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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G190820
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 49224515-49233848 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1629 bp · TkA04G190820|TK1151|cDNA

ATGGGCGAATGTTGGTCTTGGCAGATGTGGATGTTCACCGGCGTTAGATGGAAAGATGAGAGAATTGAGAGCTTTTCATCCAGTGGTACAATGAAAATCGTTGATTGGCTTGCGGAAACCTTTAAGAGGGACGAAGGTATCGATCTTCTTAAAGATAAACAAGTGCTTCAACGACTCACAGAGACTGCTGAAAAAGCAAAAAAGGAGCTTTCCACTTTGACCCAAACTAATATCAGGTATCAAGCTACTGAATGGCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1629 bp · TkA04G190820|TK1151|CDS

ATGGGCGAATGTTGGTCTTGGCAGATGTGGATGTTCACCGGCGTTAGATGGAAAGATGAGAGAATTGAGAGCTTTTCATCCAGTGGTACAATGAAAATCGTTGATTGGCTTGCGGAAACCTTTAAGAGGGACGAAGGTATCGATCTTCTTAAAGATAAACAAGTGCTTCAACGACTCACAGAGACTGCTGAAAAAGCAAAAAAGGAGCTTTCCACTTTGACCCAAACTAATATCAGGTATCAAGCTACTGAATGGCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

542 aa · TkA04G190820|TK1151|PROTEIN

MGECWSWQMWMFTGVRWKDERIESFSSSGTMKIVDWLAETFKRDEGIDLLKDKQVLQRLTETAEKAKKELSTLTQTNIRYQATEWLKSFVGSLGISKQPLEKELISCLRKGLIFCNTISGVQPGSVPKPIFENVCNLLKAIKGLNLPTLEGELFDALRCQLYDSTKKFIMATLSSISGLASAMGPALDKSSKMFQHVNGMAQIKQATYGNVDMDFVLGVAEWEVMIFTELILKFHQMVLIAMSMNMGMVFITFRNVSGIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G190820
TK1151 IDTkA04G190820
OH-1004 IDLXL04_038515
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)79.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 43.173 / OH-1004 38.715
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G190820
位置Chr04:49224515-49233848 (+)
描述Similar to CHSP70: Stromal 70 kDa heat shock-related protein, chloroplastic (Fragment)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49910 在发芽种子的耐热性方面与 HSP70-6 互补作用。
Arabidopsis stromal 70-kD heat shock proteins are essential for plant development and important for thermotolerance of germinating seeds.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.114496
Stromal Hsp70 is important for protein translocation into pea and Arabidopsis chloroplasts.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071415
Arabidopsis stromal 70-kDa heat shock proteins are essential for chloroplast development.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1192-z
At4g24280 在发芽种子的耐热性方面与 HSP70-7 互补作用。
Arabidopsis stromal 70-kD heat shock proteins are essential for plant development and important for thermotolerance of germinating seeds.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.114496
Stromal Hsp70 is important for protein translocation into pea and Arabidopsis chloroplasts.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071415
Arabidopsis stromal 70-kDa heat shock proteins are essential for chloroplast development.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1192-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038515 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24280
ath:AT5G49910
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.383
排名 1 · TkA04G190820 · TK1151
细胞核0.288
排名 2 · TkA04G190820 · TK1151
线粒体0.194
排名 3 · TkA04G190820 · TK1151
细胞膜0.114
排名 4 · TkA04G190820 · TK1151
内质网0.078
排名 5 · TkA04G190820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17889NLRC4_HD25-80 aa
PF00012HSP7032-81 aa
PF14223Retrotran_gag_244-70 aa
PF00307CH80-176 aa
PF14223Retrotran_gag_2288-385 aa
PF17889NLRC4_HD319-339 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G190820PF17889NLRC4_HD25800.2312.5
TkA04G190820PF00012HSP7032811.1e-1144.4
TkA04G190820PF14223Retrotran_gag_244709.9e-1245.6
TkA04G190820PF00307CH801760.001719.2
TkA04G190820PF14223Retrotran_gag_22883859.9e-1245.6
TkA04G190820PF17889NLRC4_HD3193390.2312.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTX9拟南芥sp|Q9LTX9|HSP7G_ARATH Heat shock 70 kDa protein 7, chloroplastic80.900%Swiss-Prot低置信
Q9STW6拟南芥sp|Q9STW6|HSP7F_ARATH Heat shock 70 kDa protein 6, chloroplastic78.700%Swiss-Prot低置信

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