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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G022040
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 5598217-5602813 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3491 bp · TkA04G022040|TK1151|cDNA

TAGAATCTAAGATACCTTTAAACAACAATCAAAACTTCTCTTCAATCAACCTTAGACCCCCCAACCATCAGTTGGTAGACTTACCCATACACACATATCCCCTTCAAACCCCCTACTCTCATTCTCTCTCACCATCACATTCACACACATTCTTTCTTTCTTGCTGCCATGGCTGCCCTCTTTACAGGCTCCCATGGCCACCATGATCTTCCGGATCATGATACCCAATCGAATATATGTCGGGTATGCAGTGATGAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3090 bp · TkA04G022040|TK1151|CDS

ATGGCTGCCCTCTTTACAGGCTCCCATGGCCACCATGATCTTCCGGATCATGATACCCAATCGAATATATGTCGGGTATGCAGTGATGAGATTAGCCAACAGTTTGTTGCTTGTCGCGAATGCAAGTTCCCAGTGTGTCGGCCTTGTTACATTTATGAACGAAGCGAAGGGAACCAATGCTGCCCCCAATGCAACGTTCGATATAAACGTCACAAAGGTTGTCCACGAGTTGTTGGAGATGATGAAGAAAGTGACGATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1029 aa · TkA04G022040|TK1151|PROTEIN

MAALFTGSHGHHDLPDHDTQSNICRVCSDEISQQFVACRECKFPVCRPCYIYERSEGNQCCPQCNVRYKRHKGCPRVVGDDEESDDGDDFEDEFQMKDRQEAQDRNRVDNQSENGDSHPPKQYNTNGFAFSSAGSVAGRDLDRDRDDEWKDRVEKWKTRQEKRGLVTKGDDANDPGEEDDYLMAEARQPLWRKVPISSSLINPYRIVIVLRLVILIFFFFFRFRIMTPAYDAYPLWLISVICEIWFALSWILDQFPKWFP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G022040
TK1151 IDTkA04G022040
OH-1004 IDLXL04_036828
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G022040
位置Chr04:5598217-5602813 (-)
描述Similar to CESA4: Cellulose synthase A catalytic subunit 4 [UDP-forming]
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44030 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Impairment of cellulose synthases required for Arabidopsis secondary cell wall formation enhances disease resistance.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048058

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0467800 纤维素合酶末端复合物（“花簇”）的催化亚基，参与β-1,4-葡聚糖微纤维的结晶，是细胞壁形成的主要机制（通过相似性推测）。
Three distinct rice cellulose synthase catalytic subunit genes required for cellulose synthesis in the secondary wall.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.022442
UniProt: A2XNT2 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
Os03g0837100 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
Os07g0424400 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
Os07g0252400 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036828 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016759 cellulose synthase activity 分子功能
GO:0016760 cellulose synthase (UDP-forming) activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44030
dosa:Os03g0837100
dosa:Os07g0424400
dosa:Os10g0467800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.605
排名 1 · TkA04G022040 · TK1151
内质网0.182
排名 2 · TkA04G022040 · TK1151
高尔基体0.139
排名 3 · TkA04G022040 · TK1151
细胞质0.133
排名 4 · TkA04G022040 · TK1151
溶酶体／液泡0.091
排名 5 · TkA04G022040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14569zf-UDP17-85 aa
PF14570zf-RING_423-69 aa
PF13632Glyco_trans_2_3209-221 aa
PF03552Cellulose_synt286-1021 aa
PF13632Glyco_trans_2_3520-573 aa
PF14570zf-RING_4587-601 aa
PF13632Glyco_trans_2_3719-825 aa
PF13564DoxX_2807-866 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G022040PF14569zf-UDP17851.2e-2796.4
TkA04G022040PF14570zf-RING_423690.01316.0
TkA04G022040PF13632Glyco_trans_2_32092218.9e-0626.4
TkA04G022040PF03552Cellulose_synt28610211353.4
TkA04G022040PF13632Glyco_trans_2_35205738.9e-0626.4
TkA04G022040PF14570zf-RING_45876010.01316.0
TkA04G022040PF13632Glyco_trans_2_37198258.9e-0626.4
TkA04G022040PF13564DoxX_28078660.1213.2
TkA04G022040PF13632Glyco_trans_2_39559908.9e-0626.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84JA6拟南芥sp|Q84JA6|CESA4_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 4 [UDP-forming]79.100%Swiss-Prot高置信
Q9AV71水稻sp|Q9AV71|CESA7_ORYSJ Cellulose synthase A catalytic subunit 7 [UDP-forming]75.900%Swiss-Prot高置信
A2XNT2水稻sp|A2XNT2|CESA5_ORYSI Probable cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]64.300%Swiss-Prot高置信
Q851L8水稻sp|Q851L8|CESA5_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]64.300%Swiss-Prot高置信
Q69V23水稻sp|Q69V23|CESA3_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]64.300%Swiss-Prot高置信
Q6YVM4水稻sp|Q6YVM4|CESA6_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 6 [UDP-forming]75.400%Swiss-Prot高置信

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