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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G237380
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 60276277-60276716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

333 bp · TkA04G237380|TK1151|cDNA

ATGCGTGGACATCTCACGGAAAAAGCTGACGTGTTTGGGTTTGGAGTTGTGGCCTTTGAGATTATTAGTGGTAGGCCCAATTCCGATTCAAGTTTCGAAGAGGATAAAATATATCTTCTCGAATGGGCATGGAACCTACACGAAGCTAACCGTGAAATCGAGTTGGTGGATGAAGAACTATCTGAATTTGATGAAAACGAAGTGAAAAGAGTAACAAGAGTTGCTTTTTTATGCACGCAAACATCTCCAATAGAACGACC...

CDS

下载 CDS FASTA

333 bp · TkA04G237380|TK1151|CDS

ATGCGTGGACATCTCACGGAAAAAGCTGACGTGTTTGGGTTTGGAGTTGTGGCCTTTGAGATTATTAGTGGTAGGCCCAATTCCGATTCAAGTTTCGAAGAGGATAAAATATATCTTCTCGAATGGGCATGGAACCTACACGAAGCTAACCGTGAAATCGAGTTGGTGGATGAAGAACTATCTGAATTTGATGAAAACGAAGTGAAAAGAGTAACAAGAGTTGCTTTTTTATGCACGCAAACATCTCCAATAGAACGACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

110 aa · TkA04G237380|TK1151|PROTEIN

MRGHLTEKADVFGFGVVAFEIISGRPNSDSSFEEDKIYLLEWAWNLHEANREIELVDEELSEFDENEVKRVTRVAFLCTQTSPIERPSMSPVVAMISGDIEASGDITRPG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G237380
TK1151 IDTkA04G237380
OH-1004 IDLXL04_039500
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 49.774
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G237380
位置Chr04:60276277-60276716 (+)
描述Similar to At1g56140: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g53420 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53420。 暂无已核实直接文献
At1g16670 冷冻耐受的负调控因子，通过磷酸化14-3-3蛋白（例如GRF6）触发其从细胞质转移到细胞核以应对冷胁迫。 暂无已核实直接文献
At1g34210 参与油菜素甾醇依赖和非依赖信号通路的丝氨酸/苏氨酸激酶。
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039500 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0052542 defense response by callose deposition 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0033612 receptor serine/threonine kinase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07650
ath:AT1G53430
ath:AT1G53440
ath:AT1G56130
ath:AT1G56140
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.444
排名 1 · TkA04G237380 · TK1151
细胞质0.401
排名 2 · TkA04G237380 · TK1151
细胞核0.196
排名 3 · TkA04G237380 · TK1151
内质网0.066
排名 4 · TkA04G237380 · TK1151
高尔基体0.064
排名 5 · TkA04G237380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3-94 aa
PF00069Pkinase4-92 aa
PF23764Beta-barrel_GLAA-B_II48-74 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G237380PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3944.8e-0523.5
TkA04G237380PF00069Pkinase4920.05513.6
TkA04G237380PF23764Beta-barrel_GLAA-B_II48740.03715.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614062.700%Swiss-Prot高置信
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613064.000%Swiss-Prot高置信
C0LGG7拟南芥sp|C0LGG7|Y1534_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5342047.500%Swiss-Prot中等置信
Q93YN1拟南芥sp|Q93YN1|CRPK1_ARATH Cold-responsive protein kinase 145.500%Swiss-Prot中等置信
Q9XIC7拟南芥sp|Q9XIC7|SERK2_ARATH Somatic embryogenesis receptor kinase 243.000%Swiss-Prot中等置信

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