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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G051060
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 13660072-13663017 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1835 bp · TkA04G051060|TK1151|cDNA

ATACAGACAAAGAAAGGTCCATGTCCTTTCACCCTTTTTCATCCCTCACATAATTAATTTTATATTTCACTCCCATTCCCCTACATTTTCAAACCTTATAAAACATCGCATTTTACGACCCATCTTTCTCCCTCCATCACAATTCACAAAACAAGGAAAGACAGGTGTTTTCTTCAAGGAACAGCAATGGCAGCTCGTTGTTTTTACTTTTCTTTTTGTGGCTGGTCAAGTCTAAAATCCAACGATACGCATCCATCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1473 bp · TkA04G051060|TK1151|CDS

ATGGCAGCTCGTTGTTTTTACTTTTCTTTTTGTGGCTGGTCAAGTCTAAAATCCAACGATACGCATCCATCTGATCTGGAGAACGGTGATAGCGATAAGCTAAAGCTGCCAGCTTTTAAAGAGTACAAGCTAGATCAACTTAAAGCTGCAACTGGTGGGTTTTCTGTCGAGAATATTGTGTCCGAACATGGTGAAAAGGCGCCGAATGTTGTGTATAAAGGAAAGTTCGAAGACGATGATCGCTTAATCGCGGTAAAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

490 aa · TkA04G051060|TK1151|PROTEIN

MAARCFYFSFCGWSSLKSNDTHPSDLENGDSDKLKLPAFKEYKLDQLKAATGGFSVENIVSEHGEKAPNVVYKGKFEDDDRLIAVKRFNKSAWPDTRQFLDEAKAVGQLRSQRLANLLGCCFEGNERLLVAEFMPHETLSKHLFHWETQPLKWEMRLRVALNLAQALDYCSTKGRSLYHDLNAYRVLFDQDCNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYMRTGRVIAESVIYSFGTILLDLLSGKHIPPSHALDLIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G051060
TK1151 IDTkA04G051060
OH-1004 IDLXL04_036383
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G051060
位置Chr04:13660072-13663017 (+)
描述Similar to BSK5: Serine/threonine-protein kinase BSK5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59010 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
A mutation in Arabidopsis BSK5 encoding a brassinosteroid-signaling kinase protein affects responses to salinity and abscisic acid.2012 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.08.118
At3g54030 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 (BR) 信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At1g63500 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 (BR) 信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At4g00710 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0684200 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
OsBRI1 Activates BR Signaling by Preventing Binding between the TPR and Kinase Domains of OsBSK3 via Phosphorylation.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01668
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036383 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63500
ath:AT3G54030
ath:AT4G00710
ath:AT5G59010
dosa:Os04g0684200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.619
排名 1 · TkA04G051060 · TK1151
细胞质0.237
排名 2 · TkA04G051060 · TK1151
细胞核0.216
排名 3 · TkA04G051060 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA04G051060 · TK1151
高尔基体0.037
排名 5 · TkA04G051060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr70-308 aa
PF00069Pkinase70-306 aa
PF00515TPR_1162-171 aa
PF06287DUF1039319-339 aa
PF25575TPR_BSK1_C344-461 aa
PF13174TPR_6390-413 aa
PF13432TPR_16390-446 aa
PF07719TPR_2391-409 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G051060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr703083.1e-2693.0
TkA04G051060PF00069Pkinase703061.6e-2177.6
TkA04G051060PF00515TPR_11621710.001618.9
TkA04G051060PF06287DUF10393193390.2312.5
TkA04G051060PF25575TPR_BSK1_C3444612.4e-62208.8
TkA04G051060PF13174TPR_63904130.002119.3
TkA04G051060PF13432TPR_163904460.1313.5
TkA04G051060PF07719TPR_23914090.0006620.3
TkA04G051060PF00515TPR_13914090.001618.9
TkA04G051060PF03041Baculo_LEF-23974380.212.2
TkA04G051060PF07719TPR_24234520.0006620.3
TkA04G051060PF00515TPR_14234520.001618.9
TkA04G051060PF06287DUF10394524850.2312.5
TkA04G051060PF13432TPR_164544800.1313.5
TkA04G051060PF07719TPR_24554790.0006620.3
TkA04G051060PF00515TPR_14554760.001618.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIL1拟南芥sp|Q9FIL1|BSK5_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK574.300%Swiss-Prot高置信
Q9M324拟南芥sp|Q9M324|BSK6_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK672.100%Swiss-Prot高置信
F4I3M3拟南芥sp|F4I3M3|BSK7_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK772.200%Swiss-Prot高置信
Q8W4L3拟南芥sp|Q8W4L3|BSK3_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK366.900%Swiss-Prot高置信
B9FDE0水稻sp|B9FDE0|BSK3_ORYSJ Probable serine/threonine-protein kinase BSK373.300%Swiss-Prot高置信

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