TkA04G163160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G163160

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 42139709-42151987 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1983 bp · TkA04G163160|TK1151|cDNA

TTTTGCTGTTTGGGTCAAAATCTCATCTTCAATCCGTTTATGAACGTACTCAATAGTGGCAGGTTTAAGTTCAAGTATGAAACCACGTCATTTAGGCGAAGAATCCCGTGGAGTATTAACGGCCTTATAAACCAAAACTCGGAACATAGAGTCAGTACGAAACAGCAACGGTGGTTGGTTCCCGCCGAATTGTACTCCCACTCTTGATTTTGGTTGCCGATGCAAAATTGGAACTAAAGATCCAGTTCCCAATGATTTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1398 bp · TkA04G163160|TK1151|CDS

ATGATTTCGAGCATGTGTGTAGTACATAACCAGTTCGTGTTCCCTGGCCAACCGGCGCATCTAAAGGTCCCTTTGCTTGAACTGAAACCATCGGCGTTGCAGTCCGAACTTGACAGAAAACGTCATTCCGCAATCGTCACTGCAGCATCCTCTTCATTCGCTGGCTCCGGCGCTGAATATTCTGAACCATTGCCCACAGTCCGGAAGAAGAAAGCAAGGAGAATAGTTGGCATAGACCAGGATGAACTAGTCGACCCCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

465 aa · TkA04G163160|TK1151|PROTEIN

MISSMCVVHNQFVFPGQPAHLKVPLLELKPSALQSELDRKRHSAIVTAASSSFAGSGAEYSEPLPTVRKKKARRIVGIDQDELVDPKLLADDDSCFCEFQGLQLHHKICEPESESQDSIQYDATSDSSYHNEKVSFPLILLHGFGASLFSWNTVMKRLAKISGSKVLSFDRPAFGLTSRVENPSKHAPSSDGQDTKPLNPYSMAFSVLATLYFIDFLTAEKAILVGHSAGCLVAAQTYFKAPERVAAMILVAPAIIAPLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G163160`
TK1151 ID	TkA04G163160
OH-1004 ID	LXL04_035147
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 87.527 / OH-1004 89.648 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA04G163160`
位置	Chr04:42139709-42151987 (-)
描述	Similar to abhd-5.2: Abhydrolase domain-containing protein abhd-5.2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_035147` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006654 phosphatidic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程 GO:0055088 lipid homeostasis 生物过程 GO:0005811 lipid droplet 细胞组分 GO:0004620 glycerophospholipase activity 分子功能 GO:0042171 lysophosphatidic acid acyltransferase activity 分子功能 GO:0052689 carboxylic ester hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	cel:CELE_C37H5.2 cel:CELE_C37H5.3 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.973

排名 1 · TkA04G163160 · TK1151

线粒体0.030

排名 2 · TkA04G163160 · TK1151

细胞质0.026

排名 3 · TkA04G163160 · TK1151

过氧化物酶体0.023

排名 4 · TkA04G163160 · TK1151

细胞核0.021

排名 5 · TkA04G163160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00326Peptidase_S9114-143 aa

PF02230Abhydrolase_2136-157 aa

PF00561Abhydrolase_1137-449 aa

PF12697Abhydrolase_6138-453 aa

PF12146Hydrolase_4138-259 aa

PF20408Abhydrolase_11138-252 aa

PF03959FSH1139-160 aa

PF07859Abhydrolase_3147-170 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G163160	`PF00326`	Peptidase_S9	114	143	0.00027	21.2
TkA04G163160	`PF02230`	Abhydrolase_2	136	157	0.0013	19.3
TkA04G163160	`PF00561`	Abhydrolase_1	137	449	2.2e-23	83.9
TkA04G163160	`PF12697`	Abhydrolase_6	138	453	3e-22	81.1
TkA04G163160	`PF12146`	Hydrolase_4	138	259	1e-12	48.6
TkA04G163160	`PF20408`	Abhydrolase_11	138	252	0.017	15.6
TkA04G163160	`PF03959`	FSH1	139	160	0.051	14.0
TkA04G163160	`PF07859`	Abhydrolase_3	147	170	0.068	13.6
TkA04G163160	`PF03096`	Ndr	214	254	0.00011	21.7
TkA04G163160	`PF00326`	Peptidase_S9	216	253	0.00027	21.2
TkA04G163160	`PF02230`	Abhydrolase_2	217	262	0.0013	19.3
TkA04G163160	`PF10230`	LIDHydrolase	219	320	0.001	19.6
TkA04G163160	`PF20434`	BD-FAE	219	235	0.046	13.9
TkA04G163160	`PF07859`	Abhydrolase_3	219	261	0.068	13.6
TkA04G163160	`PF06821`	Ser_hydrolase	220	272	1.7e-08	35.3
TkA04G163160	`PF03959`	FSH1	224	235	0.051	14.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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