkA04G306370 · TK1151
细胞核0.221
排名 3 · TkA04G306370 · TK1151
高尔基体0.086
排名 4 · TkA04G306370 · TK1151
内质网0.061
排名 5 · TkA04G306370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like73-132 aa
PF00069Pkinase75-333 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr76-329 aa
PF23564EF-hand_FSTL1114-133 aa
PF06293Kdo147-213 aa
PF03109ABC1150-230 aa
PF14531Kinase-like172-286 aa
PF03250Tropomodulin200-221 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G306370PF14531Kinase-like731320.0009919.2
TkA04G306370PF00069Pkinase753337e-78262.4
TkA04G306370PF07714PK_Tyr_Ser-Thr763295.4e-29102.0
TkA04G306370PF23564EF-hand_FSTL11141336.9e-0627.2
TkA04G306370PF06293Kdo1472130.0005820.1
TkA04G306370PF03109ABC11502300.002817.6
TkA04G306370PF14531Kinase-like1722860.0009919.2
TkA04G306370PF03250Tropomodulin2002210.09513.3
TkA04G306370PF13833EF-hand_82842951.7e-1763.6
TkA04G306370PF06293Kdo3523690.0005820.1
TkA04G306370PF03250Tropomodulin3573930.09513.3
TkA04G306370PF10591SPARC_Ca_bdg3654393.1e-0834.6
TkA04G306370PF13833EF-hand_83674011.7e-1763.6
TkA04G306370PF21008AIF-13714412.3e-0835.1
TkA04G306370PF25825SAPC2_N3734230.0005620.4
TkA04G306370PF25578EF-hand_STIM13734010.00218.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38868拟南芥sp|Q38868|CDPK9_ARATH Calcium-dependent protein kinase 978.100%Swiss-Prot高置信
Q9C6P3拟南芥sp|Q9C6P3|CDPKX_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3378.400%Swiss-Prot高置信
Q9ZSA2拟南芥sp|Q9ZSA2|CDPKL_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2175.900%Swiss-Prot高置信
P53683水稻sp|P53683|CDPKJ_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1970.500%Swiss-Prot高置信

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