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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G139400
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 36121087-36122597 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

720 bp · TkA04G139400|TK1151|cDNA

ATGGCACCAGTAGATAAACAAGCAGAGCAACCAGATGATACCATGGCTGATGAAGATGATACTCAAGGTCCAGATGAAGATGAACAACAACTGAACCGTGTAAAGGAGTGGATTAGTTCCTACCATCTAGACAATCTTGATGTCACTGATGTTCTCTCAAATTTCCCTGATATCTCACTGGTAACCATAATAAAGGTGATGAACAAACTTGTTAATGAAGGCATTCTTTCAAAATCCGGAACCGATAGTTTCAACATCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

720 bp · TkA04G139400|TK1151|CDS

ATGGCACCAGTAGATAAACAAGCAGAGCAACCAGATGATACCATGGCTGATGAAGATGATACTCAAGGTCCAGATGAAGATGAACAACAACTGAACCGTGTAAAGGAGTGGATTAGTTCCTACCATCTAGACAATCTTGATGTCACTGATGTTCTCTCAAATTTCCCTGATATCTCACTGGTAACCATAATAAAGGTGATGAACAAACTTGTTAATGAAGGCATTCTTTCAAAATCCGGAACCGATAGTTTCAACATCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

239 aa · TkA04G139400|TK1151|PROTEIN

MAPVDKQAEQPDDTMADEDDTQGPDEDEQQLNRVKEWISSYHLDNLDVTDVLSNFPDISLVTIIKVMNKLVNEGILSKSGTDSFNIKRPRSYNYYRKTEFEFDAVKEEGEKKSPSTMLDGDMYMKALFHALPMDYITIPKLQSKLGGEVNQTMVRKLMDKMTKDGFIETSSSRRLGKRVVHYEITNKKLDEVRKALDFDASENLAADIFIYWEIWSNRSTVGAFHSIGSERTRSSGRPF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G139400
TK1151 IDTkA04G139400
OH-1004 IDLXL04_011387
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.582 / OH-1004 39.123
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G139400
位置Chr04:36121087-36122597 (-)
描述Similar to ASY1: Meiosis-specific protein ASY1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: F4HRV8 对雌雄配子体的正常减数分裂是必需的。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0506800 减数分裂同源染色体配对的重要因子。
An insertional mutation in the rice PAIR2 gene, the ortholog of Arabidopsis ASY1, results in a defect in homologous chromosome pairing during meiosis.2004 · DOI: 10.1007/s00438-003-0934-z
PAIR2 is essential for homologous chromosome synapsis in rice meiosis I.2006 · DOI: 10.1242/jcs.02736
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011387 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007129 homologous chromosome pairing at meiosis 生物过程
GO:0007130 synaptonemal complex assembly 生物过程
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010439 regulation of glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0051026 chiasma assembly 生物过程
GO:0051598 meiotic recombination checkpoint signaling 生物过程
GO:0000228 nuclear chromosome 细胞组分
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06620
ath:AT1G06650
ath:AT1G67370
ath:AT2G25450
dosa:Os09g0506800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.456
排名 1 · TkA04G139400 · TK1151
细胞质0.450
排名 2 · TkA04G139400 · TK1151
内质网0.073
排名 3 · TkA04G139400 · TK1151
线粒体0.068
排名 4 · TkA04G139400 · TK1151
细胞膜0.062
排名 5 · TkA04G139400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08679DsrD48-76 aa
PF21984DnaD_N51-92 aa
PF02082Rrf252-76 aa
PF13545HTH_Crp_252-88 aa
PF03551PadR55-98 aa
PF13463HTH_2758-80 aa
PF27731UCP02950258-86 aa
PF21980MksE62-89 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G139400PF08679DsrD48760.004717.9
TkA04G139400PF21984DnaD_N51920.212.5
TkA04G139400PF02082Rrf252760.06614.1
TkA04G139400PF13545HTH_Crp_252880.1113.2
TkA04G139400PF03551PadR55980.00119.7
TkA04G139400PF13463HTH_2758800.01116.8
TkA04G139400PF27731UCP02950258860.2412.3
TkA04G139400PF21980MksE62890.04314.9
TkA04G139400PF21984DnaD_N1341840.212.5
TkA04G139400PF03551PadR1401860.00119.7
TkA04G139400PF21980MksE1411700.04314.9
TkA04G139400PF08679DsrD1481700.004717.9
TkA04G139400PF02082Rrf21481700.06614.1
TkA04G139400PF13463HTH_271491870.01116.8
TkA04G139400PF13545HTH_Crp_21531710.1113.2
TkA04G139400PF27731UCP0295021531680.2412.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HRV8拟南芥sp|F4HRV8|ASY1_ARATH Meiosis-specific protein ASY148.400%Swiss-Prot中等置信
Q76CY8水稻sp|Q76CY8|PAIR2_ORYSJ Meiosis-specific protein PAIR240.500%Swiss-Prot中等置信

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