TkA04G084920 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G084920

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 22254984-22256543 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1425 bp · TkA04G084920|TK1151|cDNA

ATGAAGTTGTGGCCTTTTAGGGTCATAGAAGGAACTGCCGACACACCAAAGATTGTCGTCTCCTACAAAGGTGAAGAAAAAGAGTTTTTGGCTGAAGAAATTTCATCCATGATTCTTAACAAGATGAAAGAAACTGCGGACGCATACCTTGGCAAATCTGTGAAAAATGCTGTGGTAACAGTCCCAGCTTACTTTAACGACTCTCAACGTCAAGCAACAAAGGATGCTGGTGCTATTGCTGGCCTTAATGTCTTGCGGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1425 bp · TkA04G084920|TK1151|CDS

ATGAAGTTGTGGCCTTTTAGGGTCATAGAAGGAACTGCCGACACACCAAAGATTGTCGTCTCCTACAAAGGTGAAGAAAAAGAGTTTTTGGCTGAAGAAATTTCATCCATGATTCTTAACAAGATGAAAGAAACTGCGGACGCATACCTTGGCAAATCTGTGAAAAATGCTGTGGTAACAGTCCCAGCTTACTTTAACGACTCTCAACGTCAAGCAACAAAGGATGCTGGTGCTATTGCTGGCCTTAATGTCTTGCGGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

474 aa · TkA04G084920|TK1151|PROTEIN

MKLWPFRVIEGTADTPKIVVSYKGEEKEFLAEEISSMILNKMKETADAYLGKSVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDNKSDISSKINVLVFDLGGGTFDVSILTIEEGGSTLEVKAVAGDTHLGGEDFDSQMVDHCAREFKRKWNKDLTGNKRALGRLRCACEKAKRILSCNMLTSIEIDGLHEGIDFSMKFSRAKFEELNMDFFIKCIETLEACLSDAKMEKSCVNEVILVGGST...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G084920`
TK1151 ID	TkA04G084920
OH-1004 ID	LXL04_036010
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	71.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.367 / OH-1004 36.402 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G084920

位置 Chr04:22254984-22256543 (-)

描述 Similar to HSP70: Heat shock cognate 70 kDa protein

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g02500`	与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。	Physiological and molecular assessment of altered expression of Hsc70-1 in Arabidopsis. Evidence for pleiotropic consequences.2003 · DOI: 10.1104/pp.102.019398 Interaction between SGT1 and cytosolic/nuclear HSC70 chaperones regulates Arabidopsis immune responses.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.051896 WPP-domain proteins mimic the activity of the HSC70-1 chaperone in preventing mistargeting of RanGAP1-anchoring protein WIT1.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.143404 The cytosolic/nuclear HSC70 and HSP90 molecular chaperones are important for stomatal closure and modulate abscisic acid-dependent physiological responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.174425

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036010 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009615 response to virus 生物过程

GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0042026 protein refolding 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0090332 stomatal closure 生物过程

GO:0098542 defense response to other organism 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G02500

sly:101247772

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.630

排名 1 · TkA04G084920 · TK1151

细胞核0.244

排名 2 · TkA04G084920 · TK1151

线粒体0.098

排名 3 · TkA04G084920 · TK1151

内质网0.094

排名 4 · TkA04G084920 · TK1151

细胞膜0.079

排名 5 · TkA04G084920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP701-267 aa

PF06723MreB_Mbl37-269 aa

PF04010DUF35744-73 aa

PF26581WIT1_2_N224-248 aa

PF00012HSP70278-471 aa

PF04010DUF357371-419 aa

PF07851TMEM120A-B384-462 aa

PF26154DUF8042394-458 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G084920	`PF00012`	HSP70	1	267	3e-150	502.1
TkA04G084920	`PF06723`	MreB_Mbl	37	269	1.3e-11	44.7
TkA04G084920	`PF04010`	DUF357	44	73	0.056	14.2
TkA04G084920	`PF26581`	WIT1_2_N	224	248	0.54	10.7
TkA04G084920	`PF00012`	HSP70	278	471	3e-150	502.1
TkA04G084920	`PF04010`	DUF357	371	419	0.056	14.2
TkA04G084920	`PF07851`	TMEM120A-B	384	462	3.4	7.6
TkA04G084920	`PF26154`	DUF8042	394	458	0.21	12.6
TkA04G084920	`PF26581`	WIT1_2_N	401	454	0.54	10.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P22953`	拟南芥	sp\|P22953\|HS701_ARATH Heat shock 70 kDa protein 1	56.300%	Swiss-Prot	高置信

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