TkA04G081200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G081200

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 21304206-21307773 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1580 bp · TkA04G081200|TK1151|cDNA

GTCATATGACCAAAATACCCTCCATCTCCCACTCCTATTTCATTCCTTCCAATGCATCCTCCATTCTCACCAACCCCATTCAAATCTATCGATCAATGACGACGCTGTTCATCTCATTCAGAACTATACTCGCTGTACACGATTGCTCCCATACCCATTAAGTAATTAATCTCAAATTAAGTCGTAGTGTCAGCCATGGCTGCCGCAGCCGGAAACGCCGCCGTTACTTCTAAAGCTCCTGCATTCGGCGCAAGATCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

786 bp · TkA04G081200|TK1151|CDS

ATGGGGGAATTTGTCACTGCAAGGTGGCGGCGCGAGGAACATAGAGGCGATTGTAGAGAGAGGGAAAAAAGTAGGGGGTTGGTGAAGTGTACGGCGGAGGGGATCGAGAGAGGAATACTGACGGGAGGAAGAGGGCAAGAGGGTACTTTTGTTATGCCGGAAAGGCTGAAGGTGGTGGCGTTAATGGCGTGCGTGATGTGTTTGTGTAATGCTGATAGAGTTGTTATGTCTGTCGCCATTGTTCCTCTTGCTGCTAAACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

261 aa · TkA04G081200|TK1151|PROTEIN

MGEFVTARWRREEHRGDCREREKSRGLVKCTAEGIERGILTGGRGQEGTFVMPERLKVVALMACVMCLCNADRVVMSVAIVPLAAKHGWSSSFLGIVQSSFLWGYIFSSVIGGALVDKYGGKRVIAWGVALWSLATLLTPWAANHSTIALLAVRAFFGLAEGVALPSMNILLSKWFPCNERATAVGLSMGGFHLGNVVGLVLTPIVMSSVGLSGPFILFAALGLLWLTTWTLRVTNDPQESRSISKSELRLIQAGSPIPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G081200`
TK1151 ID	TkA04G081200
OH-1004 ID	LXL04_036058
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 89.272 / OH-1004 45.155 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G081200

位置 Chr04:21304206-21307773 (+)

描述 Similar to ANTR3: Probable anion transporter 3, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g38060`	无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`At3g46980`	无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0451100`	可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os01g0852200`	可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os09g0570400`	可能的阴离子转运蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036058 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程

GO:0006814 sodium ion transport 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009624 response to nematode 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分

GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015293 symporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G29650

ath:AT2G38060

ath:AT3G46980

dosa:Os01g0852200

dosa:Os05g0451100

osa:4324813

osa:4338960

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.855

排名 1 · TkA04G081200 · TK1151

线粒体0.114

排名 2 · TkA04G081200 · TK1151

细胞质0.024

排名 3 · TkA04G081200 · TK1151

细胞核0.020

排名 4 · TkA04G081200 · TK1151

高尔基体0.019

排名 5 · TkA04G081200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_164-245 aa

PF00083Sugar_tr90-225 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G081200	`PF07690`	MFS_1	64	245	3.8e-35	122.2
TkA04G081200	`PF00083`	Sugar_tr	90	225	1.8e-08	34.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7XJR2`	拟南芥	sp\|Q7XJR2\|ANTR3_ARATH Probable anion transporter 3, chloroplastic	74.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q66GI9`	拟南芥	sp\|Q66GI9\|ANTR4_ARATH Probable anion transporter 4, chloroplastic	61.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q53WP9`	水稻	sp\|Q53WP9\|PHT42_ORYSJ Probable anion transporter 2, chloroplastic	63.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8W0H5`	水稻	sp\|Q8W0H5\|PHT43_ORYSJ Probable anion transporter 3, chloroplastic	57.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q652N5`	水稻	sp\|Q652N5\|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic	44.100%	Swiss-Prot	中等置信

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