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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G021680
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 5488069-5499508 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1233 bp · TkA04G021680|TK1151|cDNA

ATGCTAGGGTATGAAATGTGTGAAAGAATGGCATACTATGGAATAGCAACAAATTTGGTGTTGTACTTAACAAGGGAATTGCATGAAGGCACCGTGAAATCATCCAACAATGTCACAAATTGGGTGGGAACCGTGTGGATGACTCCTCTTTTGGGTGCATATATTGCTGACACATATCTAGGAAGATATTGGACTTTCATGATTGCTTCAGTCATTTATTTTCTGGGAATGTGCTTCTTAAGTATCGTGGTTTCACTATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1233 bp · TkA04G021680|TK1151|CDS

ATGCTAGGGTATGAAATGTGTGAAAGAATGGCATACTATGGAATAGCAACAAATTTGGTGTTGTACTTAACAAGGGAATTGCATGAAGGCACCGTGAAATCATCCAACAATGTCACAAATTGGGTGGGAACCGTGTGGATGACTCCTCTTTTGGGTGCATATATTGCTGACACATATCTAGGAAGATATTGGACTTTCATGATTGCTTCAGTCATTTATTTTCTGGGAATGTGCTTCTTAAGTATCGTGGTTTCACTATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

410 aa · TkA04G021680|TK1151|PROTEIN

MLGYEMCERMAYYGIATNLVLYLTRELHEGTVKSSNNVTNWVGTVWMTPLLGAYIADTYLGRYWTFMIASVIYFLGMCFLSIVVSLSSLKPPTCGKDCDKRASSFQVGIFYCALYIIAIGTGGTKPNISTMGADQFDDFEPKEKAHKLTFFNWWMFSIFFGTLFANTFLIYIQDNVTWSLGYGIPTLALFVAIIAFIFGTPTYRHKPKGESPFTKMAKVLVATLRKRNVVVPIDPKELHELTLDEYSSPGKYRIDHSNSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G021680
TK1151 IDTkA04G021680
OH-1004 IDLXL04_036838
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)72.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.761
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G021680
位置Chr04:5488069-5499508 (-)
描述Similar to NPF5.2: Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46050 肽转运蛋白参与种子萌发过程中的胁迫耐受性和防御剧毒细菌病原体。
Structural and functional characterization of AtPTR3, a stress-induced peptide transporter of Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1007/s00894-005-0257-6
AtPTR3, a wound-induced peptide transporter needed for defence against virulent bacterial pathogens in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0451-5
At5g46040 肽转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g40460 NRT1/PTR家族蛋白5.1。 暂无已核实直接文献
At3g54140 肽转运蛋白。
AtPTR1, a plasma membrane peptide transporter expressed during seed germination and in vascular tissue of Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02224.x
AtPTR1 and AtPTR5 transport dipeptides in planta.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123844
At2g02040 肽转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0015833 peptide transport 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0042938 dipeptide transport 生物过程
GO:0042939 tripeptide transport 生物过程
GO:0043201 response to L-leucine 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G02040
ath:AT2G40460
ath:AT3G54140
ath:AT5G46040
ath:AT5G46050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.559
排名 1 · TkA04G021680 · TK1151
溶酶体／液泡0.188
排名 2 · TkA04G021680 · TK1151
内质网0.120
排名 3 · TkA04G021680 · TK1151
细胞质0.087
排名 4 · TkA04G021680 · TK1151
高尔基体0.049
排名 5 · TkA04G021680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_17-338 aa
PF00854PTR263-243 aa
PF28301ElxI1163-203 aa
PF23688YlcJ165-177 aa
PF00854PTR2261-306 aa
PF00854PTR2306-348 aa
PF23688YlcJ325-333 aa
PF28301ElxI1358-385 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G021680PF07690MFS_173386.4e-1142.5
TkA04G021680PF00854PTR2632434.3e-60204.4
TkA04G021680PF28301ElxI11632032.19.2
TkA04G021680PF23688YlcJ1651770.1213.3
TkA04G021680PF00854PTR22613064.3e-60204.4
TkA04G021680PF00854PTR23063484.3e-60204.4
TkA04G021680PF23688YlcJ3253330.1213.3
TkA04G021680PF28301ElxI13583852.19.2
TkA04G021680PF07690MFS_13603786.4e-1142.5
TkA04G021680PF23688YlcJ3733850.1213.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FNL7拟南芥sp|Q9FNL7|PTR3_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.244.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FNL8拟南芥sp|Q9FNL8|PTR4_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.342.400%Swiss-Prot中等置信
Q8VZR7拟南芥sp|Q8VZR7|PTR30_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.139.100%Swiss-Prot中等置信
Q9M390拟南芥sp|Q9M390|PTR1_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.133.300%Swiss-Prot中等置信
P46032拟南芥sp|P46032|PTR2_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.333.000%Swiss-Prot中等置信

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