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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G081960
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 21484321-21501900 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1893 bp · TkA04G081960|TK1151|cDNA

ATGGCTCTGGTTATGATGAACCAGAAGGCTGACGGGCTGGAGGTGGTGCACCCTGGAGAATATCAGTTAGTTCAAGGCACGTTTTTTTGCGTCGGTTACTGTTCATCGCCGGGTACTGTTCACGTCCGGGTTCGGTTGCCGAGTCGTTGCCGAGCACTGTTCATCGTTGCCGAGCAAAGTTGGTCGCTGGCCGAGAAGTTGGTTCAGGCATTTTATCGAACAGTTGGTGGGCATGGGTACTGTAGCACGCGGACTGTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1893 bp · TkA04G081960|TK1151|CDS

ATGGCTCTGGTTATGATGAACCAGAAGGCTGACGGGCTGGAGGTGGTGCACCCTGGAGAATATCAGTTAGTTCAAGGCACGTTTTTTTGCGTCGGTTACTGTTCATCGCCGGGTACTGTTCACGTCCGGGTTCGGTTGCCGAGTCGTTGCCGAGCACTGTTCATCGTTGCCGAGCAAAGTTGGTCGCTGGCCGAGAAGTTGGTTCAGGCATTTTATCGAACAGTTGGTGGGCATGGGTACTGTAGCACGCGGACTGTAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

630 aa · TkA04G081960|TK1151|PROTEIN

MALVMMNQKADGLEVVHPGEYQLVQGTFFCVGYCSSPGTVHVRVRLPSRCRALFIVAEQSWSLAEKLVQAFYRTVGGHGYCSTRTVAVDWLLDLGCGKIIRSVVDFKRDPWPKVSDTAKDLVKKMLNPDPNSRLTAQEVLDHPWIQNAKKAPNVSLGETVKARLKQFSIMNKLKKRALRVIAEHLLAEEVAGIKQGFDLMDTNKQGKINLVELKAGLQKLGHQIPDADFQILMEASAIIFVVASSTNKEDTKFKRFWIQS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G081960
TK1151 IDTkA04G081960
OH-1004 IDLXL04_036046
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)86.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.000 / OH-1004 44.711
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G081960
位置Chr04:21484321-21501900 (-)
描述Similar to CPK7: Calcium-dependent protein kinase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g12480 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19450 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g57530 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Arabidopsis calcium-dependent protein kinase AtCPK32 interacts with ABF4, a transcriptional regulator of abscisic acid-responsive gene expression, and modulates its activity.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.069757
At2g41860 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036046 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0004698 calcium,diacylglycerol-dependent serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41860
ath:AT3G57530
ath:AT5G12480
ath:AT5G19450
dosa:Os07g0568600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.659
排名 1 · TkA04G081960 · TK1151
细胞核0.303
排名 2 · TkA04G081960 · TK1151
内质网0.104
排名 3 · TkA04G081960 · TK1151
高尔基体0.091
排名 4 · TkA04G081960 · TK1151
溶酶体／液泡0.089
排名 5 · TkA04G081960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23451Zn_ribbon_PaaD33-54 aa
PF17546Defb5037-47 aa
PF12031BAF250_C54-95 aa
PF08711Med2697-124 aa
PF00069Pkinase99-145 aa
PF17804TSP_NTD104-141 aa
PF08102Antimicrobial_7113-135 aa
PF07554FIVAR116-139 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G081960PF23451Zn_ribbon_PaaD33540.1912.1
TkA04G081960PF17546Defb5037470.004817.5
TkA04G081960PF12031BAF250_C54950.01915.0
TkA04G081960PF08711Med26971240.004517.5
TkA04G081960PF00069Pkinase991451.4e-1971.2
TkA04G081960PF17804TSP_NTD1041410.4111.6
TkA04G081960PF08102Antimicrobial_71131350.1712.8
TkA04G081960PF07554FIVAR1161390.2212.9
TkA04G081960PF13499EF-hand_71201401.2e-0732.7
TkA04G081960PF08774VRR_NUC1522224.5e-0524.2
TkA04G081960PF09382RQC1631900.1612.5
TkA04G081960PF26882Phage_T4_Y11B1681970.2812.3
TkA04G081960PF28144RsaX201721840.411.1
TkA04G081960PF21008AIF-11822231.6e-0525.9
TkA04G081960PF13050DUF39111882140.0514.5
TkA04G081960PF25825SAPC2_N1902200.0003621.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38873拟南芥sp|Q38873|CDPK7_ARATH Calcium-dependent protein kinase 777.900%Swiss-Prot低置信
Q42438拟南芥sp|Q42438|CDPK8_ARATH Calcium-dependent protein kinase 878.000%Swiss-Prot低置信
Q6NLQ6拟南芥sp|Q6NLQ6|CDPKW_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3274.300%Swiss-Prot低置信
P93759拟南芥sp|P93759|CDPKE_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1470.700%Swiss-Prot低置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2074.300%Swiss-Prot低置信

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