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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G495340
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 124347534-124348659 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

735 bp · TkA03G495340|TK1151|cDNA

ATGGGCCCCACCCTCAAATGGATTCAACGTCTTAAGATATGTGTTGGGGTTGCATGTGGCTTGCACTACCTTCATGATCCCAAAGTTCCAGATTTTGGCCTACAAGGCATCAACCATTGTTATATCGAAAGTGGCAAAATTTTGTTAGACGCGAATTGGAATGCCAAAATTGCTGATTTTGGTCTACCCGGACATGACACAATGGATGTTTCGAAAGGTGAAGGTACTCTTGGCTATTGTGATCCAACAGGTTATAAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

735 bp · TkA03G495340|TK1151|CDS

ATGGGCCCCACCCTCAAATGGATTCAACGTCTTAAGATATGTGTTGGGGTTGCATGTGGCTTGCACTACCTTCATGATCCCAAAGTTCCAGATTTTGGCCTACAAGGCATCAACCATTGTTATATCGAAAGTGGCAAAATTTTGTTAGACGCGAATTGGAATGCCAAAATTGCTGATTTTGGTCTACCCGGACATGACACAATGGATGTTTCGAAAGGTGAAGGTACTCTTGGCTATTGTGATCCAACAGGTTATAAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

244 aa · TkA03G495340|TK1151|PROTEIN

MGPTLKWIQRLKICVGVACGLHYLHDPKVPDFGLQGINHCYIESGKILLDANWNAKIADFGLPGHDTMDVSKGEGTLGYCDPTGYKRLILTEESDVYSFGVILFEVLCSRPCVDWNYTDERRSLPILVKKRNQEQMPHSIIDVNLWQQMDQECFDTFVKLALQCLEKERKKRPTMVSVIRRLKFALILQEIFELNEEERRSSFSPNQVLLDTKSQETESSSSLEFRTGSFNALRFQRRTTEDVG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G495340
TK1151 IDTkA03G495340
OH-1004 IDLXL04_010074
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.623 / OH-1004 31.921
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G495340
位置Chr03:124347534-124348659 (+)
描述Similar to HERK1: Receptor-like protein kinase HERK 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24010 可能的受体样蛋白激酶 At5g24010。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At2g39360 可能的受体样蛋白激酶 At2g39360。 暂无已核实直接文献
At1g24030 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g66880 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 1.4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010074 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
ath:AT5G59700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.487
排名 1 · TkA03G495340 · TK1151
细胞膜0.354
排名 2 · TkA03G495340 · TK1151
细胞核0.295
排名 3 · TkA03G495340 · TK1151
内质网0.044
排名 4 · TkA03G495340 · TK1151
高尔基体0.041
排名 5 · TkA03G495340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5-182 aa
PF00069Pkinase12-179 aa
PF06558SecM136-148 aa
PF06558SecM177-212 aa
PF12944HAV_VP202-243 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G495340PF07714PK_Tyr_Ser-Thr51829.2e-1761.9
TkA03G495340PF00069Pkinase121793.2e-1557.0
TkA03G495340PF06558SecM1361480.0813.6
TkA03G495340PF06558SecM1772120.0813.6
TkA03G495340PF12944HAV_VP2022430.1912.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLW0拟南芥sp|Q9FLW0|Y5241_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g2401042.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 141.500%Swiss-Prot中等置信
O80623拟南芥sp|O80623|Y2393_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g3936039.600%Swiss-Prot中等置信
Q84M95拟南芥sp|Q84M95|PBL28_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2835.400%Swiss-Prot中等置信
F4HQ17拟南芥sp|F4HQ17|LRL14_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.435.200%Swiss-Prot中等置信

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