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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G485280
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 121418931-121422575 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3032 bp · TkA03G485280|TK1151|cDNA

CTTGAAGACGAGGCCCAGTCACTTTTTTATTACCTCAAGCATCACTTTCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTCACAGGTATCATCAGCATGCTATGAACAAGAGAAATTGCTCCTTCCTTTTTGCCGATAGGTTAAAGCATTGAAGTTGTGGACCTGATTCTTTCAGCTTTAGGATTTAACTCGATTTTTTTTCAAACTTGTTGAGGATCGAGTTGCATGATCAACCTTCGACCTTCTTACGTTTTCACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1629 bp · TkA03G485280|TK1151|CDS

ATGGCCTCAAAAACTCGTGCTATGCCACCATCTTTGGATCAAATCACCACAAAGCATGTCCTAGGAAATGATTTGGAAGCTAAACTAGCTTCCAAGCTATTAATTACTCCCCCAGAAACTCCTAAGGTCCCAGATGTTTCCATTGATCATGAAAAGAAAGCAGCTGAGAAAGGAAGTGTGAAGAACAGCTCGGTTTCAGATAAAACAAGTGATGGAACCAGCAGCTTGGGGAAAACAAGTGGGAGTGCACTTGTGGAGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

542 aa · TkA03G485280|TK1151|PROTEIN

MASKTRAMPPSLDQITTKHVLGNDLEAKLASKLLITPPETPKVPDVSIDHEKKAAEKGSVKNSSVSDKTSDGTSSLGKTSGSALVESGKSSMCRGSTSSNVSDESSCSSFSSSINKPHKSNDSRWEAIQVVRARDGALGLTHFRLLKRLGCGDIGSVYLAELTGTKAYFAMKVMDKASLASRKKLLRAQTEREILQSLDHPFLPSLYTHFETDKFSCLVMEFCPGGDLHTLRQRQPGKHFTEQAVKFYVAEVLLAMEYLH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G485280
TK1151 IDTkA03G485280
OH-1004 IDLXL04_009954
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G485280
位置Chr03:121418931-121422575 (+)
描述Similar to D6PKL2: Serine/threonine-protein kinase D6PKL2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47750 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节 PIN 生长素外排促进剂的生长素转运活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
At5g55910 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
The polarly localized D6 PROTEIN KINASE is required for efficient auxin transport in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1242/dev.028365
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
Arabidopsis D6PK is a lipid domain-dependent mediator of root epidermal planar polarity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.162
At4g26610 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0291600 可能在代谢调节和信号转导过程中发挥作用。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YBX5 可能在代谢调节和信号转导过程中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009954 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程
GO:0048766 root hair initiation 生物过程
GO:2000114 regulation of establishment of cell polarity 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009925 basal plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G26610
ath:AT5G47750
ath:AT5G55910
dosa:Os06g0291600
osa:4340792
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.616
排名 1 · TkA03G485280 · TK1151
细胞核0.350
排名 2 · TkA03G485280 · TK1151
细胞膜0.140
排名 3 · TkA03G485280 · TK1151
线粒体0.056
排名 4 · TkA03G485280 · TK1151
高尔基体0.048
排名 5 · TkA03G485280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase61-121 aa
PF01500Keratin_B279-110 aa
PF13885Keratin_B2_290-109 aa
PF00069Pkinase144-295 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr144-295 aa
PF03109ABC1147-174 aa
PF03109ABC1203-290 aa
PF06293Kdo227-290 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G485280PF12330Haspin_kinase611210.959.1
TkA03G485280PF01500Keratin_B2791100.710.5
TkA03G485280PF13885Keratin_B2_2901090.02415.2
TkA03G485280PF00069Pkinase1442958.3e-60203.1
TkA03G485280PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1442951.2e-29104.2
TkA03G485280PF03109ABC11471740.0001122.1
TkA03G485280PF03109ABC12032900.0001122.1
TkA03G485280PF06293Kdo2272900.1312.4
TkA03G485280PF14531Kinase-like2562880.2411.3
TkA03G485280PF12330Haspin_kinase2652990.959.1
TkA03G485280PF01500Keratin_B23163400.710.5
TkA03G485280PF13885Keratin_B2_23173390.02415.2
TkA03G485280PF01342SAND3273730.07813.4
TkA03G485280PF12330Haspin_kinase3403650.959.1
TkA03G485280PF00069Pkinase3794828.3e-60203.1
TkA03G485280PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3864701.2e-29104.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39183拟南芥sp|Q39183|D6KL2_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL281.100%Swiss-Prot高置信
Q9FG74拟南芥sp|Q9FG74|D6PK_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PK77.600%Swiss-Prot高置信
Q9SUA3拟南芥sp|Q9SUA3|D6KL1_ARATH Serine/threonine-protein kinase D6PKL177.500%Swiss-Prot高置信
Q0DCT8水稻sp|Q0DCT8|G11A_ORYSJ Protein kinase G11A78.200%Swiss-Prot高置信
A2YBX5水稻sp|A2YBX5|G11A_ORYSI Protein kinase G11A78.200%Swiss-Prot高置信

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