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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G305750
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 77196272-77204192 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3102 bp · TkA04G305750|TK1151|cDNA

TTTATATGTTCTTTCTATCCAATTATTTATTGAAGAGTGACGTGGTGTATTTGTTGCTTTTGCTGTTCACCCACTTGCGGTTCGATTGCCTTTGGCCTTTTTTGTCGGTATTTTACGTCCGTTTATTTCTCCGGCATCTTCAACTCGCCGCCTTACTCGTTTCCTTCGTTCCTCAAGCGAACTTGACCGCCGTTGTTTACTCCCTTTGCCGGACGTTTTCCAAACACAGTTGCATACCTACGGAAAGATGCACAAAAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2346 bp · TkA04G305750|TK1151|CDS

ATGAAAGAGTTCGAGCACCTTAGAGTACCACTTGACATCATAAAACATGCTACCAACAACTTTGGTGCGACCAACTTCATCGCCGAAGGTGGATTCGGAAAGGTATACAAAGGAGAATTTCAAGGAGAAGTGTTTTTCCATTCTCATGGCCGGAATATTGGTGCTGTAAAGATCTTGGATCGATCAAAAGATCAAGCAGATGTTTCATTTTGGAGAGAGATCATGTTGCTATCCAGTTATCGTCATGAAAATCTCATCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

781 aa · TkA04G305750|TK1151|PROTEIN

MKEFEHLRVPLDIIKHATNNFGATNFIAEGGFGKVYKGEFQGEVFFHSHGRNIGAVKILDRSKDQADVSFWREIMLLSSYRHENLISLLGFCDERDKRIIVYEYASNKSLDFHLCSPDLTWLQRLKICLGAACGLQYLHDPRGTQQRVLHRDIKSANILLDENWNAKIADFGLSKHGPANQQYTFLFSEAKGTLGYCDPMYVETMLLTKESDVYSFGVVLFEVLCSRHCVDYSYNDERRSLPVLVKKCYREKSLHTIIDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G305750
TK1151 IDTkA04G305750
OH-1004 IDLXL04_037425
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 59.985
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G305750
位置Chr04:77196272-77204192 (-)
描述Similar to CPK9: Calcium-dependent protein kinase 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g20410 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g50700 Ca²⁺-依赖性蛋白激酶。
THI1, a Thiamine Thiazole Synthase, Interacts with Ca2+-Dependent Protein Kinase CPK33 and Modulates the S-Type Anion Channels and Stomatal Closure in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01649
At4g04720 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0515100 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037425 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50700
ath:AT3G20410
dosa:Os07g0515100
osa:4343373
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.469
排名 1 · TkA04G305750 · TK1151
细胞膜0.356
排名 2 · TkA04G305750 · TK1151
细胞核0.265
排名 3 · TkA04G305750 · TK1151
高尔基体0.069
排名 4 · TkA04G305750 · TK1151
内质网0.064
排名 5 · TkA04G305750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr26-299 aa
PF00069Pkinase27-297 aa
PF01636APH141-179 aa
PF03109ABC1145-183 aa
PF14531Kinase-like146-227 aa
PF06293Kdo148-164 aa
PF21008AIF-1252-320 aa
PF00069Pkinase337-595 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G305750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr262991.3e-68231.8
TkA04G305750PF00069Pkinase272976.6e-117390.3
TkA04G305750PF01636APH1411792e-0525.2
TkA04G305750PF03109ABC11451839.9e-0522.3
TkA04G305750PF14531Kinase-like1462270.0001621.7
TkA04G305750PF06293Kdo1481640.001518.8
TkA04G305750PF21008AIF-12523201.2e-0732.8
TkA04G305750PF00069Pkinase3375956.6e-117390.3
TkA04G305750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3395911.3e-68231.8
TkA04G305750PF01636APH3454252e-0525.2
TkA04G305750PF06293Kdo4124750.001518.8
TkA04G305750PF03109ABC14134919.9e-0522.3
TkA04G305750PF14531Kinase-like4275470.0001621.7
TkA04G305750PF01636APH4564712e-0525.2
TkA04G305750PF13833EF-hand_85465571e-1454.7
TkA04G305750PF25578EF-hand_STIM16346620.04414.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38868拟南芥sp|Q38868|CDPK9_ARATH Calcium-dependent protein kinase 976.800%Swiss-Prot中等置信
Q9C6P3拟南芥sp|Q9C6P3|CDPKX_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3376.300%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSA2拟南芥sp|Q9ZSA2|CDPKL_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2173.100%Swiss-Prot中等置信
P53683水稻sp|P53683|CDPKJ_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1976.700%Swiss-Prot中等置信

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