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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G067490
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 17906861-17910062 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2248 bp · TkA04G067490|TK1151|cDNA

AAAAGCCCAAATTCAATGAACCCCGTTATGTCGGTTTACCGTTTACGTTCGCACCCTGTCCCTGTTCCCACCAAAAGGGTATCGCCTCTATAACTAACACATACACCAATCATAAGCCATCCTAAAACCAAAATCGCTATGGGTTTAGAGATCATACATCCTAATTCTTGCATCAGAGGGTGTTGCCGGAGCGATTCCATCCCTCTGCACCTCCCGTCGTCTTCCTACTCACTCTTACTTCCAATTGCTCGAGGTGCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1932 bp · TkA04G067490|TK1151|CDS

ATGGGTTTAGAGATCATACATCCTAATTCTTGCATCAGAGGGTGTTGCCGGAGCGATTCCATCCCTCTGCACCTCCCGTCGTCTTCCTACTCACTCTTACTTCCAATTGCTCGAGGTGCTGAAAGCGTTGTTTATGATGCAATATTGGATGGAGAAAGAGTCGCTGTTAAAAAGCCCGTTTTGTCCACCTCCGACGACATCAATAAGTTCCATAAGGAATTGCAATTGCTGTGCAAGTTGAATCATCAAGGGATCGCGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

643 aa · TkA04G067490|TK1151|PROTEIN

MGLEIIHPNSCIRGCCRSDSIPLHLPSSSYSLLLPIARGAESVVYDAILDGERVAVKKPVLSTSDDINKFHKELQLLCKLNHQGIATLLAAHARPPNYMFFFKFYEFGNLSQKLHVEEWNPSINQALMIIKQLANSLQYLHNIGVVHRDVKPANVLLDKNLRPHLADFGLSEYKQDLKQVTLQNWRSSGKPTGGFHKKNMVGTLIYMPPEVLKKEIHTEKSDVYSFAITINELLTGVVPYTDLRTEAQAHTVLEMNYTEQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G067490
TK1151 IDTkA04G067490
OH-1004 IDLXL04_002768
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)33.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 44.635 / OH-1004 84.986
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G067490
位置Chr04:17906861-17910062 (+)
描述Similar to Os02g0799000: Probable protein phosphatase 2C 27
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q940A2 含蛋白激酶和 PP2C 样结构域的蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g31750 蛋白磷酸酶，调节对病原菌的防御反应，赋予抵抗力并促进水杨酸 积累。
Arabidopsis proteins important for modulating defense responses to Pseudomonas syringae that secrete HopW1-1.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03439.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0541900 含蛋白激酶和 PP2C 样结构域的蛋白。 暂无已核实直接文献
Os02g0149800 可能的蛋白磷酸酶2C 10。 暂无已核实直接文献
Os06g0698300 可能的蛋白质磷酸酶2C 59。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002768 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0050688 regulation of defense response to virus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25620
ath:AT2G33700
dosa:Os02g0799000
dosa:Os06g0179700
dosa:Os06g0597200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.452
排名 1 · TkA04G067490 · TK1151
细胞膜0.295
排名 2 · TkA04G067490 · TK1151
细胞核0.277
排名 3 · TkA04G067490 · TK1151
高尔基体0.092
排名 4 · TkA04G067490 · TK1151
内质网0.082
排名 5 · TkA04G067490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01636APH35-80 aa
PF00069Pkinase36-309 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr36-311 aa
PF03109ABC143-57 aa
PF06293Kdo118-163 aa
PF01636APH122-160 aa
PF17667Pkinase_fungal125-226 aa
PF14531Kinase-like126-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G067490PF01636APH35800.002718.2
TkA04G067490PF00069Pkinase363092.1e-41142.8
TkA04G067490PF07714PK_Tyr_Ser-Thr363113.5e-40138.7
TkA04G067490PF03109ABC143570.007116.2
TkA04G067490PF06293Kdo1181630.002418.1
TkA04G067490PF01636APH1221600.002718.2
TkA04G067490PF17667Pkinase_fungal1252260.006116.0
TkA04G067490PF14531Kinase-like1261690.03913.9
TkA04G067490PF03109ABC11361800.007116.2
TkA04G067490PF03109ABC12222580.007116.2
TkA04G067490PF02768DNA_pol3_beta_33033540.2411.9
TkA04G067490PF00481PP2C3816262.2e-60205.2
TkA04G067490PF06293Kdo5155510.002418.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q940A2拟南芥sp|Q940A2|P2C31_ARATH Protein kinase and PP2C-like domain-containing protein64.500%Swiss-Prot高置信
Q8RXV3拟南芥sp|Q8RXV3|P2C59_ARATH Probable protein phosphatase 2C 5941.100%Swiss-Prot中等置信
Q5JJY4水稻sp|Q5JJY4|P2C04_ORYSJ Protein kinase and PP2C-like domain-containing protein65.300%Swiss-Prot高置信
Q67UX7水稻sp|Q67UX7|P2C10_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 1040.600%Swiss-Prot中等置信
Q5Z6F5水稻sp|Q5Z6F5|P2C59_ORYSJ Probable protein phosphatase 2C 5939.500%Swiss-Prot中等置信

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