TkA04G144010 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G144010

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 37273761-37279427 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1899 bp · TkA04G144010|TK1151|cDNA

ATGGCGATGGCCACCGGACTAGGAACCTCCTTTTGTTCTCTTCCCTCACTCCAAAGACTCACCACCGCTACCACCAATGCCGCATCTTTCTCTTTTTTCAAGCTATCTTCTCCGTCGTCCCCCCTGTTCGTCTCCACTAGGCTACCTCCAAGTAATCGACAACACTATTCCGCAACAAAAGCGTCTTCTTCTACAACCTTCACCGAGTCTCAAGATCTGAAGGTTAATACAATTACCACGAAGCCGATAGAAGGTCAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1899 bp · TkA04G144010|TK1151|CDS

ATGGCGATGGCCACCGGACTAGGAACCTCCTTTTGTTCTCTTCCCTCACTCCAAAGACTCACCACCGCTACCACCAATGCCGCATCTTTCTCTTTTTTCAAGCTATCTTCTCCGTCGTCCCCCCTGTTCGTCTCCACTAGGCTACCTCCAAGTAATCGACAACACTATTCCGCAACAAAAGCGTCTTCTTCTACAACCTTCACCGAGTCTCAAGATCTGAAGGTTAATACAATTACCACGAAGCCGATAGAAGGTCAGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

632 aa · TkA04G144010|TK1151|PROTEIN

MAMATGLGTSFCSLPSLQRLTTATTNAASFSFFKLSSPSSPLFVSTRLPPSNRQHYSATKASSSTTFTESQDLKVNTITTKPIEGQKTGTSGLRKKVKVFMQENYLANWIQALFNSLPPEDYKNALLVLGGDGRYFNKEAAQLIIKIAAGNGVGKILVGKDGILSTPAANGGFIMSASHNPGGPEYDWGIKFNYSSGQPAPESITDMIYGNTLSISEIKLADIPDVDLSSVGVTKFGNFSVEVVDPVSDYLELMENVFDF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G144010`
TK1151 ID	TkA04G144010
OH-1004 ID	LXL04_035310
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G144010

位置 Chr04:37273761-37279427 (-)

描述 Similar to PGMP: Phosphoglucomutase, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g51820`	催化 α-D-葡萄糖-1-磷酸和 α-D-葡萄糖-6-磷酸之间的可逆异构化反应。	The plastidic phosphoglucomutase from Arabidopsis. A reversible enzyme reaction with an important role in metabolic control.2000 · DOI: 10.1104/pp.122.4.1193

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程

GO:0005986 sucrose biosynthetic process 生物过程

GO:0006006 glucose metabolic process 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009590 detection of gravity 生物过程

GO:0019252 starch biosynthetic process 生物过程

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0010319 stromule 细胞组分

GO:0048046 apoplast 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G51820

bna:106423685

sot:102585015

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.497

排名 1 · TkA04G144010 · TK1151

质体0.255

排名 2 · TkA04G144010 · TK1151

细胞核0.147

排名 3 · TkA04G144010 · TK1151

过氧化物酶体0.103

排名 4 · TkA04G144010 · TK1151

内质网0.084

排名 5 · TkA04G144010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02878PGM_PMM_I86-216 aa

PF00408PGM_PMM_IV124-136 aa

PF02879PGM_PMM_II140-158 aa

PF17936Big_6140-162 aa

PF17936Big_6207-245 aa

PF02879PGM_PMM_II249-353 aa

PF02880PGM_PMM_III361-483 aa

PF24947PGM1_C_vert_fung485-617 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G144010	`PF02878`	PGM_PMM_I	86	216	1.2e-25	90.6
TkA04G144010	`PF00408`	PGM_PMM_IV	124	136	0.0014	19.3
TkA04G144010	`PF02879`	PGM_PMM_II	140	158	6.5e-11	43.3
TkA04G144010	`PF17936`	Big_6	140	162	0.32	12.0
TkA04G144010	`PF17936`	Big_6	207	245	0.32	12.0
TkA04G144010	`PF02879`	PGM_PMM_II	249	353	6.5e-11	43.3
TkA04G144010	`PF02880`	PGM_PMM_III	361	483	8e-23	81.5
TkA04G144010	`PF24947`	PGM1_C_vert_fung	485	617	1.9e-50	171.5
TkA04G144010	`PF00408`	PGM_PMM_IV	542	593	0.0014	19.3
TkA04G144010	`PF17936`	Big_6	561	575	0.32	12.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SCY0`	拟南芥	sp\|Q9SCY0\|PGMP_ARATH Phosphoglucomutase, chloroplastic	84.200%	Swiss-Prot	高置信

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