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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G048490
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 13003249-13006944 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2776 bp · TkA04G048490|TK1151|cDNA

AACCCATATCTTCTTCATGACTGTCAATAGTACTATAAGTGGTTATACCACTGCATTTTCATGACACCATCCATTAATCATTTAATCGTACAATGTAATTCCTTAGAAAGGTTTCATTGATGTTTATGAGTGCATCTTTTCCCAAACTATGAAGCATTTGCTAATCCATTGAAAGATTTAATCGATTTATCATTGTCGCCTTTAAGCTATAATGCTTTCAAGACTTGGTTCGTCGATCTCTAGATCGTCTTGGTCAAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2382 bp · TkA04G048490|TK1151|CDS

ATGCTTTCAAGACTTGGTTCGTCGATCTCTAGATCGTCTTGGTCAAGGAATGTTTTGAGTTGTAGAAATGGCGGAAGATCACAGAGTTTGACCGATTCTTCAGCACATCAATCTCGATATATCGGCCCAGCAGATGATAACATGCGGTTTTTCAATCGTTACTTGGGTTCTTTACCAGCTAACAATGAAAGAAATTGTTCTGGGTTTTCATGGAAAGCGCATATATCAGATATAAATTGCGTTCTTGCCAACTCTGGAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

793 aa · TkA04G048490|TK1151|PROTEIN

MLSRLGSSISRSSWSRNVLSCRNGGRSQSLTDSSAHQSRYIGPADDNMRFFNRYLGSLPANNERNCSGFSWKAHISDINCVLANSGIRRFFSNEAPNEKNHDDSYSKEKKETPKDDNQKSDSKKESSTDETRLNYRILVIGWLIFGLLLFFQYDYVFLQVKQISFQEFENKLLKPGLVDHIVIADRSVAKVYLKSSPLTDHASSEEEEEEVVSPAKLNANLKYYFNIRSVESFEQKLAKSQEALGIDSQDHVPVLYDSDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G048490
TK1151 IDTkA04G048490
OH-1004 IDLXL04_036415
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.856 / OH-1004 95.620
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G048490
位置Chr04:13003249-13006944 (-)
描述Similar to FTSH10: ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 10, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g29080 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
At1g07510 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0458400 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0842600 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036415 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006465 signal peptide processing 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0034982 mitochondrial protein processing 生物过程
GO:0051604 protein maturation 生物过程
GO:0065003 protein-containing complex assembly 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005745 m-AAA complex 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0097002 mitochondrial inner boundary membrane 细胞组分
GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07510
ath:AT2G29080
dosa:Os01g0842600
dosa:Os05g0458400
sce:YMR089C
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.899
排名 1 · TkA04G048490 · TK1151
细胞质0.065
排名 2 · TkA04G048490 · TK1151
质体0.053
排名 3 · TkA04G048490 · TK1151
细胞核0.052
排名 4 · TkA04G048490 · TK1151
细胞膜0.023
排名 5 · TkA04G048490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11169DUF295686-148 aa
PF28917MGR3_mid99-126 aa
PF10176NEDD4_Bsd2103-162 aa
PF06480FtsH_ext140-250 aa
PF28917MGR3_mid160-270 aa
PF10176NEDD4_Bsd2251-287 aa
PF13191AAA_16355-394 aa
PF06068TIP49359-395 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G048490PF11169DUF2956861480.06414.2
TkA04G048490PF28917MGR3_mid991260.9710.0
TkA04G048490PF10176NEDD4_Bsd21031620.06714.2
TkA04G048490PF06480FtsH_ext1402501.1e-0835.9
TkA04G048490PF28917MGR3_mid1602700.9710.0
TkA04G048490PF10176NEDD4_Bsd22512870.06714.2
TkA04G048490PF13191AAA_163553940.006717.7
TkA04G048490PF06068TIP493593950.02614.4
TkA04G048490PF12775AAA_73593830.311.3
TkA04G048490PF05496RuvB_N3614290.002418.4
TkA04G048490PF01078Mg_chelatase3613770.09712.8
TkA04G048490PF13479AAA_243613920.1612.4
TkA04G048490PF00004AAA3624911.2e-39136.5
TkA04G048490PF07728AAA_53624300.0008220.1
TkA04G048490PF13401AAA_223623930.00120.1
TkA04G048490PF07724AAA_23624310.003917.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84WU8拟南芥sp|Q84WU8|FTSH3_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 3, mitochondrial63.400%Swiss-Prot高置信
Q8VZI8拟南芥sp|Q8VZI8|FTSHA_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 10, mitochondrial59.400%Swiss-Prot高置信
Q0DHL4水稻sp|Q0DHL4|FTSH8_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 8, mitochondrial64.700%Swiss-Prot高置信
Q8S2A7水稻sp|Q8S2A7|FTSH3_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 3, mitochondrial62.300%Swiss-Prot高置信

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