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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G495230
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 124320083-124320866 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

690 bp · TkA03G495230|TK1151|cDNA

TCAAAACGCCAAATCGTTGAATGCGCTGTTGTTTTCCTGTATGCTGGCAAAGAAATACGACGAGGCTCATCAAGTTCATGCTACTCAGTAACAGCCGAAATGATGAGAAAGAAATGCAAGCCAAATGCAACCACATTCGGCACAATGATCGCTGGATTCTACAAAGAAGAAAAGTTTGAAGACGTCGGGAAAGTTCTCGAAATGATGAAGAAACATGAAGTTCCCATAACCCTCGGAATCTACAACACCAGGATTCAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

690 bp · TkA03G495230|TK1151|CDS

TCAAAACGCCAAATCGTTGAATGCGCTGTTGTTTTCCTGTATGCTGGCAAAGAAATACGACGAGGCTCATCAAGTTCATGCTACTCAGTAACAGCCGAAATGATGAGAAAGAAATGCAAGCCAAATGCAACCACATTCGGCACAATGATCGCTGGATTCTACAAAGAAGAAAAGTTTGAAGACGTCGGGAAAGTTCTCGAAATGATGAAGAAACATGAAGTTCCCATAACCCTCGGAATCTACAACACCAGGATTCAGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

229 aa · TkA03G495230|TK1151|PROTEIN

SKRQIVECAVVFLYAGKEIRRGSSSSCYSVTAEMMRKKCKPNATTFGTMIAGFYKEEKFEDVGKVLEMMKKHEVPITLGIYNTRIQSLCKLKRTMEAKALLDGLLSRNMKPNSITYNHLIHGYCREGKLAEAKELFQKMINGGFKPESDCYFTLVHYLCKGGDFKAALEVCKKSMEKDWFPNFSTMKLLVEGLANSDKGDVAKEIIGQMKEKFPKNSDMWNEVEEKLPK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G495230
TK1151 IDTkA03G495230
OH-1004 IDLXL04_010071
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 23.144 / OH-1004 12.990
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G495230
位置Chr03:124320083-124320866 (+)
描述Similar to PPR336: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g61870, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11630 含五重复肽重复蛋白 At1g11630，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010071 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006396 RNA processing 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005840 ribosome 细胞组分
GO:1990904 ribonucleoprotein complex 细胞组分
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11630
ath:AT1G55890
ath:AT1G61870
ath:AT3G13160
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.887
排名 1 · TkA03G495230 · TK1151
细胞核0.063
排名 2 · TkA03G495230 · TK1151
细胞质0.055
排名 3 · TkA03G495230 · TK1151
质体0.050
排名 4 · TkA03G495230 · TK1151
细胞膜0.019
排名 5 · TkA03G495230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29819TP_0747_C8-23 aa
PF10602RPN718-55 aa
PF13041PPR_221-55 aa
PF01535PPR21-39 aa
PF17177PPR_long24-77 aa
PF29070MSC6_N29-67 aa
PF13812PPR_330-83 aa
PF23276TPR_2431-139 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G495230PF29819TP_0747_C8230.03614.7
TkA03G495230PF10602RPN718550.06513.6
TkA03G495230PF13041PPR_221556.9e-29100.4
TkA03G495230PF01535PPR21398.7e-2482.8
TkA03G495230PF17177PPR_long24771.5e-0731.7
TkA03G495230PF29070MSC6_N29676.8e-1039.3
TkA03G495230PF13812PPR_330833.3e-1763.0
TkA03G495230PF23276TPR_24311394.4e-0730.6
TkA03G495230PF12854PPR_138692.8e-2898.1
TkA03G495230PF13041PPR_245756.9e-29100.4
TkA03G495230PF01535PPR45728.7e-2482.8
TkA03G495230PF24760TPR_IF140_C45700.002618.9
TkA03G495230PF29819TP_0747_C47960.03614.7
TkA03G495230PF29070MSC6_N581016.8e-1039.3
TkA03G495230PF12569NatA_aux_su582211.1e-0628.7
TkA03G495230PF08579RPM2641610.03115.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SAB4拟南芥sp|Q9SAB4|PPR33_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11630, mitochondrial53.600%Swiss-Prot高置信

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