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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G005180
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 1234043-1235136 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

555 bp · TkA04G005180|TK1151|cDNA

TCTGCATGGATTGCTTTCAAGTTCGTCGCTCGCACCAGTGCACTAGAACACACACAACCGCCGATCGAAACTCCGATCTCCACCCCTGTCGCTGCGCGGCGCCGATTCTACCTCCGACACACACAGGCTAGTCTCCCTTCTTTCCTCCATCCTCGCTGCTTTCTACTTGCCATATATCCACCTTCTGCTTCTTCGTTTCAAGCCATGGAAGCGGCCAAGCGGCTGTGGTTACTCCAATTTCCAACAACGGGTAAGCATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

555 bp · TkA04G005180|TK1151|CDS

TCTGCATGGATTGCTTTCAAGTTCGTCGCTCGCACCAGTGCACTAGAACACACACAACCGCCGATCGAAACTCCGATCTCCACCCCTGTCGCTGCGCGGCGCCGATTCTACCTCCGACACACACAGGCTAGTCTCCCTTCTTTCCTCCATCCTCGCTGCTTTCTACTTGCCATATATCCACCTTCTGCTTCTTCGTTTCAAGCCATGGAAGCGGCCAAGCGGCTGTGGTTACTCCAATTTCCAACAACGGGTAAGCATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

184 aa · TkA04G005180|TK1151|PROTEIN

SAWIAFKFVARTSALEHTQPPIETPISTPVAARRRFYLRHTQASLPSFLHPRCFLLAIYPPSASSFQAMEAAKRLWLLQFPTTGKHIIFKSKKFRIFGFRASDKCQREKRKAINDDDLLWAMASLGFEDYIEPLNSYLNRYKEGDTKGSAKGHDGSSRKDARNNALSLAFKIHTLRVLTMLFHR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G005180
TK1151 IDTkA04G005180
OH-1004 IDLXL04_012655
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 35.326 / OH-1004 26.316
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G005180
位置Chr04:1234043-1235136 (+)
描述Similar to NFYB8: Nuclear transcription factor Y subunit B-8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g37060 NF-Y/HAP转录因子复合物的组成部分。 暂无已核实直接文献
At3g53340 NF-Y/HAP转录因子复合物的组成部分。 暂无已核实直接文献
At2g38880 NF-Y/HAP 转录因子复合物的组分（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0573500 NF-Y/HAP转录因子复合物的组成部分。
OsHAP3 genes regulate chloroplast biogenesis in rice.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01897.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012655 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0016602 CCAAT-binding factor complex 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0001228 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0046982 protein heterodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37060
ath:AT3G53340
dosa:Os01g0834400
osa:9268669
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.652
排名 1 · TkA04G005180 · TK1151
细胞质0.312
排名 2 · TkA04G005180 · TK1151
内质网0.063
排名 3 · TkA04G005180 · TK1151
细胞膜0.063
排名 4 · TkA04G005180 · TK1151
线粒体0.052
排名 5 · TkA04G005180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00808CBFD_NFYB_HMF100-122 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G005180PF00808CBFD_NFYB_HMF1001220.005517.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VYK4拟南芥sp|Q8VYK4|NFYB8_ARATH Nuclear transcription factor Y subunit B-871.200%Swiss-Prot低置信
Q67XJ2拟南芥sp|Q67XJ2|NFYBA_ARATH Nuclear transcription factor Y subunit B-1066.700%Swiss-Prot低置信
Q9SLG0拟南芥sp|Q9SLG0|NFYB1_ARATH Nuclear transcription factor Y subunit B-171.700%Swiss-Prot低置信
Q60EQ4水稻sp|Q60EQ4|NFYB3_ORYSJ Nuclear transcription factor Y subunit B-372.600%Swiss-Prot低置信

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