TkA03G557380 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G557380

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 141067277-141070921 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2590 bp · TkA03G557380|TK1151|cDNA

TTCGTAGGGGCCCGAAACATCAGTGAATGACTCGATCAACACAAGTTTAATCATCCCTCTTTCTCCCTCTTCAATCCCACACAATACTGCTCGCTTGAAAATTTTCAACAATTTCCACGTACATACCCAAGTAACACTCCAATCACACCACCCGAATGTTCCCCGAATCGATTTGCATGTATCATCAGTTGGAGGGAAAACGAGGTCGATTGATTCGTTGAATCGAAGCGGTTTTTCGTAAATCGCTGATGGAAAGGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1302 bp · TkA03G557380|TK1151|CDS

ATGGAAAGGGAACCGCTTCTTCCATCCCATTCGAAATACATAAACACACCGTCGCAGCTCCGCCAATTAGCGATAGAAAATGAATACGCCATTCCCCCATCTCTTACTCCGTCGGAGTTCAAAGATATGCTCATATTTGGCTCCCCAAGAGGCGAACCATCTTCGCAAACGGTTGATGCCCTAAATCTACACCTGAATACTGATACCTCCAGTGATTCCCCAAAACTCTTTCCTTCCAGTTCCAATTCCAATATTTCCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

433 aa · TkA03G557380|TK1151|PROTEIN

MEREPLLPSHSKYINTPSQLRQLAIENEYAIPPSLTPSEFKDMLIFGSPRGEPSSQTVDALNLHLNTDTSSDSPKLFPSSSNSNISNPIPVVINPDLQIQITPSRPPDVIYPIKKYLHRSKTAPAICNINELGQNTKNNPPQLASPSIVRQSVVLLIVYLLCGVFIYWYNRKHFIGKETYVVVDALYFCIVTMCTIGYGDILPNSPVTKMFSIMFVLVGFGFIDILLSGMVSYVLDIQENYLLRSLSNGKRRDHPSYMID...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G557380`
TK1151 ID	TkA03G557380
OH-1004 ID	LXL04_010947
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G557380

位置 Chr03:141067277-141070921 (-)

描述 Similar to TPK3: Two-pore potassium channel 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g18160`	双孔钾通道调节质子动力势（pmf），这是将光化学能转化为生理功能所必需的。	暂无已核实直接文献
`At5g46370`	可能的电压非依赖性钾选择性液泡膜离子通道。	暂无已核实直接文献
`At4g01840`	可能的电压非依赖性钾选择性液泡膜离子通道。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0299400`	内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献
`Os03g0752300`	高选择性内向整流钾通道，专门位于大液泡的液泡膜中。	Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010947 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程

GO:0010196 nonphotochemical quenching 生物过程

GO:0071257 cellular response to electrical stimulus 生物过程

GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程

GO:0097623 potassium ion export across plasma membrane 生物过程

GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009533 chloroplast stromal thylakoid 细胞组分

GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G02510

ath:AT4G01840

ath:AT4G18160

ath:AT5G46370

dosa:Os09g0299400

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.376

排名 1 · TkA03G557380 · TK1151

细胞膜0.290

排名 2 · TkA03G557380 · TK1151

细胞质0.134

排名 3 · TkA03G557380 · TK1151

内质网0.127

排名 4 · TkA03G557380 · TK1151

高尔基体0.113

排名 5 · TkA03G557380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13405EF-hand_635-44 aa

PF00036EF-hand_135-44 aa

PF13202EF-hand_535-43 aa

PF00520Ion_trans153-235 aa

PF07885Ion_trans_2155-234 aa

PF07885Ion_trans_2279-348 aa

PF00520Ion_trans299-337 aa

PF05412Peptidase_C33328-392 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G557380	`PF13405`	EF-hand_6	35	44	1.6e-05	25.0
TkA03G557380	`PF00036`	EF-hand_1	35	44	1.9e-05	24.6
TkA03G557380	`PF13202`	EF-hand_5	35	43	0.0003	20.9
TkA03G557380	`PF00520`	Ion_trans	153	235	2.6e-05	24.3
TkA03G557380	`PF07885`	Ion_trans_2	155	234	1.2e-26	93.0
TkA03G557380	`PF07885`	Ion_trans_2	279	348	1.2e-26	93.0
TkA03G557380	`PF00520`	Ion_trans	299	337	2.6e-05	24.3
TkA03G557380	`PF05412`	Peptidase_C33	328	392	0.012	16.4
TkA03G557380	`PF13202`	EF-hand_5	370	388	0.0003	20.9
TkA03G557380	`PF13405`	EF-hand_6	372	387	1.6e-05	25.0
TkA03G557380	`PF00036`	EF-hand_1	372	389	1.9e-05	24.6
TkA03G557380	`PF13499`	EF-hand_7	372	428	2.7e-05	25.1
TkA03G557380	`PF13833`	EF-hand_8	372	389	0.0031	17.9
TkA03G557380	`PF00036`	EF-hand_1	406	428	1.9e-05	24.6
TkA03G557380	`PF13833`	EF-hand_8	406	428	0.0031	17.9
TkA03G557380	`PF13405`	EF-hand_6	407	429	1.6e-05	25.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SVV6`	拟南芥	sp\|Q9SVV6\|KCO6_ARATH Two-pore potassium channel 3	58.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FL25`	拟南芥	sp\|Q9FL25\|KCO2_ARATH Two-pore potassium channel 2	52.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9S6Z8`	拟南芥	sp\|Q9S6Z8\|KCO5_ARATH Two-pore potassium channel 5	53.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q69TN4`	水稻	sp\|Q69TN4\|KCO3_ORYSJ Two pore potassium channel c	58.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q850M0`	水稻	sp\|Q850M0\|KCO1_ORYSJ Two pore potassium channel a	35.800%	Swiss-Prot	中等置信

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