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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G498010
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 124952010-124956136 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2151 bp · TkA03G498010|TK1151|cDNA

TTTCAATTCAACTAATACCTGACTCTCTGAATTAATCACCCAAAATGGTGCCCATCATTCTATCGCTCTTACTTTTCCTCGTGCCTTATGCTTTTGGAGGAGAATATTCATCCGTCAAGTGCATCTCCAATAAAACCATCTACACTCAAAACACTACTTACCATCTTAACCTTAATGAACTCCTGTCTTCCTTTTCCACTGAAGAAGTAGTAATCACCGATCTTTTTTCTCACAAAACCGCCGGCAGCCCTCCAGATGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1968 bp · TkA03G498010|TK1151|CDS

ATGGTGCCCATCATTCTATCGCTCTTACTTTTCCTCGTGCCTTATGCTTTTGGAGGAGAATATTCATCCGTCAAGTGCATCTCCAATAAAACCATCTACACTCAAAACACTACTTACCATCTTAACCTTAATGAACTCCTGTCTTCCTTTTCCACTGAAGAAGTAGTAATCACCGATCTTTTTTCTCACAAAACCGCCGGCAGCCCTCCAGATGCCGCATACGGGCTCTATCTTTGTCGTGCGGATAAACTCCCAAATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

655 aa · TkA03G498010|TK1151|PROTEIN

MVPIILSLLLFLVPYAFGGEYSSVKCISNKTIYTQNTTYHLNLNELLSSFSTEEVVITDLFSHKTAGSPPDAAYGLYLCRADKLPNDCRNCLITAGREITKQCPNTKQAIRWSDDCMLRYSDTHFFYKIEKSPVDYVCNKGNVSKLEVEKDDFEKLVADMMDELIIQASNHSKKYAYKSAVFNETEKVFGLLQCTQDLSGFDCDQCLRSEVNRLVNELCGGKLGGRISTPSCNLRYEIYEFYKFPSSDDELKVPSSLTKG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G498010
TK1151 IDTkA03G498010
OH-1004 IDLXL04_010097
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G498010
位置Chr03:124952010-124956136 (-)
描述Similar to CRK25: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 25
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23160 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶8。 暂无已核实直接文献
At4g23280 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶20。 暂无已核实直接文献
At4g05200 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶25。 暂无已核实直接文献
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g23130 参与多种不同的防御反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010097 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0080136 priming of cellular response to stress 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45860
ath:AT4G05200
ath:AT4G23130
ath:AT4G23180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.876
排名 1 · TkA03G498010 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA03G498010 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA03G498010 · TK1151
细胞核0.038
排名 4 · TkA03G498010 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA03G498010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung25-122 aa
PF1133030K_MP_C_Ter107-153 aa
PF24726DUF7678122-154 aa
PF01657Stress-antifung138-238 aa
PF00069Pkinase333-601 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr335-604 aa
PF03109ABC1337-365 aa
PF03109ABC1400-481 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G498010PF01657Stress-antifung251229.7e-36123.1
TkA03G498010PF1133030K_MP_C_Ter1071530.1811.5
TkA03G498010PF24726DUF76781221540.2711.9
TkA03G498010PF01657Stress-antifung1382389.7e-36123.1
TkA03G498010PF00069Pkinase3336012.3e-44152.5
TkA03G498010PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3356047e-51173.7
TkA03G498010PF03109ABC13373650.000420.3
TkA03G498010PF03109ABC14004810.000420.3
TkA03G498010PF12330Haspin_kinase4284830.01315.3
TkA03G498010PF01636APH4474810.113.0
TkA03G498010PF11883DUF34036096550.005117.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65468拟南芥sp|O65468|CRK8_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 846.800%Swiss-Prot中等置信
O65479拟南芥sp|O65479|CRK20_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 2046.500%Swiss-Prot中等置信
Q9M0X5拟南芥sp|Q9M0X5|CRK25_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 2545.200%Swiss-Prot中等置信
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1046.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C5S8拟南芥sp|Q9C5S8|CRK5_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 547.300%Swiss-Prot中等置信

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