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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G162320
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 41911701-41917761 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3774 bp · TkA04G162320|TK1151|cDNA

CCACCGCGGTGCAAAAACCTCCACTTCCGCTGTTTACTTCAACTCCATTACCCCTCGGTTTGGATGATCGATTCACATCTCCGATCAACTTTTCCCTAAAACATCTTAAAGGAGTTCACATCTGGATCCTATCTGAACTCTTAAGGAGATGAACAGAGAAAGTTTCGGTTTAGGAGAACTATCAGATGAGCAAAGGGCTCGAATTTCCAGAAATTTCAGAGCTGCGAAGGCTCTTCTTGATCGCAAACGCCCTCGAGACG...

CDS

下载 CDS FASTA

3432 bp · TkA04G162320|TK1151|CDS

ATGAACAGAGAAAGTTTCGGTTTAGGAGAACTATCAGATGAGCAAAGGGCTCGAATTTCCAGAAATTTCAGAGCTGCGAAGGCTCTTCTTGATCGCAAACGCCCTCGAGACGCCTCCAGCCCCTCCAGTTACTATCCTCGAAAAATCGGGATTGTGAAGGAGGCTATAACTCCATCGGATGCTGGCTGTGTCAATAGAGTGCCTCTTTCAAACATTTCAGTGAATACTCCCACTCCTGTTAGGAATCTTAAGTTGAATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1143 aa · TkA04G162320|TK1151|PROTEIN

MNRESFGLGELSDEQRARISRNFRAAKALLDRKRPRDASSPSSYYPRKIGIVKEAITPSDAGCVNRVPLSNISVNTPTPVRNLKLNQNVCLSSSNFKVPCVGKTEMRILADEKEKENEKVHSSFHTPIRQINNSETTFQTPISYNGGSHTPKENNPSLDSFKTPIRPVNSNVTPISQQPCSSFNDSSTIMPSIFYEDFDDFFLAEVDELCESRTKSKIVTADSTPDTQLKKTHTENSNHELKLNLSPVGIDKFQNDNIFE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G162320
TK1151 IDTkA04G162320
OH-1004 IDLXL04_035156
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G162320
位置Chr04:41911701-41917761 (-)
描述Similar to SRS2: ATP-dependent DNA helicase SRS2-like protein At4g25120
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25120 ATP 依赖性 3'- 至 5'-DNA 解旋酶，可破坏重组 DNA 中间体并促进单链退火。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035156 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000725 recombinational repair 生物过程
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0009314 response to radiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0033202 DNA helicase complex 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003678 DNA helicase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0043138 3'-5' DNA helicase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G25120
sau:SA1721
sav:SAV1905
sep:SE_1590
ser:SERP1443
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.792
排名 1 · TkA04G162320 · TK1151
细胞质0.211
排名 2 · TkA04G162320 · TK1151
线粒体0.093
排名 3 · TkA04G162320 · TK1151
细胞膜0.019
排名 4 · TkA04G162320 · TK1151
内质网0.010
排名 5 · TkA04G162320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00580UvrD-helicase273-536 aa
PF13604AAA_30273-348 aa
PF13086AAA_11273-368 aa
PF13245AAA_19288-520 aa
PF04851ResIII288-346 aa
PF01443Viral_helicase1291-304 aa
PF13087AAA_12307-356 aa
PF13604AAA_30473-516 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G162320PF00580UvrD-helicase2735366.7e-67226.7
TkA04G162320PF13604AAA_302733487.9e-0833.0
TkA04G162320PF13086AAA_112733680.004317.6
TkA04G162320PF13245AAA_192885202.3e-2383.6
TkA04G162320PF04851ResIII2883460.411.3
TkA04G162320PF01443Viral_helicase12913041.8e-0731.9
TkA04G162320PF13087AAA_123073563e-0524.4
TkA04G162320PF13604AAA_304735167.9e-0833.0
TkA04G162320PF01443Viral_helicase14756221.8e-0731.9
TkA04G162320PF13087AAA_125305643e-0524.4
TkA04G162320PF13361UvrD_C5419171.1e-44154.1
TkA04G162320PF01443Viral_helicase18299151.8e-0731.9
TkA04G162320PF04851ResIII8328610.411.3
TkA04G162320PF13087AAA_128449153e-0524.4
TkA04G162320PF13538UvrD_C_28518767e-1452.1
TkA04G162320PF13538UvrD_C_28919147e-1452.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
D1KF50拟南芥sp|D1KF50|SRS2L_ARATH ATP-dependent DNA helicase SRS2-like protein At4g2512057.400%Swiss-Prot高置信

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