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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G017670
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 4410686-4414782 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2262 bp · TkA04G017670|TK1151|cDNA

ACATATTAAAGGGGATGTATATCGCAAGAATGTAACCTAGAAATAAAGCTTTAAGCTTGTCTTGTTCCCAGTGATAAATCGTAGCAGTCTTCACAGCAACTGTAAATCAATGGCGACATCTCTGAGCACGCCAAAGCTCACCACGACGCTGTCTTCTTCAACACTTCAAACACTCCTCTCCAGACACAAATTCTCAAACCTGAATCGTTCTCCATTCATTATCTCTCCGCAATCATCATCTTCATCTTGTTATTCATCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1716 bp · TkA04G017670|TK1151|CDS

ATGGCGACATCTCTGAGCACGCCAAAGCTCACCACGACGCTGTCTTCTTCAACACTTCAAACACTCCTCTCCAGACACAAATTCTCAAACCTGAATCGTTCTCCATTCATTATCTCTCCGCAATCATCATCTTCATCTTGTTATTCATCTAGCTTCAGTCTCTCGAAAAAAGCCCTAGGCTTTCTCTCCGACCACCGCCGGCATGCTGTACTCAAGTCTCGGAGATTCTCCACCAGAGCGGAGTCGACTAACGGCGCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

571 aa · TkA04G017670|TK1151|PROTEIN

MATSLSTPKLTTTLSSSTLQTLLSRHKFSNLNRSPFIISPQSSSSSCYSSSFSLSKKALGFLSDHRRHAVLKSRRFSTRAESTNGAEPRHYDFDLFTIGAGSGGVRASRFAANFGASVAVCELPFSTISSDTTGGVGGTCVLRGCVPKKLLVYASKYSHEFEESLGFGWSYGSEPTHDWSTLMANKNAELQRLTGIYKNILNNAGVKLIEGRGKIVDPHTVDVDGKLYTARNILVSVGGRPFVPDIPGKEHVIDSDAALD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G017670
TK1151 IDTkA04G017670
OH-1004 IDLXL04_036917
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G017670
位置Chr04:4410686-4414782 (-)
描述Similar to GOR: Glutathione reductase, chloroplastic (Fragment)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54660 催化谷胱甘肽二硫化物 (GSSG) 还原为还原型谷胱甘肽 (GSH)（通过相似性）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036917 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004362 glutathione-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0004791 thioredoxin-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0005507 copper ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54660
gmx:547793
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.863
排名 1 · TkA04G017670 · TK1151
线粒体0.202
排名 2 · TkA04G017670 · TK1151
细胞质0.035
排名 3 · TkA04G017670 · TK1151
细胞核0.018
排名 4 · TkA04G017670 · TK1151
细胞膜0.012
排名 5 · TkA04G017670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13434Lys_Orn_oxgnase14-41 aa
PF028262-Hacid_dh_C93-121 aa
PF07992Pyr_redox_294-416 aa
PF03486HI0933_like94-127 aa
PF00070Pyr_redox96-122 aa
PF01262AlaDh_PNT_C96-123 aa
PF13738Pyr_redox_398-121 aa
PF00070Pyr_redox200-213 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G017670PF13434Lys_Orn_oxgnase14410.0001621.6
TkA04G017670PF028262-Hacid_dh_C931210.05713.5
TkA04G017670PF07992Pyr_redox_2944161.4e-68232.2
TkA04G017670PF03486HI0933_like941270.0008719.6
TkA04G017670PF00070Pyr_redox961227.7e-2484.7
TkA04G017670PF01262AlaDh_PNT_C961230.0009919.3
TkA04G017670PF13738Pyr_redox_3981212.4e-1040.9
TkA04G017670PF00070Pyr_redox2002137.7e-2484.7
TkA04G017670PF13738Pyr_redox_32184002.4e-1040.9
TkA04G017670PF13434Lys_Orn_oxgnase2232810.0001621.6
TkA04G017670PF01262AlaDh_PNT_C2643090.0009919.3
TkA04G017670PF028262-Hacid_dh_C2643010.05713.5
TkA04G017670PF00070Pyr_redox2673447.7e-2484.7
TkA04G017670PF03486HI0933_like3065050.0008719.6
TkA04G017670PF02852Pyr_redox_dim4365444.8e-33114.4
TkA04G017670PF028262-Hacid_dh_C4865210.05713.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42770拟南芥sp|P42770|GSHRP_ARATH Glutathione reductase, chloroplastic75.700%Swiss-Prot高置信

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