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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G129870
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 33813387-33817748 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3399 bp · TkA04G129870|TK1151|cDNA

AACCTCTAATGCACAATGTACAACCCCATGACAAAAAGAGCTGTGCACCGACCCTAATGAATGATTAAGTTTCCTTCCTTCGTCTCTTGAAAATAATGCTCTGCTCAAATTACTACCAGTAACAGTGTAACACCAATCTCTCTCTTTGTCTTTCCCTTTCTCTCTCTCTGCTGTTAATTACAAGATTTGCTCAGCCATATCTGGAGCAAAGCAATATACAAGTGTAGCCATTCTACCAATTCCAGTTCCGGCTGCATCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2661 bp · TkA04G129870|TK1151|CDS

ATGTCTGCTAAATCCAAATCTTCTTCTTCTGAAACTCCTCCCGCCACCAAAATCCCGATCAGTAAAACATCACCGGCAACACCCAGAGTGAGTAAACTTAACAGGGGAGTTGCTAAATCCGAGATTGATTCACCATCTCCCCTCCAAACCACGAGAGCCTCTGTGGAACGTTCACCCCGATCTGTTCCTTCAAAGCCTGCACTAGATCGTCGCTCCCCAAAGACCAGCAACCTTGCAGAAAAACCAGCTCCAAGGGTAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

886 aa · TkA04G129870|TK1151|PROTEIN

MSAKSKSSSSETPPATKIPISKTSPATPRVSKLNRGVAKSEIDSPSPLQTTRASVERSPRSVPSKPALDRRSPKTSNLAEKPAPRVVVPKGSELQAQLNALQDDLKKAEEKLLLVEKEKEKAINELKEAQKQSEDTNEKLREALVAQKNAEESIEIEKFRSVEMEQAGIDAAHKKEEQWEKELESVKNQHAADLAALLSATQELEKVKQELAMTCDAKDQALTHADDATKIAENQVEKVETLSAEVTRLKALLNSKFESE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G129870
TK1151 IDTkA04G129870
OH-1004 IDLXL04_035450
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G129870
位置Chr04:33813387-33817748 (+)
描述Similar to At5g16730: WEB family protein At5g16730, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27595 WEB家族蛋白 At4g27595，叶绿体定位。 暂无已核实直接文献
At3g02930 WEB 家族蛋白 At3g02930，叶绿体。 暂无已核实直接文献
At5g16730 WEB家族蛋白At5g16730，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
At1g65010 假定WEB家族蛋白At1g65010，叶绿体定位。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035450 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007131 reciprocal meiotic recombination 生物过程
GO:0080175 phragmoplast microtubule organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005875 microtubule associated complex 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65010
ath:AT3G02930
ath:AT5G16730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.508
排名 1 · TkA04G129870 · TK1151
细胞膜0.296
排名 2 · TkA04G129870 · TK1151
细胞核0.206
排名 3 · TkA04G129870 · TK1151
高尔基体0.080
排名 4 · TkA04G129870 · TK1151
内质网0.061
排名 5 · TkA04G129870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05701WEMBL90-416 aa
PF19220Rod_CreS92-351 aa
PF13863DUF420093-146 aa
PF13863DUF4200156-251 aa
PF13863DUF4200256-348 aa
PF20878REST_helical259-297 aa
PF20878REST_helical275-317 aa
PF19220Rod_CreS311-477 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G129870PF05701WEMBL904165.7e-0832.7
TkA04G129870PF19220Rod_CreS923510.004616.9
TkA04G129870PF13863DUF4200931460.01816.1
TkA04G129870PF13863DUF42001562510.01816.1
TkA04G129870PF13863DUF42002563480.01816.1
TkA04G129870PF20878REST_helical2592970.8710.5
TkA04G129870PF20878REST_helical2753170.8710.5
TkA04G129870PF19220Rod_CreS3114770.004616.9
TkA04G129870PF13863DUF42003644320.01816.1
TkA04G129870PF05701WEMBL3905455.7e-0832.7
TkA04G129870PF20878REST_helical4044320.8710.5
TkA04G129870PF13863DUF42004455270.01816.1
TkA04G129870PF19220Rod_CreS4946060.004616.9
TkA04G129870PF13863DUF42005306260.01816.1
TkA04G129870PF20878REST_helical5305800.8710.5
TkA04G129870PF05701WEMBL5577485.7e-0832.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JJP1拟南芥sp|F4JJP1|Y4759_ARATH WEB family protein At4g27595, chloroplastic40.300%Swiss-Prot中等置信
Q9M8T5拟南芥sp|Q9M8T5|Y3293_ARATH WEB family protein At3g02930, chloroplastic33.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LFE4拟南芥sp|Q9LFE4|Y5673_ARATH WEB family protein At5g16730, chloroplastic30.100%Swiss-Prot中等置信
F4I8B9拟南芥sp|F4I8B9|Y1501_ARATH Putative WEB family protein At1g65010, chloroplastic55.200%Swiss-Prot低置信

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