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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G000700
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 175464-183309 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6859 bp · TkA04G000700|TK1151|cDNA

AAAAAGTTCATGGGTAAATGGAGCACAAAAAAAAGTTTAAGGACTGAACGAGTCAAAAAATGAAAATTAGTTACCTATTCAAGTCATTAACCCTTATTTATACTTAAAAAAATGTTGGTTTTTTAATGCTAAATGGTAGCACATAAAGAGAGGAGAGATGCTAATCGATTATCGATCCTGATCCCAAACCCAAGGGAGAAGATCATATGAAGCTTTGACCAGCATCCAGCCCAGCCGTGATCTTCAAGGAAATCTTTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3804 bp · TkA04G000700|TK1151|CDS

ATGAACGCCGGTGGTAAAGAGAAGGAAGAGCCCTCCACCTCCGGTGATGGCGAGCAAGACTCCCGATCGGAGAAGAAAAAAGAAAAAGGGAGCGGGAGCCCCCCGAATAATACTGTCCCATTCTACAAGCTCTTTGCTTTTGCTGATTCCACCGACTACATGCTTATGATTGCTGGTACGATCGGTGCCATCGGTAACGGAGCTTGCATGCCCCTCATGACTATTCTTTTCGGCGACCTTATTGATTCTTTTGGCGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1267 aa · TkA04G000700|TK1151|PROTEIN

MNAGGKEKEEPSTSGDGEQDSRSEKKKEKGSGSPPNNTVPFYKLFAFADSTDYMLMIAGTIGAIGNGACMPLMTILFGDLIDSFGENQNNNDVVSVVSKVSLKFVYLAVGAGLAAFFQVSMWMVTGERQAARIRNLYLKTILRQDVSFFDKETNTGEVVGRMSGDTVLIQDAMGEKVGKFTQLLATFVGGFVIAFVKGWLLTLVMLTSIPPLVISGGMMSLLISKMASQGQAAYAKAANVVEQTIGSIRTVASFTGEKKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G000700
TK1151 IDTkA04G000700
OH-1004 IDLXL04_006274
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)46.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.606 / OH-1004 94.235
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G000700
位置Chr04:175464-183309 (-)
描述Similar to ABCB19: ABC transporter B family member 19
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g02520 参与雌蕊伸长所需的生长素运输的调节。
Loss of Multiple ABCB Auxin Transporters Recapitulates the Major twisted dwarf 1 Phenotypes in Arabidopsis thaliana .2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.840260
At2g47000 生长素流入转运蛋白，介导根部生长素的转运。
PGP4, an ATP binding cassette P-glycoprotein, catalyzes auxin transport in Arabidopsis thaliana roots.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.035816
At1g02530 ABC转运蛋白B家族成员12。 暂无已核实直接文献
At3g62150 ABC 转运蛋白 B 家族成员 21。 暂无已核实直接文献
At4g01820 ABC转运蛋白B家族成员3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006274 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009926 auxin polar transport 生物过程
GO:0009958 positive gravitropism 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10680
ath:AT1G27940
ath:AT2G36910
ath:AT3G28860
ath:AT4G25960
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.745
排名 1 · TkA04G000700 · TK1151
细胞质0.114
排名 2 · TkA04G000700 · TK1151
溶酶体／液泡0.105
排名 3 · TkA04G000700 · TK1151
内质网0.072
排名 4 · TkA04G000700 · TK1151
高尔基体0.042
排名 5 · TkA04G000700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane56-330 aa
PF27946C1orf162191-208 aa
PF13604AAA_30230-260 aa
PF00005ABC_tran399-546 aa
PF12775AAA_7402-429 aa
PF09818ABC_ATPase403-429 aa
PF13481AAA_25403-424 aa
PF05783DLIC404-437 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G000700PF00664ABC_membrane563306.7e-125417.0
TkA04G000700PF27946C1orf1621912081.99.1
TkA04G000700PF13604AAA_302302604e-0627.4
TkA04G000700PF00005ABC_tran3995468e-69231.2
TkA04G000700PF12775AAA_74024290.005117.1
TkA04G000700PF09818ABC_ATPase4034299.4e-0935.4
TkA04G000700PF13481AAA_254034240.003417.8
TkA04G000700PF05783DLIC4044370.004516.6
TkA04G000700PF00158Sigma54_activat4044340.08113.3
TkA04G000700PF13555AAA_294064244.2e-0833.6
TkA04G000700PF03193RsgA_GTPase4074295.5e-0627.0
TkA04G000700PF01583APS_kinase4074300.01316.2
TkA04G000700PF13191AAA_164085592e-0732.4
TkA04G000700PF13479AAA_244084270.09613.1
TkA04G000700PF13604AAA_304095614e-0627.4
TkA04G000700PF20703nSTAND14094240.008816.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FWX7拟南芥sp|Q9FWX7|AB11B_ARATH ABC transporter B family member 1174.800%Swiss-Prot高置信
O80725拟南芥sp|O80725|AB4B_ARATH ABC transporter B family member 473.300%Swiss-Prot高置信
Q9FWX8拟南芥sp|Q9FWX8|AB12B_ARATH ABC transporter B family member 1272.900%Swiss-Prot高置信
Q9M1Q9拟南芥sp|Q9M1Q9|AB21B_ARATH ABC transporter B family member 2172.300%Swiss-Prot高置信
Q9SYI2拟南芥sp|Q9SYI2|AB3B_ARATH ABC transporter B family member 369.600%Swiss-Prot高置信

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